MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 5072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017217	CCGT	2	8	1638224	1638231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_017217	TA	3	6	1638373	1638378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017217	AGG	2	6	1638470	1638475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017217	CCG	2	6	1638824	1638829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_017217	GC	3	6	1638842	1638847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_017217	AC	3	6	1638855	1638860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_017217	AGA	2	6	1638871	1638876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017217	GAG	2	6	1640667	1640672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017217	CGC	2	6	1640682	1640687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_017217	GCG	2	6	1640690	1640695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017217	GCA	2	6	1640709	1640714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017217	CAC	2	6	1642122	1642127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_017217	GGC	2	6	1642180	1642185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017217	TTCG	2	8	1642204	1642211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_017217	ACA	2	6	1642978	1642983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017217	GCC	2	6	1643011	1643016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_017217	CTG	2	6	1643990	1643995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_017217	ATTT	2	8	1644666	1644673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017217	AAC	2	6	1644707	1644712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017217	CTG	2	6	1644714	1644719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017217	CAG	3	9	1644741	1644749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_017217	A	6	6	1644829	1644834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017217	TA	5	10	1644836	1644845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017217	TAT	2	6	1644851	1644856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017217	AAAT	2	8	1644935	1644942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017217	CAA	2	6	1644975	1644980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017217	GA	3	6	1644994	1644999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017217	ATACT	2	10	1646143	1646152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4029	NC_017217	TA	3	6	1646215	1646220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017217	AAGT	2	8	1646232	1646239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017217	GAA	2	6	1647226	1647231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017217	GTA	2	6	1649090	1649095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017217	CAT	2	6	1649213	1649218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017217	AGT	2	6	1649221	1649226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017217	T	6	6	1649238	1649243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017217	AT	3	6	1650401	1650406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017217	CTT	3	9	1650418	1650426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017217	AGT	2	6	1650440	1650445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017217	AAT	2	6	1650453	1650458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017217	ATTT	2	8	1650483	1650490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017217	AGC	2	6	1654141	1654146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017217	TG	3	6	1654190	1654195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017217	CAAT	2	8	1654203	1654210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_017217	TTGT	2	8	1654298	1654305	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017217	CCA	2	6	1657622	1657627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_017217	CA	4	8	1657633	1657640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_017217	GC	3	6	1657681	1657686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_017217	GC	3	6	1657700	1657705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_017217	TAT	2	6	1657708	1657713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017217	ATTG	2	8	1657720	1657727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017217	TAAC	2	8	1658396	1658403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_017217	ATC	2	6	1658447	1658452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017217	GAT	2	6	1660240	1660245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017217	CGATG	2	10	1660272	1660281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4055	NC_017217	ATT	2	6	1660345	1660350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017217	AGA	2	6	1662008	1662013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017217	CT	3	6	1662017	1662022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_017217	GAG	2	6	1662025	1662030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017217	AGAGAA	2	12	1662108	1662119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017217	ATC	2	6	1662351	1662356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_017217	GCC	2	6	1662414	1662419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_017217	GGTC	2	8	1662425	1662432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_017217	AGG	2	6	1662450	1662455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017217	GC	3	6	1662516	1662521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_017217	CAG	2	6	1662651	1662656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017217	CGA	3	9	1662670	1662678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017217	GCG	2	6	1663575	1663580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017217	AT	3	6	1663584	1663589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017217	TCG	2	6	1663596	1663601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017217	TAC	2	6	1664070	1664075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_017217	TCC	2	6	1664102	1664107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_017217	GC	3	6	1664121	1664126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_017217	GGAG	2	8	1664166	1664173	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017217	GTG	2	6	1664187	1664192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017217	CTG	2	6	1664228	1664233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017217	GCC	2	6	1664300	1664305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_017217	C	6	6	1664304	1664309	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4078	NC_017217	TCG	2	6	1664358	1664363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017217	GT	3	6	1664390	1664395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017217	TCA	2	6	1664408	1664413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_017217	TG	3	6	1664419	1664424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017217	GGC	2	6	1664528	1664533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_017217	ACG	2	6	1664591	1664596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_017217	CG	3	6	1664595	1664600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_017217	GCG	2	6	1664615	1664620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017217	CTC	2	6	1665946	1665951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_017217	GC	4	8	1665983	1665990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_017217	CAT	2	6	1666011	1666016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017217	GAA	2	6	1666019	1666024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017217	AAC	3	9	1666111	1666119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017217	ACAT	2	8	1666181	1666188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_017217	A	6	6	1666202	1666207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017217	CTGT	2	8	1668774	1668781	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_017217	CCG	2	6	1668793	1668798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_017217	GGA	2	6	1668876	1668881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017217	TCT	2	6	1670574	1670579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_017217	C	6	6	1670607	1670612	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4098	NC_017217	CAA	2	6	1670667	1670672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017217	GAG	2	6	1670705	1670710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017217	AGG	2	6	1670714	1670719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017217	CAA	2	6	1672540	1672545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_017217	CGT	2	6	1672599	1672604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017217	CAT	2	6	1672643	1672648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017217	CCAC	2	8	1672725	1672732	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4105	NC_017217	CAC	2	6	1672761	1672766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_017217	CGG	2	6	1674280	1674285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017217	TCGC	2	8	1674708	1674715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_017217	ACT	2	6	1674782	1674787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017217	CAC	2	6	1674811	1674816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_017217	GAG	2	6	1674931	1674936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017217	T	6	6	1676546	1676551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017217	CTT	2	6	1676552	1676557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_017217	TGG	2	6	1676611	1676616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017217	GC	3	6	1676638	1676643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_017217	GAA	2	6	1676663	1676668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017217	TGG	2	6	1676710	1676715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017217	ACT	2	6	1676794	1676799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017217	CAG	2	6	1676824	1676829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_017217	CG	3	6	1677842	1677847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_017217	TCT	2	6	1680256	1680261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017217	CTT	2	6	1680287	1680292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017217	GC	3	6	1680325	1680330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_017217	CAG	2	6	1680364	1680369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017217	GCA	2	6	1682279	1682284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017217	GGGC	2	8	1682343	1682350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_017217	GCC	2	6	1682401	1682406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_017217	ACC	2	6	1682428	1682433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_017217	GGCC	2	8	1686952	1686959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_017217	TTC	2	6	1687816	1687821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_017217	CG	3	6	1687829	1687834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_017217	TCC	3	9	1688389	1688397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_017217	ATG	2	6	1688412	1688417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4263	NC_017217	AC	3	6	1752802	1752807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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