MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	ATAA	2	8	89	96	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017202	AGAA	2	8	5639	5646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017202	AGAA	2	8	7467	7474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017202	TCGT	2	8	8363	8370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017202	TGAA	2	8	8971	8978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017202	TAAT	2	8	12140	12147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017202	TACT	2	8	12195	12202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017202	ATAA	2	8	15278	15285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017202	GATG	2	8	23159	23166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017202	ATTA	2	8	23258	23265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017202	TTCT	2	8	23616	23623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017202	TAAT	2	8	25395	25402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017202	TTTA	2	8	33666	33673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017202	GAAA	2	8	33879	33886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017202	TACA	2	8	33958	33965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017202	ATAG	2	8	36348	36355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017202	ATTT	2	8	36837	36844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017202	TTAT	2	8	36850	36857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017202	GATG	2	8	36964	36971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017202	ATTT	2	8	40767	40774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017202	AATT	2	8	45536	45543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017202	TTGT	2	8	45599	45606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017202	TACA	2	8	46666	46673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017202	TTTA	2	8	46734	46741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017202	GTTC	2	8	46751	46758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017202	ATCA	2	8	49978	49985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017202	TGAG	2	8	51389	51396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017202	AATA	2	8	53297	53304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017202	ATAA	2	8	55648	55655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017202	TAAT	2	8	55826	55833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017202	ACAA	2	8	55977	55984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017202	TAAA	2	8	56085	56092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017202	ATTT	2	8	57148	57155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017202	CTAT	2	8	57687	57694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017202	TAAC	2	8	63927	63934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017202	AAGC	2	8	66226	66233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017202	CTCC	2	8	68916	68923	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017202	TAAA	2	8	68961	68968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017202	GATT	2	8	68990	68997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017202	AATT	2	8	69886	69893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017202	ATAA	2	8	71280	71287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017202	CCCA	2	8	71342	71349	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017202	ACAA	2	8	72827	72834	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017202	ATTT	2	8	74947	74954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017202	TTTA	2	8	74992	74999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017202	ATTT	2	8	75705	75712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017202	AATT	2	8	75763	75770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017202	CAGT	2	8	77761	77768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017202	GCTT	2	8	80980	80987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017202	GAAT	2	8	85596	85603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017202	TTAA	2	8	89979	89986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017202	TAAA	2	8	90029	90036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017202	GTTT	2	8	95901	95908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017202	TCTA	2	8	95910	95917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017202	TTAT	2	8	99189	99196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017202	TTGA	2	8	104940	104947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017202	ATAA	2	8	107398	107405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017202	TTCT	2	8	107424	107431	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017202	AAGG	2	8	108860	108867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017202	ATAA	2	8	108939	108946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017202	TATT	2	8	109972	109979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017202	TAAA	2	8	109999	110006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017202	TATT	2	8	110023	110030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017202	TTTG	2	8	110194	110201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017202	ATTT	2	8	110206	110213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017202	AAAT	2	8	110565	110572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017202	TCAA	2	8	110775	110782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017202	AAAT	2	8	112108	112115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017202	ATCA	2	8	112125	112132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017202	AGCA	2	8	116273	116280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017202	GAAT	2	8	116538	116545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017202	TTGT	2	8	116564	116571	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017202	GAAT	2	8	116704	116711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017202	GAAA	2	8	119711	119718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017202	AGCC	2	8	119893	119900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017202	TTTA	2	8	119952	119959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017202	ATTT	2	8	119969	119976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017202	TAAA	2	8	123540	123547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017202	ATCA	2	8	124602	124609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017202	TGAA	2	8	124644	124651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017202	TCCT	2	8	125174	125181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017202	TTAT	2	8	127425	127432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.