MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 chromosome

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017208	CTATTA	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017208	ATTTTT	2	12	9161	9172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017208	TTTCGT	2	12	10790	10801	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017208	ATTTTT	2	12	28904	28915	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017208	TTTCGT	2	12	30533	30544	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017208	TTTTCC	2	12	54225	54236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017208	CTTTTT	2	12	74252	74263	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017208	TTATAT	2	12	81920	81931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017208	ATTTTT	2	12	82183	82194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017208	TTTCGT	2	12	83812	83823	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017208	ATTTTT	2	12	91095	91106	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017208	TTTCGT	2	12	92724	92735	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017208	AGTCAA	2	12	96317	96328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017208	ATTTTT	2	12	154501	154512	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017208	TTTCGT	2	12	156130	156141	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017208	GTGATT	2	12	161660	161671	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017208	GTATGT	2	12	177819	177830	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017208	AAAATA	2	12	210467	210478	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017208	AAGGGG	2	12	210550	210561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017208	AAAAGT	2	12	211968	211979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017208	AGAGGT	2	12	213931	213942	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017208	AAAAGA	2	12	226169	226180	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017208	ATTTTT	2	12	247672	247683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017208	TTTCGT	2	12	249301	249312	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017208	ATTTTT	2	12	271018	271029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017208	TTTCGT	2	12	272647	272658	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017208	ATTTTT	2	12	278477	278488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017208	TTTCGT	2	12	280106	280117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017208	AGTATT	2	12	293797	293808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017208	ATTTTT	2	12	294119	294130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017208	TTTCGT	2	12	295748	295759	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017208	ATTTTT	2	12	301497	301508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017208	TTTCGT	2	12	303126	303137	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017208	TATAAA	2	12	339981	339992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017208	AAAAAT	2	12	356519	356530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017208	ATTTGA	2	12	358357	358368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017208	GTGTAA	2	12	371248	371259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017208	AATGAT	2	12	377798	377809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017208	ATACTT	2	12	383614	383625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017208	GTTAAT	2	12	395626	395637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017208	TAAAAA	2	12	438377	438388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017208	AAAAAT	2	12	439744	439755	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017208	TATTTT	5	30	460532	460561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017208	ATTTTT	2	12	464181	464192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017208	CCAATT	2	12	470131	470142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017208	TTTTCT	2	12	486024	486035	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017208	GCATAA	2	12	498727	498738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017208	AATGAA	2	12	498780	498791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017208	ATTTTT	2	12	523259	523270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017208	TTTCGT	2	12	524888	524899	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017208	ATCATT	2	12	543126	543137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017208	TGTATA	2	12	595697	595708	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017208	ATTTAT	2	12	603528	603539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017208	ATGAAA	2	12	633357	633368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017208	TATTAA	2	12	693501	693512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017208	AATTTG	2	12	693984	693995	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017208	GCTTCA	2	12	694019	694030	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017208	TTTAAT	2	12	694272	694283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017208	CTTTTT	2	12	708924	708935	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017208	GATATG	2	12	716381	716392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017208	TCTAAA	2	12	729794	729805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017208	AGATTT	2	12	730833	730844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017208	GAAATA	2	12	738345	738356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017208	ATTTTT	2	12	740176	740187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017208	ACTTAA	2	12	753578	753589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017208	CTTTTT	2	12	765284	765295	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017208	TTAAAA	2	12	775055	775066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017208	ATTTTT	2	12	782265	782276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017208	GATAAT	2	12	824589	824600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017208	ATCAAT	2	12	827039	827050	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017208	GTATAT	2	12	833772	833783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017208	TGTAGA	2	12	839856	839867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017208	ATGTAA	2	12	856347	856358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017208	TTAAAG	2	12	871379	871390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017208	AAATTC	2	12	882107	882118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017208	AAATGT	2	12	901295	901306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017208	ACGAGA	2	12	901344	901355	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017208	GTTTTT	2	12	906921	906932	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017208	GTATAT	2	12	920122	920133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017208	ATTACC	2	12	930371	930382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017208	TATGAA	2	12	943370	943381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017208	AAAAAT	2	12	954952	954963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017208	TGGGAG	2	12	958873	958884	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017208	TGATGG	2	12	962030	962041	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017208	GCATGT	2	12	973566	973577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017208	ATATAG	2	12	989043	989054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017208	AAATGT	2	12	1005101	1005112	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017208	CATTAA	2	12	1013345	1013356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017208	TGTTTA	2	12	1013365	1013376	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017208	GCAATA	2	12	1017538	1017549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017208	AGCCAC	2	12	1017812	1017823	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017208	ATTAAA	2	12	1019257	1019268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017208	TACTTT	2	12	1028720	1028731	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017208	TCTTTT	2	12	1057712	1057723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017208	ATACAT	2	12	1070835	1070846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017208	AAAATA	2	12	1078754	1078765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017208	TGGAAT	2	12	1111696	1111707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017208	AAAAAG	2	12	1118143	1118154	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017208	TAATAT	2	12	1118770	1118781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017208	TCCATT	2	12	1120064	1120075	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017208	AAATTC	2	12	1124609	1124620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017208	TACTTT	3	18	1137056	1137073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017208	GAAGTA	2	12	1155418	1155429	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017208	CTTTTT	2	12	1184769	1184780	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017208	AAAGGG	2	12	1188639	1188650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017208	GAAATA	2	12	1203639	1203650	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017208	TTTTTC	2	12	1226471	1226482	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017208	AAGTAT	2	12	1232871	1232882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017208	GAAGGG	2	12	1242140	1242151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017208	ATTTGA	2	12	1278498	1278509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017208	AGAAAT	2	12	1279394	1279405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017208	TTACGT	2	12	1279619	1279630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017208	GGAGAG	2	12	1281730	1281741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017208	AAATAA	2	12	1284077	1284088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017208	AAAGAA	2	12	1284882	1284893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017208	GAAAAA	2	12	1313719	1313730	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017208	AGGATA	2	12	1338365	1338376	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017208	AAAAGT	2	12	1350455	1350466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017208	AATAAA	2	12	1359387	1359398	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017208	TCTTTT	2	12	1381972	1381983	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017208	ATACAA	2	12	1407612	1407623	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017208	GTATAT	2	12	1434453	1434464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017208	TGGAAT	2	12	1440361	1440372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017208	TTATCA	2	12	1443628	1443639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017208	TTTTAT	2	12	1486773	1486784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017208	GATGTA	2	12	1535753	1535764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017208	AGGTAG	2	12	1538211	1538222	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017208	ATAAGT	2	12	1588888	1588899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017208	AAAAAT	2	12	1605662	1605673	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_017208	AAGCGG	2	12	5048531	5048542	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
380	NC_017208	TTAAAC	2	12	5049122	5049133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
381	NC_017208	TAAAAA	2	12	5065339	5065350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_017208	TCATTT	2	12	5093128	5093139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.