MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 5072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017217	CCG	2	6	1461131	1461136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_017217	CGG	2	6	1461180	1461185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017217	GAAC	2	8	1461189	1461196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_017217	GGA	2	6	1461210	1461215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017217	TGG	2	6	1461891	1461896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017217	CAGAT	2	10	1463740	1463749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3507	NC_017217	GAG	2	6	1463750	1463755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017217	CA	3	6	1464632	1464637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_017217	ATTC	2	8	1465635	1465642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_017217	CCT	2	6	1465648	1465653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_017217	CCT	2	6	1465765	1465770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_017217	GCCC	2	8	1465782	1465789	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3513	NC_017217	TGC	2	6	1469011	1469016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_017217	TGGCTG	2	12	1469035	1469046	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3515	NC_017217	GCCAC	2	10	1469091	1469100	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3516	NC_017217	ATG	2	6	1469118	1469123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017217	TC	3	6	1470356	1470361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_017217	CTCGTT	2	12	1470362	1470373	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_017217	CG	3	6	1470382	1470387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_017217	GCATG	2	10	1470433	1470442	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3521	NC_017217	CAG	2	6	1470475	1470480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_017217	TGCG	2	8	1470484	1470491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_017217	GC	3	6	1470540	1470545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_017217	GC	3	6	1470563	1470568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_017217	TCT	2	6	1473376	1473381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_017217	TC	3	6	1473385	1473390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_017217	CCTT	2	8	1474505	1474512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_017217	CT	3	6	1474519	1474524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_017217	GCG	3	9	1474591	1474599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_017217	CGC	2	6	1474772	1474777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_017217	GA	3	6	1474832	1474837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017217	T	6	6	1475536	1475541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017217	CGA	2	6	1475603	1475608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_017217	GT	3	6	1475634	1475639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017217	TAC	2	6	1475682	1475687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_017217	AGT	2	6	1475694	1475699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017217	AAG	3	9	1475712	1475720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017217	GCAG	2	8	1475734	1475741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_017217	TTTGC	2	10	1476381	1476390	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3540	NC_017217	GTT	3	9	1476476	1476484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017217	CG	3	6	1476520	1476525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_017217	CGG	2	6	1476546	1476551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_017217	GT	3	6	1476607	1476612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017217	GCG	2	6	1476640	1476645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_017217	GCC	2	6	1476746	1476751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_017217	GCC	2	6	1476829	1476834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_017217	GCC	2	6	1476840	1476845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_017217	TGG	2	6	1476866	1476871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017217	GTTG	2	8	1476873	1476880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017217	CA	3	6	1476965	1476970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_017217	G	8	8	1476976	1476983	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017217	TCCC	2	8	1477039	1477046	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3553	NC_017217	CCT	2	6	1477133	1477138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_017217	ACG	2	6	1477181	1477186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_017217	CGA	2	6	1477261	1477266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_017217	CCA	2	6	1477621	1477626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_017217	ACC	2	6	1477866	1477871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_017217	CAC	2	6	1477894	1477899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_017217	GCC	2	6	1478044	1478049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_017217	ACC	2	6	1478165	1478170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_017217	GGC	2	6	1478190	1478195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017217	CAT	2	6	1478262	1478267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_017217	GGGGC	2	10	1478303	1478312	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3564	NC_017217	ACC	2	6	1478333	1478338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_017217	CGGC	2	8	1478343	1478350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_017217	AGG	2	6	1478416	1478421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017217	GGTC	2	8	1478472	1478479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_017217	GAC	2	6	1478562	1478567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_017217	CA	3	6	1478650	1478655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_017217	CGC	2	6	1478675	1478680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_017217	GCT	2	6	1478819	1478824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_017217	CCT	2	6	1478835	1478840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_017217	GAC	2	6	1478896	1478901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_017217	CGA	2	6	1478922	1478927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_017217	CCG	2	6	1478941	1478946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_017217	C	6	6	1479034	1479039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3577	NC_017217	TCC	2	6	1479164	1479169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_017217	ATC	2	6	1479208	1479213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_017217	CCA	2	6	1479348	1479353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_017217	CTCCC	2	10	1479401	1479410	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3581	NC_017217	CCAT	2	8	1479537	1479544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_017217	GCAT	2	8	1479613	1479620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_017217	CAC	2	6	1479625	1479630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_017217	GC	3	6	1479675	1479680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_017217	CAT	2	6	1479716	1479721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3587	NC_017217	ACT	2	6	1479737	1479742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_017217	C	6	6	1479793	1479798	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3589	NC_017217	CGG	2	6	1479871	1479876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_017217	CCA	2	6	1479935	1479940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_017217	GCC	2	6	1479968	1479973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_017217	ACT	2	6	1479985	1479990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3594	NC_017217	AC	3	6	1480030	1480035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_017217	ACGA	2	8	1480055	1480062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_017217	A	6	6	1480070	1480075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017217	ACCCC	2	10	1480111	1480120	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3598	NC_017217	CGGG	2	8	1480123	1480130	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_017217	ACC	3	9	1480162	1480170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_017217	CCA	2	6	1480171	1480176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_017217	ACCC	2	8	1480181	1480188	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3602	NC_017217	AC	3	6	1480223	1480228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_017217	GGC	2	6	1480259	1480264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_017217	GCAC	2	8	1480279	1480286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_017217	CACAC	2	10	1480287	1480296	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3606	NC_017217	GCG	2	6	1480332	1480337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_017217	AGG	2	6	1480416	1480421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017217	C	6	6	1480497	1480502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3609	NC_017217	GT	3	6	1480558	1480563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017217	ATG	2	6	1480753	1480758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017217	TCC	2	6	1480779	1480784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_017217	CGG	2	6	1480795	1480800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017217	GCG	2	6	1480838	1480843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_017217	CACGA	2	10	1480880	1480889	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3615	NC_017217	GAC	3	9	1480893	1480901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3618	NC_017217	CCG	2	6	1481013	1481018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_017217	CTC	2	6	1481197	1481202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_017217	TTC	2	6	1481244	1481249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_017217	GCCC	2	8	1481309	1481316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3622	NC_017217	CGA	2	6	1481365	1481370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3626	NC_017217	CAA	2	6	1481698	1481703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_017217	CCCAT	2	10	1481720	1481729	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3628	NC_017217	CCCAC	2	10	1481745	1481754	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3629	NC_017217	GGAGC	2	10	1481763	1481772	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3630	NC_017217	ACC	2	6	1481783	1481788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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