MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-3

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017226	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017226	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017226	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017226	AGG	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017226	AGG	2	6	3942	3947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017226	T	6	6	15165	15170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017226	TA	3	6	15191	15196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017226	TA	3	6	15200	15205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017226	TAA	2	6	15402	15407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017226	A	6	6	15415	15420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017226	GTT	2	6	16465	16470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017226	CTAA	2	8	16511	16518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017226	ATA	2	6	16527	16532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017226	AAC	2	6	17291	17296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017226	T	6	6	17338	17343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017226	A	7	7	17370	17376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017226	CAA	2	6	18286	18291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017226	TTA	2	6	19348	19353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017226	GAT	2	6	19366	19371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017226	CTC	2	6	19372	19377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017226	TA	3	6	19398	19403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017226	T	6	6	19425	19430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017226	A	9	9	19445	19453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017226	TTACA	2	10	19500	19509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017226	T	6	6	19510	19515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017226	ATAA	2	8	19525	19532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017226	AGGT	2	8	19533	19540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017226	ATTT	2	8	19603	19610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017226	A	6	6	19623	19628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017226	TAAT	2	8	19635	19642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017226	TAA	2	6	19648	19653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017226	T	7	7	19667	19673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017226	TAT	2	6	19721	19726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017226	ATAA	2	8	19732	19739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017226	TA	3	6	23251	23256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017226	T	6	6	23262	23267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017226	TTTA	2	8	23286	23293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017226	ATTTT	2	10	23311	23320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017226	T	7	7	23380	23386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017226	TTG	2	6	23432	23437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017226	T	7	7	23440	23446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017226	A	9	9	23447	23455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017226	AT	4	8	23482	23489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017226	AGTG	2	8	23531	23538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017226	TAG	2	6	23555	23560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017226	T	8	8	23581	23588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017226	T	6	6	23594	23599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017226	TAATA	2	10	23628	23637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017226	ATA	2	6	23646	23651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017226	AT	3	6	23667	23672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017226	TGG	2	6	23691	23696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017226	T	6	6	23739	23744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017226	A	6	6	23770	23775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017226	TA	4	8	23790	23797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017226	AT	3	6	23801	23806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017226	A	8	8	23810	23817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017226	TAT	2	6	23823	23828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017226	T	7	7	23892	23898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017226	A	6	6	23901	23906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017226	A	6	6	23914	23919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017226	TA	3	6	23941	23946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017226	ATT	2	6	23947	23952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017226	AGG	2	6	23968	23973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017226	ACAA	2	8	23986	23993	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017226	A	6	6	25335	25340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017226	A	8	8	25343	25350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017226	AAGTAA	2	12	26617	26628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017226	AT	3	6	26634	26639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017226	TGCA	2	8	26703	26710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017226	CA	3	6	26766	26771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017226	ATACT	2	10	26778	26787	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017226	TG	3	6	26789	26794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017226	AT	3	6	26795	26800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017226	ATTTG	2	10	26816	26825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017226	CAT	2	6	26856	26861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017226	GA	3	6	26870	26875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017226	ATTA	2	8	26939	26946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017226	A	6	6	26958	26963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017226	TTA	2	6	26970	26975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017226	TTA	3	9	26985	26993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017226	ATAA	2	8	28170	28177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017226	ATT	3	9	28178	28186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017226	A	6	6	28232	28237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017226	TTA	2	6	28247	28252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017226	TTTA	2	8	28261	28268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017226	TCC	2	6	28338	28343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017226	AT	4	8	28361	28368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017226	TAA	2	6	28392	28397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017226	GTT	2	6	28408	28413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017226	AGC	2	6	29056	29061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017226	AATA	2	8	29082	29089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017226	AATA	2	8	29102	29109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017226	AAG	2	6	29112	29117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017226	TAA	2	6	29132	29137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017226	ATT	2	6	29138	29143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.