MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 chromosome

Total Repeats: 26121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017208	TCA	2	6	272852	272857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017208	GA	3	6	272892	272897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017208	TC	3	6	272902	272907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_017208	AT	3	6	272908	272913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017208	ATGT	2	8	272916	272923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017208	T	6	6	272956	272961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017208	GTAA	2	8	273061	273068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017208	ATGGT	2	10	273113	273122	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017208	AGAC	2	8	273151	273158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_017208	GGA	2	6	273186	273191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017208	GCG	2	6	273220	273225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017208	CGT	2	6	273333	273338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017208	AAC	2	6	273346	273351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017208	TC	3	6	273371	273376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_017208	CGG	2	6	273395	273400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017208	GGA	2	6	273427	273432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017208	CACG	2	8	273757	273764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_017208	GT	3	6	274030	274035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017208	AGC	2	6	274089	274094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017208	ACC	2	6	274167	274172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_017208	TGG	2	6	274248	274253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017208	ACA	2	6	274398	274403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017208	ACC	2	6	274419	274424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_017208	AGA	2	6	274462	274467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017208	GAG	2	6	274649	274654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017208	GA	3	6	274672	274677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017208	CT	3	6	274789	274794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_017208	CTGAA	2	10	274877	274886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1529	NC_017208	CGG	2	6	274898	274903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017208	TGG	2	6	275160	275165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017208	CCT	2	6	275256	275261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_017208	GGT	2	6	275392	275397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017208	CGT	2	6	275587	275592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017208	CGT	2	6	275613	275618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017208	GAG	2	6	275636	275641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017208	GTT	2	6	275690	275695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017208	C	6	6	275763	275768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1538	NC_017208	GAT	2	6	275814	275819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017208	ATA	2	6	275896	275901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017208	TGA	2	6	275949	275954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017208	AG	3	6	275959	275964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017208	CT	3	6	276001	276006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_017208	CTT	2	6	276105	276110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017208	TA	3	6	276131	276136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017208	TTTC	2	8	276149	276156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_017208	TATTT	2	10	276187	276196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017208	AAGAT	2	10	276201	276210	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017208	GT	3	6	276217	276222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017208	GTT	2	6	276235	276240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017208	T	7	7	276239	276245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017208	AAG	2	6	276261	276266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017208	ATA	2	6	276286	276291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017208	TAG	2	6	276316	276321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017208	GTT	2	6	277256	277261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017208	TA	3	6	277267	277272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017208	ATA	2	6	277289	277294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017208	T	7	7	277315	277321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017208	TGTA	2	8	277354	277361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017208	AGA	2	6	278192	278197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017208	TA	3	6	278229	278234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017208	AGA	2	6	278240	278245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017208	T	6	6	278277	278282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017208	A	6	6	278283	278288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017208	TAAC	2	8	278386	278393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_017208	AGT	2	6	278432	278437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017208	AAAC	2	8	278455	278462	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_017208	ATTTTT	2	12	278477	278488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017208	AACT	2	8	278501	278508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_017208	GGC	2	6	278546	278551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017208	AAG	2	6	278599	278604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017208	GCG	2	6	278608	278613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017208	GGC	2	6	278720	278725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_017208	ATGG	2	8	278740	278747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017208	GCA	2	6	278867	278872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017208	CGC	2	6	278914	278919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_017208	GTGA	2	8	278920	278927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017208	TGT	2	6	278953	278958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017208	GAA	2	6	278963	278968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017208	CAG	2	6	279036	279041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_017208	ATT	2	6	279077	279082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017208	GC	4	8	279092	279099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_017208	GGT	2	6	279101	279106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017208	AGA	2	6	279177	279182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017208	GGA	2	6	279227	279232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017208	GAA	2	6	279491	279496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017208	GGT	2	6	279565	279570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017208	GTC	2	6	279579	279584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_017208	TCGTG	2	10	279588	279597	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_017208	CAT	2	6	279647	279652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_017208	GGA	2	6	279691	279696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017208	ATC	2	6	279715	279720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1593	NC_017208	AC	3	6	279911	279916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1596	NC_017208	GAT	2	6	279997	280002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_017208	TGA	2	6	280072	280077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017208	TCA	2	6	280085	280090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_017208	TTCAA	2	10	280131	280140	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1602	NC_017208	AGCC	2	8	280200	280207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_017208	GAT	2	6	280223	280228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017208	CCT	2	6	280279	280284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_017208	TGA	2	6	280298	280303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017208	TCA	2	6	280311	280316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017208	GA	3	6	280351	280356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017208	TC	3	6	280361	280366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_017208	AT	3	6	280367	280372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017208	ATGT	2	8	280375	280382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017208	T	6	6	280415	280420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017208	GTAA	2	8	280520	280527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017208	ATGGT	2	10	280572	280581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017208	AGAC	2	8	280610	280617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_017208	GGA	2	6	280645	280650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_017208	CGT	2	6	280792	280797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017208	AAC	2	6	280805	280810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_017208	TC	3	6	280830	280835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_017208	CGG	2	6	280854	280859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_017208	GGA	2	6	280886	280891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017208	CACG	2	8	281216	281223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_017208	GT	3	6	281489	281494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_017208	ACA	2	6	281857	281862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_017208	ACC	2	6	281878	281883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_017208	AGA	2	6	281921	281926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017208	GAG	2	6	282108	282113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017208	GA	3	6	282131	282136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017208	CT	3	6	282248	282253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_017208	CTGAA	2	10	282336	282345	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1634	NC_017208	CGG	2	6	282357	282362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017208	TGG	2	6	282619	282624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_017208	GGT	2	6	282851	282856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_017208	AGAAA	2	10	346089	346098	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

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