MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 chromosome

Total Repeats: 26121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017208	T	8	8	8	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017208	TTATC	2	10	60	69	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017208	T	7	7	135	141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017208	ACG	2	6	167	172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017208	TATT	2	8	215	222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017208	TTG	2	6	234	239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017208	AGG	2	6	270	275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017208	TAGA	2	8	1677	1684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017208	CTATTA	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017208	CTA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017208	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017208	ATTA	2	8	1760	1767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017208	TTTA	2	8	3025	3032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017208	TCT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017208	ATGT	2	8	6439	6446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017208	AGG	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017208	TCT	2	6	8936	8941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017208	GAA	2	6	8942	8947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017208	G	6	6	8953	8958	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017208	T	7	7	8974	8980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017208	ATA	3	9	8981	8989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017208	TA	3	6	9012	9017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017208	GA	3	6	9037	9042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017208	TTG	2	6	9063	9068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017208	ATA	2	6	9075	9080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017208	AT	3	6	9088	9093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017208	AAACA	2	10	9134	9143	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017208	AAC	2	6	9144	9149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017208	ATTTTT	2	12	9161	9172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017208	AACT	2	8	9185	9192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017208	GGC	2	6	9230	9235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017208	AAG	2	6	9283	9288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017208	GCG	2	6	9292	9297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017208	GGC	2	6	9404	9409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017208	ATGG	2	8	9424	9431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017208	GCA	2	6	9551	9556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017208	CGC	2	6	9598	9603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017208	GTGA	2	8	9604	9611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017208	TGT	2	6	9637	9642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017208	GAA	2	6	9647	9652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017208	CAG	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017208	ATT	2	6	9761	9766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017208	GC	4	8	9776	9783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017208	GGT	2	6	9785	9790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017208	AGA	2	6	9861	9866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017208	GGA	2	6	9911	9916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017208	GAA	2	6	10175	10180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017208	GGT	2	6	10249	10254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017208	GTC	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017208	TCGTG	2	10	10272	10281	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017208	CAT	2	6	10331	10336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017208	GGA	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017208	ATC	2	6	10399	10404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017208	AC	3	6	10426	10431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017208	AC	3	6	10595	10600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017208	CAC	2	6	10610	10615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017208	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017208	GAT	2	6	10681	10686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017208	CCT	2	6	10737	10742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017208	TGA	2	6	10756	10761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017208	TCA	2	6	10769	10774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017208	TTTCGT	2	12	10790	10801	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017208	TTCAA	2	10	10815	10824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017208	AGCC	2	8	10884	10891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017208	GAT	2	6	10907	10912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017208	CCT	2	6	10963	10968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017208	TGA	2	6	10982	10987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017208	TCA	2	6	10995	11000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017208	GA	3	6	11035	11040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017208	TC	3	6	11045	11050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017208	AT	3	6	11051	11056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017208	ATGT	2	8	11059	11066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017208	T	6	6	11099	11104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017208	GTAA	2	8	11204	11211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017208	ATGGT	2	10	11256	11265	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017208	AGAC	2	8	11294	11301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017208	GGA	2	6	11329	11334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017208	GCG	2	6	11363	11368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017208	CGT	2	6	11476	11481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017208	AAC	2	6	11489	11494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017208	TC	3	6	11514	11519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017208	CGG	2	6	11538	11543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017208	GGA	2	6	11570	11575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017208	CACG	2	8	11900	11907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017208	GT	3	6	12173	12178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017208	AGC	2	6	12232	12237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017208	ACC	2	6	12310	12315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017208	TGG	2	6	12391	12396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017208	ACA	2	6	12541	12546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017208	ACC	2	6	12562	12567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017208	AGA	2	6	12605	12610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017208	GAG	2	6	12792	12797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017208	GA	3	6	12815	12820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017208	CT	3	6	12932	12937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017208	CTGAA	2	10	13020	13029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017208	CGG	2	6	13041	13046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017208	TGG	2	6	13303	13308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017208	CCT	2	6	13399	13404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017208	GGT	2	6	13535	13540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017208	CGT	2	6	13730	13735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017208	CGT	2	6	13756	13761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017208	GAG	2	6	13779	13784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017208	GTT	2	6	13833	13838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017208	C	6	6	13906	13911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_017208	GAT	2	6	13957	13962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017208	ATA	2	6	14039	14044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017208	TGA	2	6	14093	14098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017208	AG	3	6	14103	14108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017208	CT	3	6	14145	14150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017208	AT	4	8	15276	15283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017208	CTA	2	6	15317	15322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017208	ATA	2	6	15323	15328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017208	TA	3	6	16825	16830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017208	T	8	8	16862	16869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017208	CTC	2	6	18243	18248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017208	T	8	8	18260	18267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017208	AGT	2	6	18299	18304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017208	TAGT	2	8	18319	18326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017208	G	6	6	18385	18390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017208	TGT	2	6	19981	19986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017208	AG	3	6	19994	19999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017208	TGGT	2	8	20004	20011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017208	ATCC	2	8	20037	20044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017208	TGGAA	2	10	20045	20054	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017208	TA	3	6	20171	20176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017208	T	6	6	20187	20192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017208	TAAAA	2	10	20201	20210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017208	GGA	2	6	20211	20216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017208	TA	3	6	20218	20223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017208	TTTCC	2	10	21578	21587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017208	ATTT	2	8	21593	21600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017208	TAG	2	6	21601	21606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017208	ATATT	2	10	21631	21640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017208	GGC	2	6	21701	21706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017208	CG	3	6	21713	21718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017208	CCT	2	6	21737	21742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017208	ACA	2	6	21756	21761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017208	TTTTA	2	10	21810	21819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017208	TTA	2	6	21858	21863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017208	GAT	2	6	21878	21883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017208	TCC	2	6	23653	23658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017208	ACT	2	6	23681	23686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017208	ATT	2	6	23703	23708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017208	AGCG	2	8	23724	23731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017208	AT	3	6	23763	23768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017208	CT	3	6	24322	24327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017208	T	6	6	24327	24332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017208	GTA	2	6	24372	24377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017208	TAAG	2	8	25097	25104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017208	GGAA	2	8	25159	25166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017208	GCA	2	6	25167	25172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017208	TCT	2	6	25182	25187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017208	TA	3	6	25270	25275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017208	T	6	6	25309	25314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017208	TAA	2	6	25357	25362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017208	ATA	2	6	25368	25373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017208	GAGG	2	8	25380	25387	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017208	AGG	2	6	27095	27100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017208	AATT	2	8	27101	27108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017208	TATTT	2	10	28314	28323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017208	GTT	2	6	28339	28344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017208	TTA	2	6	28345	28350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017208	T	6	6	28389	28394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017208	TTGTC	2	10	28396	28405	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_017208	TCAT	2	8	28427	28434	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_017208	AGG	2	6	28436	28441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017208	ATT	2	6	28718	28723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017208	T	7	7	28730	28736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017208	TAA	2	6	28774	28779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017208	A	6	6	28799	28804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017208	GTT	2	6	28805	28810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017208	AAAC	2	8	28882	28889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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177	NC_017208	GGC	2	6	28973	28978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_017208	GCA	2	6	29294	29299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_017208	TGT	2	6	29380	29385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017208	GAA	2	6	29390	29395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017208	CAG	2	6	29463	29468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_017208	GGA	2	6	29654	29659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017208	GTC	2	6	30006	30011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_017208	CAT	2	6	30074	30079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_017208	GGA	2	6	30118	30123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_017208	T	6	6	43419	43424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017208	GTA	2	6	43457	43462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_017208	AAAT	2	8	44367	44374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017208	ATG	2	6	44379	44384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017208	TCTAT	2	10	44419	44428	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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462	NC_017208	ACC	2	6	85584	85589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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481	NC_017208	CT	3	6	87168	87173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_017208	T	7	7	89997	90003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_017208	TA	3	6	90006	90011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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