MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT8513

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017207	TAT	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017207	A	7	7	61	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017207	T	6	6	93	98	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017207	GAC	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017207	A	6	6	206	211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017207	T	7	7	222	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017207	CAC	2	6	376	381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017207	T	7	7	382	388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017207	T	7	7	418	424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017207	TGA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017207	A	8	8	688	695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017207	AGT	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017207	TTG	2	6	816	821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017207	TAG	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017207	A	7	7	859	865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017207	GTG	2	6	919	924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017207	ATG	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017207	T	8	8	1196	1203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017207	CGG	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017207	A	7	7	1306	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017207	T	6	6	2547	2552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017207	T	6	6	2554	2559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017207	T	6	6	2585	2590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017207	A	8	8	2636	2643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017207	A	8	8	2656	2663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017207	T	7	7	2695	2701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017207	T	6	6	2729	2734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017207	CTTT	2	8	2735	2742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017207	A	9	9	2818	2826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017207	GAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017207	A	7	7	2907	2913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017207	T	6	6	2928	2933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017207	AT	3	6	2989	2994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017207	A	6	6	4262	4267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017207	TAA	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017207	ACTG	2	8	4302	4309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017207	TTATT	2	10	4329	4338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017207	GCA	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017207	T	7	7	4376	4382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017207	TTAAAT	2	12	4408	4419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017207	ATTT	2	8	4435	4442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017207	AT	3	6	4460	4465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017207	CTA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017207	TG	3	6	4849	4854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017207	TTG	2	6	4884	4889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017207	T	6	6	4900	4905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017207	A	6	6	4974	4979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017207	AT	3	6	5008	5013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017207	AT	3	6	5016	5021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017207	ATG	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017207	A	6	6	5050	5055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017207	A	6	6	5071	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017207	A	6	6	5084	5089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017207	T	6	6	5098	5103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017207	T	7	7	5399	5405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017207	TA	3	6	5444	5449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017207	ATA	2	6	5502	5507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017207	AT	3	6	5513	5518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017207	AT	3	6	5548	5553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017207	A	6	6	5554	5559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017207	ATT	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017207	GTAA	2	8	5609	5616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017207	TGAA	2	8	5631	5638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017207	GTA	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017207	ATG	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017207	T	8	8	5965	5972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017207	TGA	2	6	6145	6150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017207	T	7	7	6182	6188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017207	TA	3	6	6258	6263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017207	AAAAT	2	10	6312	6321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017207	CAA	2	6	7585	7590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017207	ATT	2	6	7615	7620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017207	TAT	2	6	7653	7658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017207	AAT	2	6	7667	7672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017207	TATTT	3	15	8298	8312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017207	AT	3	6	8381	8386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017207	ATT	2	6	8400	8405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017207	TAG	2	6	8419	8424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017207	A	8	8	8451	8458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.