MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	GGA	2	6	355	360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017206	CAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017206	TCC	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017206	ATT	2	6	1129	1134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017206	TAA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017206	TTA	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017206	AAC	2	6	2526	2531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017206	ATT	2	6	2555	2560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017206	AAG	2	6	2605	2610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017206	GTT	2	6	2668	2673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017206	GAA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017206	AGG	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017206	CCT	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017206	TAT	2	6	3962	3967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017206	AAG	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017206	TAT	2	6	4151	4156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017206	CTT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017206	AAT	2	6	4395	4400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017206	ACA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017206	TCC	2	6	4637	4642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017206	CAT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017206	AGA	2	6	4790	4795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017206	TTA	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017206	AAT	2	6	6662	6667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017206	GAT	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017206	AGA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017206	TAA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017206	AGG	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017206	GTT	2	6	9407	9412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017206	ATT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017206	CAT	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017206	ATT	2	6	10173	10178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017206	TTC	2	6	10180	10185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017206	TGT	2	6	10285	10290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017206	ATG	2	6	10291	10296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017206	AAT	2	6	10414	10419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017206	CCT	2	6	13667	13672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017206	TAC	2	6	14076	14081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017206	AGG	2	6	14097	14102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017206	ATT	2	6	14145	14150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017206	ATA	2	6	14513	14518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017206	ACA	2	6	14728	14733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017206	TCT	2	6	14747	14752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017206	AAC	2	6	14872	14877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017206	AGA	2	6	15771	15776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017206	TAA	2	6	15799	15804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017206	AAT	2	6	15946	15951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017206	TAT	2	6	16377	16382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017206	GTA	2	6	16466	16471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017206	ATT	2	6	16593	16598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017206	AAT	2	6	16606	16611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017206	CAA	2	6	16753	16758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017206	CTT	2	6	16894	16899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017206	TCC	2	6	18066	18071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017206	AAC	2	6	18439	18444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017206	TTC	2	6	18447	18452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017206	CAT	2	6	18509	18514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017206	TTC	2	6	18566	18571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017206	TTC	2	6	18711	18716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017206	CCT	2	6	19096	19101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017206	ACC	2	6	19201	19206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017206	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017206	TGA	2	6	19280	19285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017206	TTC	2	6	19296	19301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017206	GTA	2	6	19316	19321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017206	TTA	2	6	19326	19331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017206	AGG	2	6	19338	19343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017206	ACA	2	6	19344	19349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017206	TAT	2	6	21592	21597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017206	ATA	2	6	21762	21767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017206	TAT	2	6	22059	22064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017206	TTA	3	9	22066	22074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017206	TAT	2	6	22991	22996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017206	ATA	2	6	23025	23030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017206	ATA	2	6	23073	23078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017206	TCA	2	6	23112	23117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017206	TTA	2	6	23865	23870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017206	TTA	2	6	24032	24037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017206	TAT	2	6	24121	24126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017206	GAG	2	6	24127	24132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017206	AAG	2	6	25563	25568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017206	AAC	2	6	26771	26776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017206	ATC	2	6	26857	26862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017206	TCT	2	6	26893	26898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017206	AAC	2	6	26912	26917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017206	GTT	2	6	26922	26927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017206	CAC	2	6	27078	27083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017206	TTC	2	6	27160	27165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017206	TAA	2	6	27175	27180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017206	TTC	2	6	27193	27198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017206	ATT	2	6	27317	27322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017206	CTT	2	6	27385	27390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017206	TCT	2	6	27456	27461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017206	TCT	2	6	27583	27588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017206	ATT	2	6	27629	27634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017206	TTC	2	6	27802	27807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017206	GTT	2	6	27835	27840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017206	TGA	2	6	27947	27952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017206	TAG	2	6	28915	28920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017206	ACG	2	6	28976	28981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017206	TCA	2	6	29834	29839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017206	ATT	2	6	29900	29905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017206	TAA	2	6	31674	31679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017206	TAA	2	6	31796	31801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017206	ATT	2	6	31813	31818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017206	AAT	2	6	31906	31911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017206	ATT	2	6	31992	31997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017206	TTA	2	6	32461	32466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017206	ATT	2	6	32544	32549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017206	CTA	2	6	32606	32611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017206	TTG	2	6	33065	33070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017206	TTA	2	6	34077	34082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017206	TCC	2	6	34296	34301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017206	CCT	2	6	34892	34897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017206	ATT	2	6	35152	35157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017206	TAT	2	6	35237	35242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017206	ATT	2	6	35243	35248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017206	ATT	2	6	35327	35332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017206	AGA	2	6	35371	35376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017206	GGT	2	6	35519	35524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017206	CTA	2	6	37653	37658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017206	GAA	2	6	37695	37700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017206	TAT	2	6	41286	41291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017206	TAA	2	6	41561	41566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017206	CAT	2	6	41610	41615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017206	CTT	2	6	41622	41627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017206	TGG	2	6	41679	41684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017206	ATT	2	6	41989	41994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017206	TAT	2	6	42019	42024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017206	ACA	2	6	42074	42079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017206	TTG	2	6	42096	42101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017206	GAT	2	6	42759	42764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017206	AAT	2	6	43175	43180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017206	GAA	2	6	43520	43525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017206	ACG	2	6	43890	43895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017206	TCC	2	6	44927	44932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017206	GAA	2	6	45147	45152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017206	ATA	2	6	45558	45563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017206	TAC	2	6	45584	45589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017206	GCG	2	6	45645	45650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017206	CAT	2	6	45979	45984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017206	TTA	2	6	46042	46047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017206	TTA	2	6	46090	46095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.