MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 19444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017223	GC	3	6	2300437	2300442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11502	NC_017223	CGG	2	6	2300445	2300450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_017223	GGC	2	6	2300459	2300464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_017223	CGGA	2	8	2300511	2300518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_017223	CAG	2	6	2300526	2300531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_017223	CG	3	6	2300534	2300539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11507	NC_017223	GGC	2	6	2300595	2300600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_017223	GCGCG	3	15	2300631	2300645	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11509	NC_017223	GCCA	2	8	2300647	2300654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11510	NC_017223	GCCG	2	8	2300661	2300668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11511	NC_017223	GCC	2	6	2300681	2300686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11512	NC_017223	GCC	3	9	2300738	2300746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11513	NC_017223	GCA	2	6	2300779	2300784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_017223	CCA	2	6	2300788	2300793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_017223	GGC	2	6	2300794	2300799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_017223	GCC	2	6	2300906	2300911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11517	NC_017223	CAG	2	6	2300957	2300962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_017223	CATGC	2	10	2300963	2300972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11519	NC_017223	CAG	2	6	2301005	2301010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_017223	CG	3	6	2301016	2301021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11521	NC_017223	GCT	2	6	2301052	2301057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_017223	GC	3	6	2301061	2301066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11523	NC_017223	CGG	2	6	2301082	2301087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_017223	CGG	3	9	2301106	2301114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_017223	GC	3	6	2301134	2301139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_017223	GC	3	6	2301153	2301158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11527	NC_017223	GC	3	6	2301160	2301165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_017223	AATTC	2	10	2301208	2301217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11529	NC_017223	CCCA	2	8	2301290	2301297	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11530	NC_017223	TTGC	2	8	2303614	2303621	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11531	NC_017223	CG	3	6	2303625	2303630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_017223	CGA	2	6	2303684	2303689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_017223	GC	3	6	2303711	2303716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_017223	A	6	6	2303745	2303750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_017223	CGG	2	6	2303788	2303793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_017223	TCGCG	2	10	2303799	2303808	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11537	NC_017223	GC	3	6	2303809	2303814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11538	NC_017223	GC	3	6	2305755	2305760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11539	NC_017223	TGG	2	6	2305770	2305775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_017223	GTG	2	6	2305793	2305798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_017223	GCG	2	6	2305962	2305967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_017223	GTA	2	6	2306036	2306041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_017223	TCG	2	6	2306085	2306090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_017223	ACGAAG	2	12	2306136	2306147	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11545	NC_017223	CTT	2	6	2306222	2306227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_017223	GCA	2	6	2306239	2306244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_017223	CAC	2	6	2306273	2306278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11548	NC_017223	CGGC	2	8	2306284	2306291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_017223	GCTG	2	8	2306345	2306352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11550	NC_017223	GC	3	6	2306375	2306380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_017223	GCG	2	6	2306396	2306401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_017223	AC	3	6	2306563	2306568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11553	NC_017223	CCGG	2	8	2306648	2306655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11554	NC_017223	G	7	7	2306672	2306678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_017223	CGGCTG	2	12	2306751	2306762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_017223	CCGG	2	8	2306780	2306787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_017223	CTG	2	6	2306808	2306813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_017223	GGC	2	6	2306814	2306819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_017223	TTC	2	6	2306826	2306831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_017223	CTG	2	6	2306832	2306837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_017223	CGG	2	6	2306850	2306855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_017223	GCC	2	6	2306890	2306895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_017223	CGG	2	6	2306901	2306906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_017223	CAG	2	6	2306929	2306934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_017223	CGGCGT	2	12	2306982	2306993	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_017223	GC	4	8	2307005	2307012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_017223	GCCG	2	8	2307069	2307076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_017223	AAG	2	6	2307088	2307093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_017223	GC	3	6	2307117	2307122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11570	NC_017223	CCA	2	6	2307123	2307128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11571	NC_017223	GCG	2	6	2307140	2307145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_017223	GCC	2	6	2307169	2307174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11573	NC_017223	GAT	2	6	2307235	2307240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_017223	CG	3	6	2307243	2307248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11575	NC_017223	GCCCA	2	10	2307260	2307269	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11576	NC_017223	GCA	2	6	2307270	2307275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_017223	CGC	2	6	2307297	2307302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11578	NC_017223	GCC	2	6	2307311	2307316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11579	NC_017223	CAG	2	6	2307319	2307324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_017223	GCG	3	9	2307334	2307342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_017223	GC	3	6	2307350	2307355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11582	NC_017223	GCCAG	2	10	2307369	2307378	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11583	NC_017223	CCA	2	6	2307381	2307386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11584	NC_017223	CCG	2	6	2307387	2307392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11585	NC_017223	GCC	2	6	2307421	2307426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11586	NC_017223	CAG	2	6	2307457	2307462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_017223	CGG	2	6	2307465	2307470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11588	NC_017223	CAC	2	6	2307475	2307480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_017223	GA	3	6	2307545	2307550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_017223	GC	3	6	2311275	2311280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11591	NC_017223	CGGC	2	8	2311313	2311320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11592	NC_017223	CCGG	2	8	2313569	2313576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11593	NC_017223	G	7	7	2313593	2313599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_017223	GC	3	6	2313675	2313680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11595	NC_017223	GGC	2	6	2313700	2313705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_017223	GGGC	2	8	2313714	2313721	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11597	NC_017223	TCCC	2	8	2313727	2313734	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11598	NC_017223	CG	3	6	2314854	2314859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11599	NC_017223	CAT	2	6	2314926	2314931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_017223	TCTTT	2	10	2314951	2314960	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11601	NC_017223	TGA	2	6	2314972	2314977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_017223	GCAA	2	8	2314995	2315002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11603	NC_017223	CAT	2	6	2315042	2315047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_017223	TGTGG	2	10	2315051	2315060	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_017223	TCG	2	6	2315065	2315070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_017223	ATTG	2	8	2315087	2315094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_017223	CGG	2	6	2315192	2315197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_017223	GTG	2	6	2315226	2315231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_017223	GCC	2	6	2315271	2315276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11610	NC_017223	GGT	2	6	2315297	2315302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_017223	GGC	2	6	2315309	2315314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_017223	CAG	2	6	2315342	2315347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_017223	GTGG	2	8	2315399	2315406	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_017223	TTC	2	6	2315421	2315426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_017223	TTC	2	6	2315475	2315480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_017223	CAA	2	6	2315519	2315524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_017223	GTG	2	6	2315594	2315599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_017223	CTT	2	6	2315621	2315626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_017223	ATG	2	6	2315648	2315653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_017223	GGCC	2	8	2315674	2315681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11621	NC_017223	GGCC	2	8	2315746	2315753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11622	NC_017223	CTG	2	6	2315762	2315767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_017223	CTG	2	6	2315822	2315827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_017223	GGC	2	6	2315840	2315845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_017223	CAT	2	6	2315857	2315862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_017223	CCGAT	2	10	2315895	2315904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11627	NC_017223	GAT	2	6	2315962	2315967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_017223	GC	3	6	2316033	2316038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11629	NC_017223	GAT	2	6	2316052	2316057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_017223	TAC	2	6	2316074	2316079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11631	NC_017223	GCC	2	6	2316099	2316104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11632	NC_017223	GC	3	6	2316121	2316126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11633	NC_017223	CCA	2	6	2316150	2316155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11634	NC_017223	GTG	2	6	2316161	2316166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11635	NC_017223	CGC	2	6	2316175	2316180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11639	NC_017223	CG	3	6	2316273	2316278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11640	NC_017223	TAC	2	6	2316284	2316289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11642	NC_017223	GCG	2	6	2316324	2316329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11644	NC_017223	CG	4	8	2316370	2316377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11645	NC_017223	CG	3	6	2316413	2316418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11646	NC_017223	CGG	2	6	2316438	2316443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11649	NC_017223	CGGC	2	8	2318275	2318282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11652	NC_017223	GCCC	2	8	2319876	2319883	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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11662	NC_017223	GC	3	6	2324639	2324644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11663	NC_017223	CGGC	2	8	2324661	2324668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11884	NC_017223	TG	3	6	2371174	2371179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11885	NC_017223	GC	3	6	2371363	2371368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11886	NC_017223	CAGC	2	8	2371391	2371398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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