MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 6561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017221	TCC	2	6	615822	615827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2002	NC_017221	CGC	2	6	619343	619348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2003	NC_017221	GAA	2	6	619360	619365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_017221	GGA	2	6	619408	619413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_017221	GCT	2	6	620980	620985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_017221	GAATGT	2	12	621831	621842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_017221	CCGC	2	8	623016	623023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2008	NC_017221	GGC	2	6	623052	623057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_017221	CT	3	6	625682	625687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2010	NC_017221	CAA	2	6	627150	627155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_017221	ATA	2	6	631351	631356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_017221	TTG	2	6	631364	631369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_017221	TAT	2	6	631431	631436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_017221	TTA	2	6	631488	631493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_017221	ATC	2	6	631604	631609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_017221	A	6	6	631611	631616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_017221	GAG	3	9	631629	631637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_017221	CTG	2	6	632632	632637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_017221	TGATG	2	10	632666	632675	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_017221	TTCC	2	8	632690	632697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_017221	TG	3	6	632711	632716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_017221	AC	4	8	636434	636441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2023	NC_017221	GCT	2	6	636469	636474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_017221	CAG	2	6	636490	636495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_017221	CTTT	2	8	636515	636522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2026	NC_017221	TTC	2	6	636529	636534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_017221	TGCG	2	8	638149	638156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2028	NC_017221	ACC	2	6	638206	638211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2029	NC_017221	TTGGT	2	10	638266	638275	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_017221	ATA	2	6	638347	638352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_017221	CTGCC	2	10	638354	638363	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2032	NC_017221	GCG	2	6	639382	639387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_017221	GGC	2	6	639388	639393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_017221	GTT	2	6	639435	639440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_017221	CAAG	2	8	639940	639947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2036	NC_017221	AAC	2	6	639991	639996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_017221	TTG	2	6	640031	640036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_017221	TTA	2	6	640093	640098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_017221	TGTT	2	8	640179	640186	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_017221	CAA	2	6	640200	640205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_017221	CGGC	2	8	640238	640245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2042	NC_017221	GAT	2	6	640277	640282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_017221	GCC	2	6	641899	641904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2044	NC_017221	TTC	2	6	645135	645140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_017221	GTA	2	6	646389	646394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_017221	G	8	8	646412	646419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_017221	CCA	2	6	647249	647254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2048	NC_017221	GCAT	2	8	647286	647293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2049	NC_017221	CGA	2	6	647345	647350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_017221	GT	3	6	647371	647376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_017221	TGA	2	6	647430	647435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_017221	AAGG	2	8	647447	647454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_017221	GGC	2	6	648291	648296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_017221	TGCAT	2	10	648301	648310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2055	NC_017221	GT	3	6	648357	648362	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_017221	CAC	2	6	648475	648480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_017221	CAC	2	6	649780	649785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2058	NC_017221	GGA	2	6	650617	650622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_017221	CCGG	2	8	651111	651118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2060	NC_017221	CGGTC	2	10	651157	651166	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2061	NC_017221	GGC	2	6	653392	653397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_017221	GCCG	2	8	657175	657182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2063	NC_017221	GAGCC	2	10	657187	657196	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2064	NC_017221	TGA	2	6	660010	660015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_017221	G	6	6	660016	660021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_017221	GA	3	6	660047	660052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_017221	ACTCC	2	10	660081	660090	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2068	NC_017221	GCC	2	6	660100	660105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2069	NC_017221	AGG	2	6	660137	660142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_017221	GGC	2	6	661294	661299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2071	NC_017221	GCT	2	6	661321	661326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_017221	TGG	2	6	661362	661367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_017221	CAGG	2	8	662423	662430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2074	NC_017221	AGT	2	6	662492	662497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_017221	CAT	2	6	662536	662541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_017221	TG	3	6	662580	662585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_017221	ATT	2	6	662614	662619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_017221	GC	3	6	662634	662639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2079	NC_017221	TGGC	2	8	662745	662752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2080	NC_017221	GCC	2	6	663811	663816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2081	NC_017221	GGC	2	6	663846	663851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2082	NC_017221	ATA	2	6	663887	663892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2083	NC_017221	CTG	2	6	666076	666081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_017221	TGC	2	6	666141	666146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2085	NC_017221	T	6	6	666194	666199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2089	NC_017221	CCA	2	6	666607	666612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2090	NC_017221	AGC	2	6	666616	666621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_017221	GTG	2	6	668471	668476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_017221	CAC	2	6	668499	668504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2093	NC_017221	CCG	2	6	668645	668650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2094	NC_017221	AAG	2	6	668653	668658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_017221	GAA	2	6	669799	669804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_017221	CGGC	2	8	669910	669917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2097	NC_017221	CGA	2	6	669961	669966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_017221	ATA	2	6	670319	670324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_017221	GCG	2	6	671163	671168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_017221	TC	3	6	672209	672214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2101	NC_017221	ATA	2	6	673906	673911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_017221	TTTGAA	2	12	673945	673956	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_017221	GAC	2	6	674554	674559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_017221	CAG	3	9	674581	674589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_017221	TGT	2	6	675169	675174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_017221	GCC	2	6	675219	675224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2107	NC_017221	TTC	2	6	680954	680959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_017221	TCG	2	6	680965	680970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2109	NC_017221	CAC	2	6	681037	681042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2110	NC_017221	ATC	2	6	681043	681048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_017221	GGA	2	6	681052	681057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_017221	CTC	2	6	682367	682372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2113	NC_017221	TCCC	2	8	682432	682439	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2114	NC_017221	AT	3	6	682452	682457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_017221	GGC	2	6	682464	682469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_017221	GCG	2	6	682480	682485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_017221	GGT	2	6	684764	684769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_017221	AAT	2	6	685452	685457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_017221	GAA	2	6	685617	685622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_017221	AGGA	2	8	685634	685641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_017221	GC	3	6	685642	685647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2122	NC_017221	GAA	2	6	687784	687789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_017221	AAC	2	6	687798	687803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_017221	GCG	2	6	688769	688774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_017221	GT	3	6	688777	688782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_017221	GTC	2	6	688790	688795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_017221	CG	3	6	688907	688912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2128	NC_017221	GCG	2	6	690230	690235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_017221	T	6	6	690260	690265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_017221	GGT	2	6	690317	690322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_017221	CCGC	2	8	690331	690338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2132	NC_017221	GCG	2	6	690415	690420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_017221	AAAG	2	8	690425	690432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_017221	GCGT	2	8	690718	690725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2136	NC_017221	AG	3	6	690772	690777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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