MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 6561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017221	GTC	2	6	2380163	2380168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_017221	GTG	2	6	2380208	2380213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_017221	TG	3	6	2380212	2380217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_017221	TTGC	2	8	2380218	2380225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6505	NC_017221	TGG	2	6	2380235	2380240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_017221	GCC	2	6	2380298	2380303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6507	NC_017221	ACCG	2	8	2380344	2380351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_017221	G	6	6	2380377	2380382	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_017221	AGT	2	6	2380433	2380438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_017221	GCGA	2	8	2380440	2380447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6511	NC_017221	GAT	2	6	2380453	2380458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_017221	GC	3	6	2380495	2380500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_017221	GCCG	2	8	2380537	2380544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6514	NC_017221	GGGAG	2	10	2380767	2380776	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_017221	GAT	2	6	2380961	2380966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017221	GGA	2	6	2381005	2381010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_017221	G	6	6	2381035	2381040	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_017221	TC	3	6	2381091	2381096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6519	NC_017221	CGG	2	6	2381228	2381233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_017221	TCG	3	9	2381244	2381252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_017221	CGT	2	6	2381272	2381277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_017221	AGG	2	6	2381334	2381339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_017221	AGC	2	6	2381350	2381355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_017221	CAC	2	6	2381428	2381433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_017221	GA	3	6	2381545	2381550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_017221	GCC	2	6	2381689	2381694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_017221	TCCGGG	2	12	2381720	2381731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_017221	GTA	2	6	2381783	2381788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_017221	GCCG	2	8	2381818	2381825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6530	NC_017221	GGT	2	6	2381830	2381835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_017221	TCCG	2	8	2381874	2381881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6532	NC_017221	GAT	2	6	2381898	2381903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_017221	GCC	2	6	2381970	2381975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6534	NC_017221	TGG	2	6	2381991	2381996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_017221	AC	3	6	2382094	2382099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6536	NC_017221	CGG	2	6	2382275	2382280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_017221	CG	3	6	2382523	2382528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_017221	AGTGCA	2	12	2382695	2382706	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6539	NC_017221	GAC	2	6	2382727	2382732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_017221	CCGGTG	2	12	2382767	2382778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_017221	TCG	2	6	2382884	2382889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_017221	CGT	2	6	2382964	2382969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_017221	GAG	2	6	2383011	2383016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_017221	TCC	2	6	2383308	2383313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_017221	GCC	2	6	2383398	2383403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_017221	CGG	2	6	2383410	2383415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_017221	AGA	2	6	2383439	2383444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_017221	GCG	2	6	2383448	2383453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_017221	CGC	3	9	2383553	2383561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6550	NC_017221	CA	3	6	2383639	2383644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_017221	CGGC	2	8	2383704	2383711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_017221	CCG	2	6	2383713	2383718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_017221	AG	3	6	2383729	2383734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_017221	CGGCG	2	10	2383736	2383745	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6555	NC_017221	CCT	2	6	2383812	2383817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6556	NC_017221	C	6	6	2383818	2383823	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6557	NC_017221	CTG	2	6	2383827	2383832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_017221	C	7	7	2383844	2383850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6559	NC_017221	AGG	2	6	2383910	2383915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_017221	CAA	2	6	2385199	2385204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_017221	ACC	2	6	2385250	2385255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.