MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 5072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017217	CCCG	2	8	297521	297528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1002	NC_017217	GC	3	6	297552	297557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_017217	GC	3	6	297575	297580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_017217	AGC	2	6	297721	297726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017217	CGTTC	2	10	297798	297807	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1006	NC_017217	GGC	3	9	297816	297824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017217	GCC	2	6	299035	299040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_017217	CCA	2	6	299132	299137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_017217	CATG	2	8	299151	299158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_017217	GCTGTT	2	12	299253	299264	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1011	NC_017217	TTGC	2	8	300433	300440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_017217	CG	3	6	300446	300451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_017217	GGC	2	6	300456	300461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017217	CGG	2	6	300504	300509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017217	GTTT	2	8	300545	300552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017217	GCGG	2	8	300570	300577	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_017217	AGG	2	6	300587	300592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017217	CAA	2	6	300597	300602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017217	AGCGT	2	10	302587	302596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_017217	GGT	2	6	302599	302604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017217	CAC	2	6	302605	302610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_017217	GCT	2	6	303199	303204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017217	CTC	2	6	303250	303255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017217	TGG	3	9	303278	303286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017217	AAT	2	6	303287	303292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017217	TCA	2	6	303304	303309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017217	CAT	2	6	303328	303333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017217	TAG	2	6	304640	304645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017217	CG	3	6	307065	307070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_017217	GCC	2	6	310021	310026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_017217	GGC	2	6	310118	310123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017217	GC	3	6	310122	310127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_017217	GGTT	2	8	310162	310169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017217	AGA	3	9	310198	310206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017217	GTG	2	6	310294	310299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017217	GTG	2	6	313181	313186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017217	CAGG	2	8	313609	313616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_017217	ACA	2	6	313745	313750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017217	AGG	2	6	313751	313756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017217	TGA	2	6	316216	316221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017217	TGG	2	6	316238	316243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017217	TGT	2	6	316257	316262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017217	TCG	2	6	316300	316305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017217	G	6	6	316340	316345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017217	GAA	2	6	316383	316388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017217	TGG	2	6	316401	316406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017217	TA	4	8	316480	316487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017217	TCT	2	6	316581	316586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017217	GAA	2	6	316600	316605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017217	GCT	2	6	324707	324712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017217	CTGT	2	8	324786	324793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_017217	TGG	2	6	324871	324876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017217	TGG	2	6	324898	324903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017217	TGG	2	6	325131	325136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017217	ACAG	2	8	325162	325169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_017217	CAT	2	6	325262	325267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017217	GCG	2	6	325326	325331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017217	GTGG	2	8	326807	326814	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017217	GT	4	8	328328	328335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017217	CA	3	6	328366	328371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_017217	TG	3	6	331997	332002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017217	CGTT	2	8	332008	332015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017217	GGT	2	6	332027	332032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017217	GGT	2	6	332047	332052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017217	GGT	2	6	332067	332072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017217	GGT	2	6	332087	332092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017217	GCAT	2	8	332144	332151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_017217	GCC	2	6	332152	332157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_017217	AGA	2	6	332176	332181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017217	AAG	2	6	332241	332246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017217	GC	3	6	333517	333522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_017217	TCTT	2	8	333638	333645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_017217	TAA	2	6	333712	333717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017217	G	6	6	333818	333823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017217	AG	3	6	333825	333830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017217	GGA	2	6	333886	333891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017217	TTC	2	6	336622	336627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017217	CTT	2	6	336690	336695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017217	GGC	2	6	336745	336750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017217	TGG	2	6	336805	336810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017217	TCG	2	6	336811	336816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017217	TCTG	2	8	336848	336855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_017217	TAG	2	6	336856	336861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017217	TCG	2	6	336862	336867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017217	GC	3	6	336953	336958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_017217	GGT	2	6	336961	336966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017217	TGC	2	6	337007	337012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017217	CTGG	2	8	337065	337072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_017217	GAC	2	6	337172	337177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017217	GGGC	2	8	337230	337237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_017217	AGAGA	2	10	337238	337247	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017217	AGAT	2	8	337287	337294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017217	GC	3	6	337299	337304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_017217	T	6	6	337405	337410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017217	CTG	2	6	337475	337480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017217	AAG	2	6	337493	337498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017217	AAG	2	6	337502	337507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017217	AAG	2	6	337658	337663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017217	AGGG	2	8	337708	337715	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017217	CGCA	2	8	339399	339406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_017217	GAC	2	6	342561	342566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017217	TGAA	2	8	342570	342577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017217	GCAT	2	8	342607	342614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_017217	GTG	2	6	345291	345296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017217	CTT	2	6	345342	345347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017217	CAA	2	6	345401	345406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017217	CGA	2	6	345438	345443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017217	TTC	2	6	345450	345455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017217	GCG	2	6	345546	345551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017217	TG	3	6	346387	346392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017217	CG	3	6	346398	346403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_017217	AAT	2	6	346455	346460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017217	TGGG	2	8	346561	346568	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017217	GC	3	6	346609	346614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_017217	A	7	7	346617	346623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017217	TTCG	2	8	346875	346882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_017217	CG	3	6	346931	346936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_017217	CTTG	2	8	347549	347556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_017217	CGC	2	6	347584	347589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_017217	CT	3	6	348323	348328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_017217	TGG	2	6	348867	348872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017217	TGGC	2	8	348884	348891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_017217	ATGAG	2	10	348926	348935	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017217	CTGGG	2	10	348952	348961	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_017217	AGG	2	6	349017	349022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017217	CGC	2	6	349326	349331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_017217	CTGT	2	8	349335	349342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_017217	CA	3	6	349374	349379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_017217	GTG	2	6	349391	349396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017217	TG	3	6	349395	349400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017217	CT	4	8	352040	352047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_017217	TTG	2	6	352053	352058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017217	TG	3	6	352084	352089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017217	GT	3	6	352117	352122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017217	GGC	2	6	352908	352913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017217	TTCG	2	8	352932	352939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_017217	ATG	2	6	352967	352972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017217	GA	3	6	352974	352979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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