MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 19444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017223	ACA	2	6	2224065	2224070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_017223	CTT	2	6	2224114	2224119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_017223	GGC	2	6	2224153	2224158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_017223	CGG	3	9	2224192	2224200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_017223	ACG	2	6	2224214	2224219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_017223	GGGCG	2	10	2224979	2224988	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11008	NC_017223	TAT	2	6	2224996	2225001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_017223	TCGCG	2	10	2225012	2225021	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11010	NC_017223	GCCGC	2	10	2225022	2225031	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11011	NC_017223	GC	3	6	2225030	2225035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11012	NC_017223	GCC	2	6	2225531	2225536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_017223	CCGC	2	8	2228412	2228419	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11014	NC_017223	GC	3	6	2229064	2229069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_017223	GC	3	6	2229071	2229076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11016	NC_017223	GCC	2	6	2229109	2229114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11017	NC_017223	GCC	3	9	2229136	2229144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_017223	CCG	2	6	2229168	2229173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11019	NC_017223	ATC	2	6	2229247	2229252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11021	NC_017223	TTC	2	6	2229286	2229291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_017223	TGC	2	6	2229299	2229304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_017223	CTG	2	6	2229361	2229366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_017223	GGCA	2	8	2229398	2229405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11025	NC_017223	GTC	2	6	2229418	2229423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_017223	GC	3	6	2229434	2229439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_017223	CGG	2	6	2229479	2229484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_017223	ATGCTG	2	12	2229514	2229525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11029	NC_017223	GCG	2	6	2229526	2229531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_017223	CGG	2	6	2229537	2229542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_017223	CAT	2	6	2229579	2229584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11033	NC_017223	CTGGG	2	10	2229649	2229658	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11034	NC_017223	TCA	2	6	2229674	2229679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11043	NC_017223	GGC	2	6	2229781	2229786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_017223	GCCG	2	8	2229792	2229799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11045	NC_017223	GGCG	2	8	2229801	2229808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11046	NC_017223	CG	3	6	2229819	2229824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11047	NC_017223	GCCG	2	8	2229825	2229832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11055	NC_017223	TGG	2	6	2230016	2230021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_017223	GCC	2	6	2230039	2230044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_017223	GGC	2	6	2230045	2230050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_017223	C	6	6	2230067	2230072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11061	NC_017223	GCCG	2	8	2230146	2230153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11062	NC_017223	GCG	2	6	2230159	2230164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_017223	TGG	2	6	2230166	2230171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11067	NC_017223	GTCGG	2	10	2230291	2230300	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11068	NC_017223	CTG	2	6	2230324	2230329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_017223	GGCGT	2	10	2230369	2230378	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11070	NC_017223	CGC	4	12	2230380	2230391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11072	NC_017223	GC	3	6	2230420	2230425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11073	NC_017223	ATG	2	6	2231289	2231294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11078	NC_017223	TA	3	6	2231471	2231476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_017223	GCA	2	6	2231499	2231504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11083	NC_017223	CCCGC	2	10	2232918	2232927	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11084	NC_017223	T	9	9	2232989	2232997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_017223	GCC	2	6	2232998	2233003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_017223	GCC	2	6	2233006	2233011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11087	NC_017223	A	6	6	2233019	2233024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_017223	G	6	6	2233033	2233038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_017223	CCG	2	6	2233108	2233113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11090	NC_017223	C	6	6	2233175	2233180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11091	NC_017223	GC	3	6	2233201	2233206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11092	NC_017223	GGGC	2	8	2233218	2233225	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11093	NC_017223	CCGG	2	8	2234813	2234820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11094	NC_017223	G	7	7	2234837	2234843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_017223	TCGA	2	8	2234934	2234941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11096	NC_017223	TGA	2	6	2234968	2234973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11098	NC_017223	CGG	2	6	2235076	2235081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_017223	GC	3	6	2235100	2235105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_017223	GCCC	2	8	2235111	2235118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11101	NC_017223	CGTT	2	8	2235288	2235295	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_017223	CCA	2	6	2235310	2235315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11103	NC_017223	GTA	2	6	2235347	2235352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11105	NC_017223	GC	3	6	2235394	2235399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11106	NC_017223	CAC	2	6	2235419	2235424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11107	NC_017223	GC	3	6	2235463	2235468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11108	NC_017223	GCC	2	6	2235476	2235481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11109	NC_017223	TCG	2	6	2235574	2235579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_017223	GAA	2	6	2235608	2235613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_017223	GGCGAT	2	12	2235620	2235631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11112	NC_017223	GAT	2	6	2235666	2235671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_017223	GCC	2	6	2236617	2236622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_017223	CTC	2	6	2237775	2237780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11115	NC_017223	TG	3	6	2237782	2237787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_017223	TAT	2	6	2237810	2237815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_017223	AAC	2	6	2237818	2237823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_017223	CGG	2	6	2237893	2237898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_017223	GGT	2	6	2237951	2237956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_017223	GATTC	2	10	2237986	2237995	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11121	NC_017223	TTG	2	6	2238003	2238008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_017223	GGTT	2	8	2238025	2238032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_017223	GCC	3	9	2238054	2238062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11124	NC_017223	ATT	2	6	2238093	2238098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_017223	AAT	2	6	2238100	2238105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_017223	ACG	2	6	2241469	2241474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_017223	GC	3	6	2242974	2242979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11128	NC_017223	GC	3	6	2242983	2242988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11129	NC_017223	TCC	2	6	2245197	2245202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11131	NC_017223	TAA	2	6	2247986	2247991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_017223	GAA	2	6	2248010	2248015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_017223	G	8	8	2248028	2248035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11143	NC_017223	TA	3	6	2248212	2248217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_017223	GAA	2	6	2248236	2248241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11147	NC_017223	TGTCC	2	10	2248277	2248286	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11148	NC_017223	CG	3	6	2248307	2248312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11181	NC_017223	CGG	2	6	2249735	2249740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11248	NC_017223	CCGG	2	8	2260596	2260603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11250	NC_017223	GCG	2	6	2260648	2260653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11251	NC_017223	AGCGC	2	10	2260667	2260676	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11252	NC_017223	GGC	2	6	2260677	2260682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11253	NC_017223	GCC	2	6	2260692	2260697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11255	NC_017223	GCCG	2	8	2260737	2260744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11256	NC_017223	GC	3	6	2260748	2260753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11257	NC_017223	CGGCG	2	10	2260817	2260826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11258	NC_017223	GCA	2	6	2260849	2260854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11259	NC_017223	GTC	2	6	2260859	2260864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11260	NC_017223	GCC	2	6	2260935	2260940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11261	NC_017223	TGA	2	6	2260957	2260962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11262	NC_017223	GCC	2	6	2260986	2260991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11263	NC_017223	GTC	2	6	2261012	2261017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11264	NC_017223	CGG	2	6	2261045	2261050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11267	NC_017223	GCC	2	6	2261097	2261102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11268	NC_017223	CG	5	10	2261164	2261173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11269	NC_017223	GTC	3	9	2261204	2261212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11270	NC_017223	GCCGC	2	10	2261219	2261228	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11271	NC_017223	GGCG	2	8	2261239	2261246	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11272	NC_017223	GCG	2	6	2261317	2261322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11274	NC_017223	GCC	2	6	2261382	2261387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11282	NC_017223	CGC	2	6	2261668	2261673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11371	NC_017223	CG	3	6	2270534	2270539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11372	NC_017223	GCC	2	6	2270552	2270557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11382	NC_017223	TGG	2	6	2270980	2270985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11383	NC_017223	GCTG	2	8	2270992	2270999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11384	NC_017223	GGCC	2	8	2271014	2271021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11385	NC_017223	CGCC	2	8	2271044	2271051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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11387	NC_017223	GCC	2	6	2271114	2271119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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