MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 19444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017223	TCG	2	6	644279	644284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_017223	GCCGC	2	10	644348	644357	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3003	NC_017223	ACG	2	6	644381	644386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017223	CAT	2	6	644394	644399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_017223	GGC	2	6	644401	644406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017223	GGCA	2	8	644464	644471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_017223	GCCA	2	8	644483	644490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_017223	GCC	2	6	644491	644496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_017223	CCG	2	6	644501	644506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_017223	CCA	2	6	644560	644565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_017223	AGG	2	6	644598	644603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017223	CCG	2	6	645568	645573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_017223	CATTCA	2	12	645600	645611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_017223	CGC	2	6	646493	646498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_017223	GCG	2	6	646505	646510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_017223	TCC	2	6	647182	647187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_017223	GCC	2	6	648628	648633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_017223	ACC	2	6	652080	652085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_017223	GCCG	2	8	652128	652135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_017223	CGC	2	6	652140	652145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_017223	TCC	2	6	653364	653369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_017223	AG	3	6	653371	653376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017223	CGT	2	6	653392	653397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017223	GCG	2	6	653558	653563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017223	CAC	3	9	653624	653632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_017223	CGTC	2	8	653643	653650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_017223	CAG	2	6	653675	653680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_017223	CGT	2	6	653737	653742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017223	GC	3	6	653770	653775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_017223	GCA	2	6	653779	653784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_017223	GTG	2	6	653787	653792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017223	TCA	2	6	653812	653817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017223	CCTT	2	8	653844	653851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_017223	ACC	2	6	653871	653876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_017223	GC	3	6	653920	653925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_017223	GCT	2	6	653929	653934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017223	GC	3	6	653952	653957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_017223	GC	3	6	653974	653979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_017223	GCAC	2	8	654075	654082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_017223	CGG	2	6	654109	654114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_017223	GGC	2	6	654131	654136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_017223	GGC	2	6	654143	654148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017223	TCG	2	6	654192	654197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017223	GCC	2	6	654224	654229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_017223	GCG	3	9	654255	654263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017223	GGCG	2	8	654289	654296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_017223	GCC	2	6	654303	654308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_017223	GCG	2	6	654309	654314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_017223	GCG	2	6	654328	654333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_017223	GC	3	6	654336	654341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_017223	CGG	2	6	654346	654351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017223	GGC	2	6	654371	654376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017223	GC	3	6	654382	654387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_017223	CCA	2	6	654406	654411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_017223	CGC	2	6	654442	654447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_017223	GCA	2	6	654472	654477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017223	CGC	2	6	654499	654504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_017223	AAC	2	6	654531	654536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_017223	GCGCC	2	10	654550	654559	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3060	NC_017223	TGC	2	6	654568	654573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_017223	GGC	2	6	654574	654579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_017223	CAG	2	6	654587	654592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017223	GC	3	6	654633	654638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_017223	GAA	2	6	654650	654655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017223	TGGGA	2	10	654661	654670	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017223	GC	4	8	654705	654712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_017223	GCGCCG	2	12	654721	654732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_017223	CGC	2	6	654755	654760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_017223	GCG	2	6	654820	654825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_017223	GCC	2	6	654833	654838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_017223	GGT	2	6	656348	656353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017223	GGC	2	6	656385	656390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017223	CGCGT	2	10	656403	656412	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3074	NC_017223	GCA	2	6	657651	657656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_017223	GC	3	6	657684	657689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_017223	CGT	2	6	657696	657701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_017223	GGT	2	6	657708	657713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017223	CGG	2	6	657714	657719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_017223	CGC	2	6	657740	657745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_017223	TCG	2	6	657764	657769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017223	TGC	2	6	657789	657794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017223	GCG	2	6	657816	657821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_017223	TGA	2	6	657825	657830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017223	ATGT	2	8	657839	657846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017223	GC	3	6	657917	657922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_017223	CAG	2	6	657931	657936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_017223	GCG	2	6	657950	657955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017223	GTC	2	6	657958	657963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017223	GCA	2	6	657987	657992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017223	TCG	2	6	658064	658069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_017223	GCC	2	6	658097	658102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_017223	GC	5	10	658104	658113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_017223	CCG	2	6	658116	658121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_017223	GTC	2	6	658165	658170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_017223	GGTCC	2	10	658184	658193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3096	NC_017223	GC	3	6	658195	658200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_017223	CAC	2	6	658201	658206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_017223	CGG	2	6	658230	658235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017223	CCA	2	6	658302	658307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_017223	CGCC	2	8	658320	658327	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3101	NC_017223	GCCTG	2	10	661200	661209	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3102	NC_017223	TTAA	2	8	661261	661268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017223	ATA	2	6	661289	661294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017223	TCAA	2	8	661314	661321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_017223	GTGCCC	2	12	661378	661389	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_017223	A	8	8	661436	661443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017223	AGG	2	6	661461	661466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017223	CGC	2	6	662346	662351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_017223	CG	3	6	662358	662363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_017223	GGC	2	6	662476	662481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_017223	CG	3	6	662520	662525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_017223	GTA	2	6	662535	662540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017223	CG	3	6	662609	662614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_017223	CCG	3	9	662615	662623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_017223	GC	5	10	662655	662664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_017223	GCC	2	6	662687	662692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_017223	GCG	2	6	662753	662758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017223	CGCC	2	8	662790	662797	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3119	NC_017223	GCC	2	6	662801	662806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_017223	CG	3	6	662811	662816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_017223	CAG	2	6	662824	662829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017223	GCC	2	6	662852	662857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_017223	GCG	2	6	662873	662878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_017223	GCC	2	6	662894	662899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017223	CTC	2	6	662914	662919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_017223	CGC	2	6	662925	662930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_017223	GCG	2	6	662951	662956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_017223	GCA	2	6	662961	662966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_017223	CAGCGT	2	12	662992	663003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_017223	CGC	2	6	663023	663028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_017223	CAG	3	9	663034	663042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_017223	CAC	2	6	663166	663171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_017223	GCC	2	6	663172	663177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_017223	GCA	2	6	663192	663197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_017223	GGC	2	6	663202	663207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_017223	CCA	2	6	663219	663224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3137	NC_017223	GCG	2	6	663237	663242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3139	NC_017223	CGG	2	6	663294	663299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_017223	GCA	2	6	663312	663317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_017223	CGGC	2	8	663353	663360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3142	NC_017223	GC	4	8	663359	663366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3143	NC_017223	CGG	2	6	663370	663375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3225	NC_017223	GGTC	2	8	679278	679285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3233	NC_017223	TCTT	2	8	685794	685801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3234	NC_017223	CGTCCA	2	12	685828	685839	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3235	NC_017223	CCT	2	6	685850	685855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3249	NC_017223	ATGCC	2	10	690886	690895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3250	NC_017223	GCC	3	9	691018	691026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3251	NC_017223	ACC	2	6	691040	691045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3256	NC_017223	GCC	2	6	693214	693219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3257	NC_017223	CCG	2	6	696208	696213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3259	NC_017223	GC	3	6	696345	696350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_017223	AT	3	6	696405	696410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_017223	TAA	3	9	696423	696431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_017223	CCCG	2	8	696457	696464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3263	NC_017223	TCCG	2	8	696476	696483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3264	NC_017223	GACCGC	2	12	696484	696495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3265	NC_017223	GCG	2	6	696507	696512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3266	NC_017223	CCA	2	6	697474	697479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3267	NC_017223	ATC	2	6	697492	697497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3409	NC_017223	CGA	2	6	741167	741172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3451	NC_017223	CGGC	2	8	743411	743418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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