MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	AAT	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017233	TAA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017233	TAT	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017233	GTC	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017233	TAT	2	6	322	327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017233	TTA	2	6	389	394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017233	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017233	ATT	2	6	1482	1487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017233	AGG	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017233	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017233	GTC	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017233	CCA	2	6	2326	2331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017233	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017233	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017233	AAC	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017233	TGG	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017233	ATA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017233	ATT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017233	AAT	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017233	ATA	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017233	ATT	2	6	3053	3058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017233	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017233	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017233	ATA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017233	TAA	2	6	4196	4201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017233	ACT	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017233	ATT	3	9	4394	4402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017233	TTA	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017233	TAA	2	6	4527	4532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017233	ATT	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017233	CTT	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017233	TTA	2	6	5777	5782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017233	CTT	3	9	5993	6001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017233	ATT	2	6	6066	6071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017233	ATT	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017233	CAA	2	6	6129	6134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017233	AGT	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017233	ATT	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017233	AAT	2	6	6185	6190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017233	TAC	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017233	ATT	2	6	6249	6254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017233	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017233	TTA	2	6	6307	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017233	AGT	2	6	6472	6477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017233	TAA	2	6	7498	7503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017233	AAG	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017233	GAT	2	6	7557	7562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017233	TGG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017233	ATT	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017233	TAC	2	6	7723	7728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017233	TTA	2	6	7738	7743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017233	ATT	2	6	7763	7768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017233	AAT	2	6	7861	7866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017233	ATC	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017233	CAT	2	6	7984	7989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017233	TCA	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017233	TAA	3	9	8058	8066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017233	ATA	2	6	11997	12002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017233	CAA	2	6	12597	12602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017233	AAT	2	6	12622	12627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017233	TAA	2	6	12660	12665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017233	GTT	2	6	12729	12734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017233	TTA	2	6	12788	12793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017233	ATA	2	6	12806	12811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017233	TAA	2	6	12823	12828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017233	TAG	2	6	13044	13049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017233	TTA	3	9	13101	13109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017233	TAA	2	6	13294	13299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017233	TAA	2	6	13309	13314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017233	TAT	2	6	16290	16295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017233	AGT	2	6	16332	16337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017233	ACT	2	6	16387	16392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017233	TAA	2	6	16419	16424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017233	CAA	2	6	16864	16869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017233	GAA	2	6	16929	16934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017233	ATA	2	6	17144	17149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017233	TTA	2	6	17166	17171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017233	ATA	2	6	17188	17193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017233	ATT	2	6	17197	17202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017233	AAT	2	6	17286	17291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017233	TAA	2	6	17360	17365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017233	TTG	2	6	17369	17374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017233	ATT	2	6	17432	17437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017233	AAC	2	6	17453	17458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017233	ACA	2	6	17467	17472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017233	TAT	2	6	17884	17889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017233	TAG	2	6	17898	17903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017233	ATT	2	6	17966	17971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017233	ATA	2	6	18088	18093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017233	TTA	2	6	18112	18117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017233	TAG	2	6	18139	18144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017233	TAA	2	6	18224	18229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017233	TAT	3	9	18243	18251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017233	TAA	2	6	19273	19278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017233	ATT	3	9	19311	19319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017233	ATT	2	6	19321	19326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017233	TAA	2	6	19384	19389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017233	TTG	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017233	ATA	3	9	19402	19410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017233	TAT	2	6	19415	19420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017233	GAT	2	6	19463	19468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017233	GAA	2	6	19511	19516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017233	TAA	2	6	19518	19523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017233	AAG	2	6	19630	19635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017233	TAT	2	6	19688	19693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017233	ATT	2	6	19713	19718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017233	ATT	2	6	19800	19805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017233	GTT	2	6	20877	20882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017233	TAT	2	6	20940	20945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017233	TAA	3	9	20947	20955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017233	AAT	3	9	21000	21008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017233	ACA	2	6	21024	21029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017233	AAT	2	6	21072	21077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017233	GTT	2	6	21175	21180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017233	TAA	2	6	21322	21327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017233	TAT	2	6	21328	21333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017233	CAT	2	6	21424	21429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017233	TAA	2	6	21448	21453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017233	AAC	2	6	21466	21471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017233	GTT	2	6	21490	21495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017233	TAA	2	6	22566	22571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017233	AAT	2	6	22584	22589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017233	AAT	2	6	22618	22623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017233	AAT	2	6	22635	22640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017233	AAT	2	6	22652	22657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017233	ATT	2	6	22687	22692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017233	ATT	2	6	22729	22734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017233	TTC	2	6	22737	22742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017233	TAT	2	6	22780	22785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.