MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT281

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017203	CATAT	2	10	738	747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017203	ATACA	2	10	1372	1381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017203	ATATT	2	10	1841	1850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017203	TAAAT	2	10	3152	3161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017203	AGTAA	2	10	4079	4088	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017203	TATTG	2	10	4318	4327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017203	AATAT	2	10	4640	4649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017203	TACAT	2	10	4931	4940	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017203	AACAC	2	10	5003	5012	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017203	TAATA	2	10	5648	5657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017203	ATTAC	2	10	6083	6092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017203	TTTAC	2	10	7082	7091	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017203	AATTA	2	10	7714	7723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017203	AATTT	2	10	7738	7747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017203	TATGT	2	10	7798	7807	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017203	ATTTC	2	10	10656	10665	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017203	GCTTT	2	10	12257	12266	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017203	ATGAT	2	10	12725	12734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017203	ATTGA	2	10	13952	13961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017203	AAAAT	2	10	14394	14403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017203	AATCA	2	10	15561	15570	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017203	CAAAA	2	10	16145	16154	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017203	TGTAA	2	10	16980	16989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017203	AGCTT	2	10	19735	19744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017203	CTTTA	2	10	22628	22637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017203	ATAAA	2	10	24631	24640	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017203	AATTA	2	10	27820	27829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017203	AATTT	2	10	29006	29015	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017203	CTATA	2	10	35276	35285	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017203	TAGAT	2	10	35472	35481	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017203	ACTTA	2	10	35520	35529	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017203	TATAA	2	10	35998	36007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017203	GCAAT	2	10	36258	36267	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017203	TTGTT	2	10	42485	42494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017203	CATAT	2	10	45101	45110	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017203	AATTT	2	10	47477	47486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017203	ATTTT	2	10	47776	47785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017203	TATAG	2	10	49552	49561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017203	AAAAT	2	10	57574	57583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017203	ATTTT	2	10	64883	64892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017203	ATAAA	2	10	65720	65729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017203	AAAAT	2	10	66178	66187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017203	CATTT	2	10	77162	77171	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017203	CTTGA	2	10	81192	81201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017203	CCTTC	2	10	83633	83642	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_017203	TAAAA	2	10	106399	106408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017203	CACAA	2	10	108056	108065	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017203	TATTT	2	10	116899	116908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017203	TAAAT	2	10	124697	124706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017203	TAGGT	2	10	128883	128892	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017203	AATCA	2	10	132545	132554	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017203	TCACC	2	10	134259	134268	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_017203	TTTGA	2	10	144083	144092	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017203	GAGAA	2	10	156555	156564	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017203	TTTTA	2	10	159306	159315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017203	AATCT	2	10	161053	161062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017203	TATAT	2	10	170419	170428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017203	AGTAG	2	10	173226	173235	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017203	AAAAT	2	10	175169	175178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017203	ATATA	2	10	178645	178654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017203	AAATT	2	10	183421	183430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017203	GATAA	2	10	183491	183500	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017203	GATAA	2	10	184299	184308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017203	TACTG	2	10	184750	184759	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017203	TTGTG	2	10	185242	185251	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017203	AGGAG	2	10	189050	189059	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017203	TATCA	2	10	197355	197364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017203	AAAAG	2	10	198791	198800	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017203	ATGTT	2	10	199876	199885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017203	TATGA	2	10	202936	202945	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017203	TCATT	2	10	205868	205877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017203	CTTTT	2	10	209885	209894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017203	ATCAA	2	10	209918	209927	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017203	TAATC	2	10	210776	210785	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017203	TAATA	2	10	212020	212029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017203	GCTTT	2	10	215385	215394	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017203	TAAAC	2	10	216772	216781	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017203	AATAA	2	10	216982	216991	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017203	TTTAA	2	10	220201	220210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017203	ATATA	2	10	220589	220598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017203	ATGAA	2	10	225340	225349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017203	AAACG	2	10	229909	229918	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017203	TGGGA	2	10	233406	233415	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017203	TGGAA	2	10	233856	233865	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017203	TGAAA	2	10	235763	235772	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017203	GAAAA	2	10	239160	239169	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017203	TAAAA	2	10	241944	241953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017203	AAAAT	2	10	243655	243664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017203	GAAAG	2	10	246187	246196	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017203	GTAAA	2	10	247225	247234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017203	AAAAT	2	10	247504	247513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017203	CATTC	2	10	247793	247802	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017203	AAAAT	2	10	248117	248126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017203	TTTGG	2	10	249846	249855	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017203	TAACA	2	10	250066	250075	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017203	TGTAA	2	10	250574	250583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017203	AAAGC	2	10	251022	251031	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017203	TTTTG	2	10	256576	256585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017203	AAATA	2	10	256706	256715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017203	TTAAT	2	10	260604	260613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017203	AAAAT	2	10	260930	260939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017203	TAAAA	2	10	260953	260962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017203	ATTAA	2	10	263554	263563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017203	AAACT	2	10	280323	280332	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.