MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 3213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017223	GC	3	6	5183	5188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017223	GC	3	6	5275	5280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017223	GC	3	6	5352	5357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017223	GC	3	6	5927	5932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017223	CG	3	6	6093	6098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017223	GC	3	6	6376	6381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017223	GC	3	6	20037	20042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017223	CG	3	6	22181	22186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017223	CG	5	10	22418	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017223	CG	3	6	22507	22512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017223	CG	3	6	22651	22656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017223	GC	3	6	22776	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017223	GC	3	6	22913	22918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017223	CG	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017223	CG	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017223	GC	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017223	CG	4	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017223	GC	3	6	24295	24300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017223	TC	3	6	25465	25470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017223	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017223	CG	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017223	CG	3	6	26280	26285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017223	GC	3	6	30892	30897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017223	TC	3	6	30971	30976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017223	GC	3	6	32128	32133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017223	GA	3	6	33039	33044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017223	GC	3	6	36977	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017223	GC	3	6	43454	43459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017223	GC	3	6	43546	43551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017223	CG	3	6	44626	44631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017223	GC	3	6	44689	44694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017223	GC	3	6	44811	44816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017223	GC	3	6	44962	44967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017223	CG	4	8	44980	44987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017223	GC	3	6	47065	47070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017223	CG	3	6	47253	47258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017223	GC	3	6	47349	47354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017223	CG	4	8	47416	47423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017223	CG	3	6	47440	47445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017223	GC	3	6	47676	47681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017223	GC	3	6	47708	47713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017223	CG	3	6	47768	47773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017223	GC	3	6	47800	47805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017223	CG	3	6	47837	47842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017223	GC	4	8	47887	47894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017223	GC	3	6	51101	51106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017223	CG	5	10	52945	52954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017223	CG	3	6	54545	54550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017223	GC	3	6	54647	54652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017223	GC	3	6	54752	54757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017223	CG	3	6	58563	58568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017223	GC	3	6	59023	59028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017223	AG	3	6	64386	64391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017223	CA	3	6	66777	66782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017223	TC	3	6	67308	67313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017223	GC	3	6	70933	70938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017223	CG	3	6	73575	73580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017223	CG	3	6	78926	78931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017223	CG	3	6	79183	79188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017223	GC	3	6	79541	79546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017223	GC	3	6	82132	82137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017223	CG	3	6	82173	82178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017223	GC	3	6	84722	84727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017223	GC	3	6	84804	84809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017223	CG	3	6	98633	98638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017223	GC	3	6	103783	103788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017223	CG	3	6	104821	104826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017223	GC	4	8	108553	108560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017223	GC	3	6	108770	108775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017223	CG	3	6	108776	108781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017223	GC	4	8	108821	108828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017223	CG	3	6	114281	114286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017223	CG	3	6	114803	114808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017223	GC	3	6	119034	119039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017223	CG	3	6	122327	122332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017223	CG	3	6	122337	122342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017223	CG	3	6	122603	122608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017223	GC	5	10	122621	122630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017223	CG	3	6	122723	122728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017223	GC	3	6	122733	122738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017223	GC	4	8	123011	123018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017223	GC	5	10	123935	123944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017223	CG	3	6	124198	124203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017223	GC	3	6	124460	124465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017223	GC	3	6	125823	125828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017223	CG	3	6	125978	125983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017223	GC	4	8	126169	126176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017223	CG	4	8	126273	126280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017223	GC	3	6	126599	126604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017223	GC	3	6	126704	126709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017223	CG	4	8	126945	126952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017223	GC	3	6	130458	130463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017223	GC	3	6	130468	130473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017223	CG	3	6	134053	134058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017223	GC	4	8	134162	134169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017223	GC	3	6	134203	134208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017223	CG	3	6	134237	134242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017223	CG	3	6	134936	134941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017223	GC	4	8	134948	134955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017223	GC	4	8	135003	135010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017223	GC	3	6	135027	135032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017223	GC	3	6	138385	138390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017223	CG	6	12	138448	138459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017223	GC	3	6	138701	138706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017223	GC	3	6	138837	138842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017223	GT	3	6	146635	146640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017223	GC	3	6	146652	146657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017223	GC	3	6	146661	146666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017223	CG	3	6	146784	146789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017223	CG	3	6	147047	147052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017223	CG	3	6	147465	147470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017223	GC	3	6	147574	147579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017223	GT	3	6	147880	147885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017223	CG	3	6	150092	150097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017223	CG	4	8	150191	150198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017223	GC	3	6	150232	150237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017223	GC	4	8	150260	150267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017223	GC	3	6	150292	150297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017223	GC	3	6	155564	155569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017223	GC	3	6	165927	165932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017223	GC	3	6	166434	166439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017223	GC	3	6	166504	166509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017223	CG	5	10	166941	166950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017223	TC	3	6	169022	169027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017223	GC	3	6	171168	171173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017223	GC	3	6	174110	174115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017223	GC	4	8	175242	175249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017223	GC	4	8	175457	175464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017223	CG	3	6	175634	175639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017223	GC	3	6	175829	175834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017223	GC	3	6	176069	176074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017223	CG	3	6	176113	176118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017223	AT	4	8	176179	176186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017223	CG	3	6	176897	176902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017223	CG	3	6	180750	180755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017223	GC	3	6	189515	189520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017223	GC	3	6	189719	189724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017223	TG	3	6	189794	189799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017223	CG	3	6	189802	189807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017223	CG	3	6	189868	189873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017223	GC	3	6	190587	190592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017223	CG	3	6	195368	195373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017223	GC	3	6	197036	197041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017223	GA	3	6	197059	197064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017223	GC	3	6	197151	197156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017223	GA	3	6	197173	197178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017223	CG	3	6	197239	197244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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155	NC_017223	AG	3	6	209434	209439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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