MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. natto BEST195

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017196	TTTCCC	2	12	3136	3147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017196	ATAAAT	2	12	45398	45409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017196	AAGTAA	2	12	155216	155227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017196	TTCATT	2	12	203063	203074	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017196	CTGTTT	2	12	228228	228239	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017196	AGTTTT	2	12	234158	234169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017196	AATACT	2	12	238458	238469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017196	GTTTTT	2	12	279484	279495	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017196	AAATGA	2	12	303898	303909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017196	TTCATT	2	12	332477	332488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017196	TTTTTA	2	12	365233	365244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017196	ATTTTT	2	12	373588	373599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017196	CAGCGG	2	12	375151	375162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017196	GTTCAG	2	12	381290	381301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017196	ATGAAA	2	12	386284	386295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017196	CTCAGC	2	12	389349	389360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017196	ATGATA	3	18	428593	428610	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017196	TTTTTA	2	12	447048	447059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017196	TTTAGA	2	12	478653	478664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017196	ATTTTT	2	12	519430	519441	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017196	AATGGT	2	12	538739	538750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017196	ATCCAA	2	12	539234	539245	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017196	AAGTTC	2	12	550962	550973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017196	TTATAA	2	12	565930	565941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017196	ATAAAT	2	12	594158	594169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017196	TTCAAA	2	12	603667	603678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017196	TTTTTA	2	12	651852	651863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017196	TTTTGA	2	12	686866	686877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017196	CTTTCT	2	12	696407	696418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017196	ACATAT	2	12	775320	775331	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017196	TACTTT	2	12	829532	829543	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017196	GTATCA	2	12	834804	834815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017196	GAACAA	2	12	923126	923137	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017196	GTGTTT	2	12	932309	932320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017196	TTTTAT	2	12	932447	932458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017196	GCGGAA	2	12	940381	940392	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017196	TTTATT	2	12	969652	969663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017196	GAAATA	2	12	973809	973820	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017196	TTTAGA	2	12	974090	974101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017196	ATGTGA	2	12	975099	975110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017196	TAAAAA	2	12	986431	986442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017196	CTTTTT	2	12	1005290	1005301	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017196	TCTTTT	2	12	1072052	1072063	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017196	CGGAAG	2	12	1072936	1072947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017196	GAAAAA	2	12	1092173	1092184	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017196	GAATTT	2	12	1101372	1101383	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017196	CTTTTT	2	12	1112299	1112310	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017196	TTTTAT	2	12	1124106	1124117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017196	CGGACC	2	12	1155380	1155391	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017196	GGTTAA	2	12	1218903	1218914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017196	GCGGTG	2	12	1263014	1263025	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017196	CGTGAT	2	12	1270203	1270214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017196	ACAAAA	2	12	1272979	1272990	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017196	TTTCAC	2	12	1287791	1287802	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017196	AATTCA	2	12	1396993	1397004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017196	ATAATT	2	12	1458712	1458723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017196	AAAGGA	2	12	1469244	1469255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017196	ATCATT	2	12	1489068	1489079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017196	ATCATT	2	12	1492471	1492482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017196	TTTGCT	2	12	1502254	1502265	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017196	ATCCAA	2	12	1545685	1545696	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017196	AATATG	2	12	1730998	1731009	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017196	TCCTTC	2	12	1749758	1749769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017196	ATCACG	2	12	1796523	1796534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017196	GCACCT	2	12	1797465	1797476	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017196	CTTGCC	2	12	1871165	1871176	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017196	GATTTT	2	12	1871418	1871429	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017196	GCTTAG	2	12	1883288	1883299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017196	CATTAT	2	12	1898508	1898519	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017196	CATCAC	2	12	1898614	1898625	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017196	ATCGAA	2	12	1898896	1898907	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017196	TGAAAT	2	12	1920402	1920413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017196	TTTTAA	2	12	1936289	1936300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017196	AATCGG	2	12	1964431	1964442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017196	ACTTGA	2	12	1965617	1965628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017196	GTCCCT	2	12	1972188	1972199	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017196	AAGAGA	2	12	1979138	1979149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017196	AAGTTC	2	12	1995323	1995334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017196	TAATGC	2	12	2008129	2008140	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017196	AATCCG	2	12	2028379	2028390	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017196	CTTATC	2	12	2085532	2085543	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017196	TTATGT	2	12	2108355	2108366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017196	TTATTT	2	12	2110336	2110347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017196	TATTTC	2	12	2203921	2203932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017196	ATCTTC	2	12	2234877	2234888	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017196	TTTCGA	2	12	2245914	2245925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017196	CTTTTC	2	12	2328153	2328164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017196	TTCTAA	2	12	2402913	2402924	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017196	TGACTT	2	12	2429011	2429022	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017196	ACAGAC	2	12	2455902	2455913	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017196	TATTCT	2	12	2465520	2465531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017196	CTCTTC	2	12	2474386	2474397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017196	GTTTGT	2	12	2474942	2474953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017196	GATTTT	2	12	2573578	2573589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017196	GTTCAC	2	12	2576842	2576853	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017196	CAAAAA	2	12	2616735	2616746	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017196	CGTTCA	2	12	2660381	2660392	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017196	ATCTTA	2	12	2669497	2669508	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017196	CCCTCT	2	12	2679984	2679995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017196	CTCTTT	2	12	2728399	2728410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017196	TTTAAG	2	12	2755184	2755195	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017196	TATTCA	2	12	2755831	2755842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017196	TGATTT	2	12	2773748	2773759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017196	CTTATC	2	12	2808340	2808351	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017196	TAAAAA	2	12	2824698	2824709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017196	AAAAGA	2	12	2851205	2851216	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017196	CTTATA	2	12	2934466	2934477	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017196	AAAAAG	2	12	2986076	2986087	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017196	ATTATC	2	12	3055015	3055026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017196	GAATAG	2	12	3074727	3074738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017196	CGAATG	2	12	3077451	3077462	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017196	GCCTCC	2	12	3105905	3105916	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017196	AAAACA	2	12	3162354	3162365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017196	CCTAGG	2	12	3162407	3162418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017196	AAGTAA	2	12	3163171	3163182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017196	AAAAAC	2	12	3233273	3233284	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017196	AAATGT	2	12	3245684	3245695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017196	TGATTC	2	12	3279205	3279216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017196	CCTTTT	2	12	3280397	3280408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017196	CAAAAA	2	12	3320406	3320417	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017196	GAAGTT	2	12	3321861	3321872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017196	CTCAGT	2	12	3341206	3341217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017196	AAACAT	2	12	3422835	3422846	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017196	CTTTTT	2	12	3428752	3428763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017196	CAGTAC	2	12	3474821	3474832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017196	AAAAAC	2	12	3490188	3490199	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017196	GTATAT	2	12	3490947	3490958	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.