MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 19444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017223	CGT	2	6	1095430	1095435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017223	GAC	2	6	1097202	1097207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017223	GAT	2	6	1097271	1097276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017223	CG	4	8	1097280	1097287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_017223	GC	3	6	1097303	1097308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_017223	GCC	2	6	1097330	1097335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_017223	GGCGC	2	10	1097337	1097346	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5008	NC_017223	GC	4	8	1097349	1097356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_017223	GCA	2	6	1097361	1097366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017223	GCCG	2	8	1097403	1097410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_017223	GAC	2	6	1097442	1097447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017223	CTT	2	6	1097460	1097465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017223	CG	3	6	1097502	1097507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_017223	GCG	2	6	1097513	1097518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017223	GTG	2	6	1097532	1097537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017223	GCC	2	6	1097542	1097547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_017223	GC	4	8	1097600	1097607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_017223	GCCA	2	8	1097612	1097619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_017223	CTGC	2	8	1097647	1097654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_017223	GC	6	12	1097656	1097667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_017223	GC	3	6	1097708	1097713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_017223	GC	3	6	1097767	1097772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_017223	CTG	2	6	1097810	1097815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017223	TCT	2	6	1097853	1097858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017223	CCAGG	2	10	1097893	1097902	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5026	NC_017223	GCG	2	6	1097908	1097913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017223	CTG	2	6	1097942	1097947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017223	GCG	2	6	1098027	1098032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017223	ATT	2	6	1099128	1099133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017223	GCAGG	2	10	1100179	1100188	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5031	NC_017223	TACA	2	8	1101312	1101319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_017223	CAG	2	6	1101360	1101365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017223	GC	3	6	1101430	1101435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_017223	GGT	2	6	1101436	1101441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017223	CAC	2	6	1101452	1101457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_017223	GGA	2	6	1101459	1101464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017223	GAA	2	6	1101483	1101488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017223	A	7	7	1101487	1101493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017223	T	6	6	1101525	1101530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017223	GCGGA	2	10	1101532	1101541	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5041	NC_017223	GCG	2	6	1101610	1101615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017223	TAC	2	6	1101726	1101731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017223	TGG	2	6	1101749	1101754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017223	CATGC	2	10	1101786	1101795	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5045	NC_017223	CTG	2	6	1101867	1101872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017223	GTTT	2	8	1101894	1101901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017223	GAA	2	6	1101914	1101919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017223	T	6	6	1101937	1101942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017223	AAAT	2	8	1101963	1101970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017223	C	6	6	1101995	1102000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5051	NC_017223	GTT	2	6	1105710	1105715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017223	CGC	2	6	1105717	1105722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_017223	ACA	2	6	1105738	1105743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017223	GCG	2	6	1105788	1105793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017223	CGACAG	2	12	1106247	1106258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017223	GCG	2	6	1108639	1108644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_017223	GCC	2	6	1108822	1108827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_017223	C	6	6	1108889	1108894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5059	NC_017223	GGCC	2	8	1108925	1108932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_017223	TGC	4	12	1108957	1108968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017223	GCC	2	6	1108977	1108982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_017223	CGC	2	6	1109026	1109031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_017223	GCC	2	6	1109100	1109105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_017223	TGC	2	6	1109128	1109133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017223	GCCGT	2	10	1109142	1109151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5066	NC_017223	CG	3	6	1109174	1109179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_017223	TGC	3	9	1109188	1109196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_017223	CCG	2	6	1109209	1109214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_017223	CGT	2	6	1109243	1109248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017223	GC	5	10	1109250	1109259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_017223	TGC	2	6	1109267	1109272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017223	GAC	2	6	1109275	1109280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5074	NC_017223	GGCGCT	2	12	1109406	1109417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017223	TGG	2	6	1109426	1109431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5077	NC_017223	GTG	2	6	1109497	1109502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017223	GC	4	8	1109556	1109563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_017223	CTGGCG	2	12	1109565	1109576	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_017223	TACA	2	8	1110678	1110685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_017223	CAG	2	6	1110726	1110731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017223	GGT	2	6	1110802	1110807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017223	CAC	2	6	1110818	1110823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_017223	GGA	2	6	1110825	1110830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017223	CGG	2	6	1110866	1110871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017223	A	7	7	1110933	1110939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017223	T	6	6	1110970	1110975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017223	CGG	2	6	1111949	1111954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017223	GCC	2	6	1111963	1111968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_017223	TG	3	6	1113915	1113920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017223	GT	3	6	1114271	1114276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017223	TGGT	2	8	1114282	1114289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017223	CG	3	6	1114328	1114333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_017223	GGCGC	2	10	1114372	1114381	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5095	NC_017223	GCCGC	2	10	1114389	1114398	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5096	NC_017223	G	7	7	1114400	1114406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017223	CCGG	2	8	1115364	1115371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_017223	G	7	7	1115388	1115394	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017223	GGC	2	6	1117670	1117675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017223	CG	3	6	1117711	1117716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_017223	CCG	2	6	1117719	1117724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_017223	GCG	2	6	1117733	1117738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017223	GC	3	6	1117765	1117770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_017223	CAGG	2	8	1117813	1117820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_017223	GCC	2	6	1119312	1119317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_017223	CCCG	2	8	1120008	1120015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5107	NC_017223	T	10	10	1120043	1120052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017223	GCC	2	6	1120053	1120058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_017223	GCC	2	6	1120061	1120066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_017223	G	6	6	1120087	1120092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017223	GCCC	2	8	1120099	1120106	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5112	NC_017223	G	8	8	1120121	1120128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017223	TCC	2	6	1120160	1120165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_017223	GGT	2	6	1120166	1120171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017223	CAC	2	6	1120182	1120187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_017223	CTG	2	6	1120259	1120264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_017223	TGTA	2	8	1120305	1120312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017223	GCGGG	2	10	1121392	1121401	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5119	NC_017223	TCC	2	6	1121525	1121530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_017223	GAT	2	6	1121538	1121543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017223	GCGT	2	8	1121567	1121574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_017223	TGC	2	6	1121608	1121613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_017223	TTC	2	6	1121619	1121624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_017223	GGCG	2	8	1121649	1121656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_017223	GAG	2	6	1124415	1124420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017223	GGA	2	6	1124435	1124440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017223	GCC	2	6	1126014	1126019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_017223	CGGC	2	8	1126027	1126034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_017223	CGGG	2	8	1126052	1126059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_017223	GCG	2	6	1126077	1126082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017223	CCGG	2	8	1126083	1126090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_017223	GTA	2	6	1126101	1126106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017223	CAGC	2	8	1126108	1126115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5134	NC_017223	GCC	2	6	1126132	1126137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5135	NC_017223	ATG	2	6	1126924	1126929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5137	NC_017223	CG	3	6	1127298	1127303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5153	NC_017223	GCTG	2	8	1135424	1135431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5154	NC_017223	CTG	2	6	1135435	1135440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5232	NC_017223	CGCTG	2	10	1156628	1156637	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5237	NC_017223	G	7	7	1158717	1158723	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5241	NC_017223	TAA	2	6	1162520	1162525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5248	NC_017223	GAG	2	6	1167480	1167485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_017223	CGA	2	6	1169234	1169239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5254	NC_017223	GCC	2	6	1169505	1169510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5255	NC_017223	GGGC	2	8	1169528	1169535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5256	NC_017223	TGG	3	9	1169536	1169544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_017223	CGC	2	6	1169594	1169599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5258	NC_017223	CGG	2	6	1169642	1169647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_017223	CGGC	2	8	1169650	1169657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5260	NC_017223	GCC	2	6	1169666	1169671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5261	NC_017223	GCT	2	6	1169678	1169683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5263	NC_017223	CGCGAT	2	12	1169805	1169816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_017223	CTG	2	6	1169844	1169849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_017223	GGT	2	6	1195461	1195466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5393	NC_017223	CTTCGT	2	12	1195593	1195604	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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