MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium breve ACS-071-V-Sch8b chromosome

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017218	TTACG	2	10	56946	56955	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017218	AACAT	2	10	59119	59128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017218	TTGGC	2	10	60973	60982	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017218	TCGGC	2	10	68497	68506	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017218	GTGAA	2	10	92085	92094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017218	AGCTT	2	10	92748	92757	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017218	GGATG	2	10	101153	101162	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017218	AATGT	2	10	126244	126253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017218	AACAG	2	10	133220	133229	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017218	TGCGC	2	10	143061	143070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017218	TTTCG	2	10	144120	144129	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017218	GTGGC	2	10	145069	145078	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017218	AGCAA	2	10	145854	145863	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017218	CAACC	2	10	157693	157702	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017218	TCGCT	2	10	170642	170651	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017218	TCGGC	2	10	172698	172707	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017218	ATGTG	2	10	176215	176224	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017218	TCCCC	2	10	176419	176428	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_017218	ACGAA	2	10	185970	185979	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017218	AGAAA	2	10	187747	187756	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017218	TTTTC	2	10	188497	188506	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017218	TTCGC	2	10	195422	195431	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017218	GCGCT	2	10	196144	196153	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017218	ACCGA	2	10	196281	196290	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017218	CGCGC	2	10	198555	198564	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_017218	TTCCT	2	10	202623	202632	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017218	AGTGG	2	10	204629	204638	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017218	TTGTT	2	10	209571	209580	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017218	CCGGC	2	10	209840	209849	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017218	TTGCA	2	10	215684	215693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017218	CTTGT	2	10	228219	228228	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017218	CGAAA	2	10	228307	228316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017218	AGGTG	2	10	242033	242042	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017218	GGCGG	2	10	242873	242882	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017218	CTTCC	2	10	246774	246783	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017218	CTCTC	2	10	251729	251738	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017218	TGGCG	2	10	254212	254221	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017218	GCCAA	2	10	261577	261586	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017218	GATGT	2	10	263430	263439	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017218	GACGG	2	10	267237	267246	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017218	ATTGG	2	10	275554	275563	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017218	GCCAT	2	10	275744	275753	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017218	GACGG	2	10	275900	275909	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017218	AACGA	2	10	278089	278098	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017218	ACCGA	2	10	278626	278635	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017218	AAAAG	2	10	279078	279087	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017218	TTCTG	2	10	279947	279956	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017218	TATTT	2	10	280527	280536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017218	TTTGC	2	10	281924	281933	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017218	GGCGT	2	10	293053	293062	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017218	CTCTT	2	10	302788	302797	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017218	AGGCA	2	10	309685	309694	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017218	ATAGG	2	10	338961	338970	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017218	ATTTT	2	10	347162	347171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017218	CGATG	2	10	350158	350167	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017218	GGGGT	2	10	350340	350349	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017218	CGCCA	2	10	372328	372337	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_017218	CACGC	2	10	372347	372356	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_017218	GCAAC	2	10	372460	372469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017218	CACAC	2	10	405311	405320	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_017218	GGCTG	2	10	409688	409697	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017218	TTTGT	2	10	423196	423205	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017218	ACGAT	2	10	428753	428762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017218	CCTAC	2	10	447308	447317	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_017218	TGGGA	2	10	452521	452530	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017218	ACGAG	2	10	469310	469319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017218	GCCTT	2	10	470712	470721	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017218	TCTCC	2	10	483581	483590	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_017218	ACATC	2	10	493511	493520	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017218	GGAAT	2	10	497478	497487	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017218	GCTGT	2	10	499332	499341	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017218	ATCGC	2	10	499577	499586	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017218	AGTCC	2	10	503820	503829	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017218	CGACA	2	10	506384	506393	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017218	TGCTG	2	10	507667	507676	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017218	TTTGC	2	10	507717	507726	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017218	CGTTA	2	10	515823	515832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017218	GCAAT	2	10	515947	515956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017218	AACGC	2	10	516023	516032	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017218	GGGGA	2	10	516572	516581	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017218	AAGGA	2	10	524052	524061	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017218	GCGAT	2	10	526931	526940	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017218	TTGTC	2	10	527157	527166	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017218	TTCCT	2	10	541808	541817	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017218	CGCTG	2	10	553689	553698	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017218	ACGTT	2	10	565071	565080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017218	TTTGC	2	10	567065	567074	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017218	TGCAC	2	10	577894	577903	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017218	GAGGG	2	10	585617	585626	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017218	TGTGG	2	10	589755	589764	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017218	AGAGG	2	10	628583	628592	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017218	TCCCT	2	10	633874	633883	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_017218	AACGA	2	10	635368	635377	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017218	TGTGC	2	10	639275	639284	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017218	GAAGG	2	10	645835	645844	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017218	AGGAA	2	10	654473	654482	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017218	TTTGA	2	10	669924	669933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017218	TTTCC	2	10	678177	678186	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017218	TGGTG	2	10	681510	681519	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017218	ATGGG	2	10	681949	681958	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017218	TCGTG	2	10	682782	682791	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017218	TCGAA	2	10	683584	683593	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017218	GGGAG	2	10	684254	684263	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017218	CTCGA	2	10	712177	712186	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017218	TTGAC	2	10	714188	714197	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017218	CTGAA	2	10	720695	720704	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017218	CAATA	2	10	723765	723774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017218	CGTTG	2	10	730342	730351	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017218	TCCTT	2	10	736109	736118	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017218	TGGAA	2	10	744610	744619	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017218	CGTGG	2	10	753699	753708	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017218	AACAG	2	10	761161	761170	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017218	TTGTG	2	10	794621	794630	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017218	CAAAT	2	10	803697	803706	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017218	TCTTG	2	10	822704	822713	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017218	GAAAA	2	10	825090	825099	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017218	ACGTC	2	10	832691	832700	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017218	TTGGC	2	10	832835	832844	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017218	GGCCA	2	10	833496	833505	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017218	AAGCC	2	10	833594	833603	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017218	TTGCT	2	10	848103	848112	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017218	CCGTA	2	10	859178	859187	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017218	TTCCT	2	10	879725	879734	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017218	AAGCA	2	10	909128	909137	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017218	ACTTG	2	10	914609	914618	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017218	AAAGC	2	10	924386	924395	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017218	CCGTC	2	10	934605	934614	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017218	GCAGA	2	10	939645	939654	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017218	GTCAT	2	10	940004	940013	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017218	GTCAT	2	10	942201	942210	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017218	TGCCG	2	10	946114	946123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017218	AAACG	2	10	983850	983859	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017218	TCCTT	2	10	1005764	1005773	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017218	GTGAT	2	10	1017073	1017082	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017218	TGTGC	2	10	1017221	1017230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017218	GCGCC	2	10	1036964	1036973	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_017218	CGGCT	2	10	1044583	1044592	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017218	GTGAT	2	10	1047198	1047207	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017218	CTCCC	2	10	1049830	1049839	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
140	NC_017218	TCGCC	2	10	1053919	1053928	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_017218	AGCGA	2	10	1054098	1054107	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017218	AGCAA	2	10	1054203	1054212	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017218	CTCAA	2	10	1054267	1054276	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017218	AGTAC	2	10	1055847	1055856	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017218	CGGCG	2	10	1060753	1060762	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017218	GTTCT	2	10	1077688	1077697	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017218	TGTGC	2	10	1080196	1080205	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017218	TGCAT	2	10	1092799	1092808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_017218	GATTC	2	10	1276729	1276738	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_017218	GTGAT	2	10	1287715	1287724	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_017218	TACCG	2	10	1312072	1312081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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262	NC_017218	CCTGC	2	10	2029102	2029111	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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267	NC_017218	CTCCC	2	10	2077664	2077673	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
268	NC_017218	CTACG	2	10	2088897	2088906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_017218	GCTCT	2	10	2102249	2102258	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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272	NC_017218	CGTCT	2	10	2117716	2117725	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
273	NC_017218	CTATT	2	10	2117803	2117812	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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278	NC_017218	ATTCT	2	10	2169991	2170000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_017218	CTGTC	2	10	2181516	2181525	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
280	NC_017218	ACAGT	2	10	2182768	2182777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
281	NC_017218	CGGCG	2	10	2193669	2193678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
282	NC_017218	GCACA	2	10	2193735	2193744	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_017218	CAGCG	2	10	2198165	2198174	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
284	NC_017218	ATTTG	2	10	2203034	2203043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017218	TCTCT	2	10	2206159	2206168	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_017218	CTCCC	2	10	2213503	2213512	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
287	NC_017218	ACTGC	2	10	2215353	2215362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_017218	TTCAC	2	10	2215536	2215545	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
289	NC_017218	GTTCG	2	10	2226009	2226018	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_017218	CTCCC	2	10	2229214	2229223	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
291	NC_017218	TTCGA	2	10	2229884	2229893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_017218	CACGA	2	10	2230686	2230695	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
293	NC_017218	CCCAT	2	10	2231519	2231528	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
294	NC_017218	CAAAA	2	10	2231784	2231793	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_017218	CTCCC	2	10	2235462	2235471	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
296	NC_017218	TTCGA	2	10	2236132	2236141	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
297	NC_017218	CACGA	2	10	2236934	2236943	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
298	NC_017218	CCCAT	2	10	2237767	2237776	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
299	NC_017218	CAAAA	2	10	2238032	2238041	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_017218	CCGTA	2	10	2243155	2243164	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
301	NC_017218	TCTCC	2	10	2245509	2245518	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
302	NC_017218	TCGCT	2	10	2248266	2248275	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
303	NC_017218	GATAT	2	10	2273097	2273106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017218	AAAAG	2	10	2281523	2281532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
305	NC_017218	ACTGT	2	10	2283848	2283857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
306	NC_017218	AAGGA	2	10	2294636	2294645	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017218	TGCAC	2	10	2297845	2297854	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
308	NC_017218	GGCCG	2	10	2297963	2297972	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
309	NC_017218	TTTTC	2	10	2307425	2307434	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
310	NC_017218	ACCAG	2	10	2307493	2307502	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
311	NC_017218	GCACT	2	10	2320301	2320310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.