MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB28

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017199	TGATA	2	10	1381	1390	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017199	GGGGT	2	10	1432	1441	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017199	CTACA	2	10	1601	1610	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017199	TAAAG	2	10	10257	10266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017199	TGGAT	2	10	10362	10371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017199	TATTG	2	10	11465	11474	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017199	TCTGT	2	10	24484	24493	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017199	TGTCA	2	10	25451	25460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017199	TCTTT	2	10	26630	26639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017199	CATCC	2	10	29181	29190	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017199	GTTTT	2	10	33554	33563	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017199	TTTTA	2	10	43837	43846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017199	ATTCT	2	10	60000	60009	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017199	TTTTA	2	10	63579	63588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017199	TGTTA	2	10	67960	67969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017199	TCTAC	2	10	70135	70144	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017199	TATAA	2	10	73677	73686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017199	AAATA	2	10	76068	76077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017199	TTAAT	2	10	78165	78174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017199	TATAT	2	10	87092	87101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017199	ATATT	2	10	87645	87654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017199	TAAAT	2	10	89019	89028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017199	TAAAA	2	10	89209	89218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017199	GAAAT	2	10	92123	92132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017199	AAATT	2	10	97734	97743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017199	CGAAT	2	10	103356	103365	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017199	AATAA	2	10	105385	105394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017199	ATTTA	2	10	107974	107983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017199	AGTAT	2	10	108090	108099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017199	TAAAA	2	10	108165	108174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017199	GTCAT	2	10	114527	114536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017199	AATAA	2	10	126477	126486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017199	ATCAA	2	10	126499	126508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017199	TTAAG	2	10	130370	130379	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017199	ATATT	2	10	137453	137462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017199	TATAC	2	10	138126	138135	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017199	AACCC	2	10	138162	138171	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.