MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 19444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017223	TGC	2	6	1208963	1208968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_017223	CGA	2	6	1208994	1208999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_017223	GGCCGT	2	12	1209069	1209080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017223	CCGG	2	8	1209108	1209115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_017223	CTGC	2	8	1209132	1209139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_017223	CGT	2	6	1209144	1209149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017223	GAT	2	6	1209168	1209173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017223	GCA	2	6	1209290	1209295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017223	TCA	2	6	1212359	1212364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017223	GA	3	6	1213595	1213600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017223	CTT	2	6	1213608	1213613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017223	GCC	2	6	1213622	1213627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_017223	GGGCC	2	10	1213630	1213639	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5514	NC_017223	GCCC	2	8	1213649	1213656	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5515	NC_017223	GGC	2	6	1213657	1213662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017223	TCG	2	6	1213673	1213678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_017223	CG	3	6	1213719	1213724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_017223	CAA	2	6	1213737	1213742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017223	GGC	2	6	1213762	1213767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_017223	CG	3	6	1213768	1213773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_017223	TC	3	6	1213791	1213796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_017223	CAG	2	6	1215255	1215260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_017223	CTC	2	6	1217205	1217210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_017223	TGGG	2	8	1217217	1217224	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017223	CCGG	2	8	1219136	1219143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_017223	G	7	7	1219160	1219166	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017223	GGT	2	6	1220263	1220268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017223	CCTG	2	8	1220279	1220286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_017223	GCC	2	6	1221034	1221039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_017223	CGC	2	6	1221065	1221070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_017223	GGCA	2	8	1221153	1221160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_017223	CGC	2	6	1221172	1221177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_017223	GCA	2	6	1221195	1221200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_017223	CGTG	2	8	1221285	1221292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_017223	GGCGTC	2	12	1221325	1221336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017223	GAGGT	2	10	1221383	1221392	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017223	C	7	7	1221462	1221468	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5538	NC_017223	CCGG	2	8	1221485	1221492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_017223	GGC	2	6	1222463	1222468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_017223	ATC	2	6	1222474	1222479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_017223	GCA	2	6	1222496	1222501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_017223	TGT	2	6	1222618	1222623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017223	ATG	2	6	1222653	1222658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017223	TGC	2	6	1222731	1222736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_017223	GAAA	2	8	1222759	1222766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017223	CAG	2	6	1222781	1222786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_017223	CGG	2	6	1222812	1222817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_017223	TCGA	2	8	1222921	1222928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_017223	ATTA	2	8	1222979	1222986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017223	GGCGC	2	10	1223020	1223029	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5551	NC_017223	GCG	2	6	1223062	1223067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_017223	GCTG	2	8	1223070	1223077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5553	NC_017223	AGT	2	6	1223099	1223104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017223	CGC	2	6	1223141	1223146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_017223	CGC	2	6	1224672	1224677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_017223	CG	3	6	1224701	1224706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_017223	GAA	2	6	1224719	1224724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017223	GAA	2	6	1227242	1227247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017223	ATC	2	6	1227285	1227290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017223	GC	3	6	1227292	1227297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_017223	GC	3	6	1227308	1227313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_017223	AAG	2	6	1227326	1227331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017223	GGC	2	6	1227666	1227671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_017223	GAG	2	6	1227676	1227681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017223	GCG	2	6	1227891	1227896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_017223	GC	4	8	1227921	1227928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_017223	CCAAGC	2	12	1227956	1227967	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_017223	CG	3	6	1227986	1227991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_017223	GC	3	6	1228027	1228032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_017223	CG	3	6	1228037	1228042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_017223	GCG	3	9	1228040	1228048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017223	TCT	2	6	1228052	1228057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_017223	GCTG	2	8	1228100	1228107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_017223	TGG	2	6	1228133	1228138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_017223	CAT	2	6	1228140	1228145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_017223	CAT	2	6	1228152	1228157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_017223	AAG	2	6	1228165	1228170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017223	TTC	2	6	1228183	1228188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_017223	GC	3	6	1228215	1228220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_017223	TGGA	2	8	1228222	1228229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017223	TGT	2	6	1228241	1228246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017223	GCCG	2	8	1228317	1228324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5583	NC_017223	GCC	2	6	1228333	1228338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_017223	GC	3	6	1228350	1228355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_017223	CTT	2	6	1228356	1228361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_017223	CGA	2	6	1228362	1228367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5589	NC_017223	CAA	2	6	1228500	1228505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5591	NC_017223	GGC	2	6	1228644	1228649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_017223	CCG	2	6	1228652	1228657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_017223	TCG	2	6	1228664	1228669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017223	TGC	2	6	1228700	1228705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_017223	TGG	2	6	1228745	1228750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_017223	GCC	2	6	1228781	1228786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_017223	GGC	2	6	1228791	1228796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5599	NC_017223	CGTGGC	2	12	1228863	1228874	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_017223	TTC	2	6	1228879	1228884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_017223	CGG	2	6	1228904	1228909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_017223	GCA	2	6	1228917	1228922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_017223	TCT	2	6	1228943	1228948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_017223	GCT	2	6	1228959	1228964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5606	NC_017223	GC	3	6	1228987	1228992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_017223	CTG	2	6	1229011	1229016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5610	NC_017223	CGG	2	6	1229096	1229101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_017223	GCC	2	6	1229146	1229151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_017223	GCTGG	2	10	1229154	1229163	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5613	NC_017223	ATGGC	2	10	1229164	1229173	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5614	NC_017223	GGC	2	6	1229175	1229180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5616	NC_017223	CGC	3	9	1229193	1229201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5619	NC_017223	CG	4	8	1229247	1229254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_017223	GCG	2	6	1229257	1229262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_017223	GCC	2	6	1229263	1229268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_017223	C	7	7	1229738	1229744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5623	NC_017223	CCGG	2	8	1229761	1229768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5631	NC_017223	TAT	2	6	1234670	1234675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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