MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens XH7 chromosome

Total Repeats: 495

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017191	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017191	AAAAG	2	10	385	394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017191	ATTAT	2	10	1911	1920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017191	AAGAA	2	10	18600	18609	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017191	GATAT	2	10	26555	26564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017191	TCGTG	2	10	27767	27776	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017191	GGACG	2	10	28641	28650	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017191	TTTTG	2	10	49328	49337	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017191	TAAAA	2	10	78981	78990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017191	TCGTG	2	10	87787	87796	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017191	GGACG	2	10	88487	88496	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017191	TTACG	2	10	110244	110253	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017191	TAAAA	2	10	110884	110893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017191	AAACA	2	10	138701	138710	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017191	TTGTG	2	10	144107	144116	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017191	TGCTT	2	10	144886	144895	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017191	CGGCC	2	10	148527	148536	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017191	TCGTG	2	10	151983	151992	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017191	GGACG	2	10	152683	152692	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017191	TTTTA	2	10	155728	155737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017191	ATTTT	2	10	156545	156554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017191	TCGTG	2	10	157893	157902	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017191	GGACG	2	10	158595	158604	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017191	AAATT	2	10	214843	214852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017191	GAATA	2	10	231038	231047	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017191	TAATT	2	10	240423	240432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017191	CGTTT	2	10	240491	240500	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017191	GCAAA	2	10	242757	242766	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017191	AAATC	2	10	243549	243558	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017191	CTTTT	2	10	248628	248637	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017191	ACAGG	2	10	264964	264973	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017191	GAAGG	2	10	308976	308985	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017191	TATCA	2	10	344498	344507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017191	AGGGA	2	10	394718	394727	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017191	TGATT	2	10	403268	403277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017191	AAGAA	2	10	413514	413523	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017191	CTATA	2	10	414805	414814	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017191	GGACG	2	10	424988	424997	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017191	TTTAT	2	10	429587	429596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017191	AAAAC	2	10	435300	435309	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017191	TCTTT	2	10	437653	437662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017191	ATAAA	2	10	453619	453628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017191	ATTTT	2	10	472760	472769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017191	TAAAT	2	10	474810	474819	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017191	AATTA	2	10	474842	474851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017191	AATTG	2	10	474875	474884	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017191	TGAAG	2	10	476977	476986	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017191	TAATT	2	10	482606	482615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017191	CAACT	2	10	482709	482718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017191	TGAAG	2	10	483326	483335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017191	CTGTA	2	10	483341	483350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017191	GCTAG	2	10	484160	484169	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017191	CTATT	2	10	484191	484200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017191	AAAAT	2	10	484966	484975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017191	AGAAA	2	10	487279	487288	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017191	TTGTT	2	10	495586	495595	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017191	AGAAA	2	10	496347	496356	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017191	TATCT	2	10	501891	501900	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017191	CTGAA	2	10	505322	505331	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017191	TAAAC	2	10	512157	512166	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017191	ATAAA	2	10	518192	518201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017191	AAAGG	2	10	524037	524046	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017191	CAATT	2	10	548067	548076	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017191	GGAAG	2	10	549363	549372	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017191	TCGTG	2	10	552651	552660	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017191	GGACG	2	10	553409	553418	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017191	AAACG	2	10	556647	556656	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017191	AAGAA	2	10	572011	572020	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017191	AAAAG	2	10	572432	572441	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017191	TACAG	2	10	572829	572838	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017191	TACTG	2	10	572947	572956	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017191	CAGAG	2	10	575696	575705	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017191	CGGAT	2	10	576917	576926	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017191	AGGAA	2	10	630481	630490	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017191	TAAAA	2	10	652222	652231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017191	CAACC	2	10	656091	656100	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_017191	TTTTA	2	10	661759	661768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017191	AAATC	2	10	663366	663375	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017191	GGGTT	2	10	673521	673530	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017191	TCAAA	2	10	731685	731694	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017191	ATCAG	2	10	737017	737026	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017191	AAATA	2	10	761647	761656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017191	AACTT	2	10	761693	761702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017191	GAAAA	2	10	768145	768154	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017191	AAAAC	2	10	772860	772869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017191	AAAAG	2	10	786303	786312	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017191	ATAAA	2	10	786442	786451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017191	TGATA	2	10	791721	791730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017191	TTATA	2	10	802131	802140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017191	AAGGA	2	10	808371	808380	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017191	TCGTG	2	10	827607	827616	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017191	GGACG	2	10	828365	828374	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017191	TTTTA	2	10	831460	831469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017191	GTTTC	2	10	853853	853862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017191	ATATA	2	10	873563	873572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017191	TCCTT	2	10	876344	876353	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017191	GCAAA	2	10	876374	876383	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017191	TAAAG	2	10	877063	877072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017191	GTGAT	2	10	878813	878822	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017191	CCGCT	2	10	885850	885859	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_017191	AGTTA	2	10	892398	892407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017191	ATAAA	2	10	897042	897051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017191	GTGTG	2	10	901231	901240	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017191	AAGTC	2	10	904554	904563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017191	ATATT	2	10	906497	906506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017191	GGAAG	2	10	910444	910453	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017191	TTTTA	2	10	911846	911855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017191	GACAA	2	10	922557	922566	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017191	ATGAT	2	10	923715	923724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017191	AGTGG	2	10	938033	938042	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017191	AAATT	2	10	954838	954847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017191	ATTAC	2	10	955544	955553	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017191	CAAAA	2	10	960549	960558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017191	AGAAA	2	10	980191	980200	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017191	TTTCG	2	10	987973	987982	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017191	TGAAA	2	10	997349	997358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017191	TGTGA	2	10	998097	998106	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017191	CCTTT	2	10	998117	998126	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017191	ATTTT	2	10	998213	998222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017191	TTTAT	2	10	1010516	1010525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017191	AACAA	2	10	1042828	1042837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017191	AAATA	2	10	1047157	1047166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017191	GCCCC	2	10	1049852	1049861	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
124	NC_017191	CTTTT	2	10	1056333	1056342	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017191	GGGAG	2	10	1082739	1082748	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017191	TGTAA	2	10	1088833	1088842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017191	TAAAA	2	10	1093790	1093799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017191	AGCTG	2	10	1124632	1124641	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017191	CAGGT	2	10	1174512	1174521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017191	AAAAT	2	10	1186964	1186973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017191	ATAAA	2	10	1187092	1187101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017191	GAAAC	2	10	1188051	1188060	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017191	CATAG	2	10	1188769	1188778	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017191	AACGA	2	10	1191894	1191903	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017191	AAATT	2	10	1194363	1194372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017191	TTCTT	2	10	1202732	1202741	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017191	GTTTT	2	10	1206982	1206991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017191	TTTAA	2	10	1210355	1210364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017191	TAAAA	2	10	1218758	1218767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017191	TATAA	2	10	1219927	1219936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017191	AGGGA	2	10	1233437	1233446	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017191	TATTT	2	10	1237193	1237202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017191	TATAT	2	10	1237411	1237420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017191	TATTT	2	10	1237426	1237435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017191	CAACA	2	10	1240625	1240634	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017191	TAAAT	2	10	1242333	1242342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017191	CTAAA	2	10	1247745	1247754	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_017191	ATGCA	2	10	2152183	2152192	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017191	TATTT	2	10	2155026	2155035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.