MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 1577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	CAAG	2	8	3135	3142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017190	TAAA	2	8	9724	9731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017190	AGTC	2	8	9750	9757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017190	CCTG	2	8	9893	9900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017190	GTGA	2	8	10175	10182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017190	AGCC	2	8	11229	11236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017190	AAGC	2	8	11753	11760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017190	CACG	2	8	12449	12456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017190	GCGA	2	8	13237	13244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017190	TAGG	2	8	13812	13819	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017190	CGGG	2	8	13908	13915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017190	ATCG	2	8	14573	14580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017190	ATGA	2	8	17475	17482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017190	AAGA	2	8	18834	18841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017190	ATCT	2	8	18911	18918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017190	TGAA	2	8	26376	26383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017190	ATTT	2	8	27631	27638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017190	GCCT	2	8	27729	27736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017190	TAAG	2	8	27737	27744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017190	GGAA	2	8	27799	27806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017190	ATAA	2	8	30083	30090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017190	TAAA	2	8	31464	31471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017190	AGTC	2	8	31490	31497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017190	CCTG	2	8	31633	31640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017190	GTGA	2	8	31915	31922	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017190	AGCC	2	8	32969	32976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017190	AAGC	2	8	33493	33500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017190	CACG	2	8	34189	34196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017190	GCGA	2	8	34977	34984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017190	TAGG	2	8	35552	35559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017190	CGGG	2	8	35648	35655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017190	ATCG	2	8	36313	36320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017190	AATA	2	8	36997	37004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017190	GGAA	2	8	37642	37649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017190	AATG	2	8	40934	40941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017190	TTGT	2	8	46374	46381	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017190	AGTA	2	8	46398	46405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017190	TTTA	2	8	46551	46558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017190	TTTA	2	8	46580	46587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017190	ATAG	2	8	46642	46649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017190	CTTC	2	8	49641	49648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017190	TCTT	2	8	49675	49682	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017190	ATTC	2	8	51033	51040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017190	ATTC	2	8	52659	52666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017190	TGTA	2	8	56854	56861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017190	CCCG	2	8	60506	60513	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017190	GAGG	2	8	60559	60566	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017190	ATAA	2	8	61142	61149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017190	TTTA	2	8	70608	70615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017190	AAAC	2	8	70625	70632	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017190	GCCG	2	8	75841	75848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017190	CTGC	2	8	77903	77910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017190	TAAA	2	8	91478	91485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017190	AGTC	2	8	91504	91511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017190	CCTG	2	8	91647	91654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017190	GTGA	2	8	91929	91936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017190	AGCC	2	8	92983	92990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017190	AAGC	2	8	93333	93340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017190	CACG	2	8	94029	94036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017190	GCGA	2	8	94817	94824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017190	TAGG	2	8	95392	95399	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017190	CGGG	2	8	95488	95495	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017190	ATCG	2	8	96153	96160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017190	GATT	2	8	97044	97051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017190	AGAA	2	8	107669	107676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017190	TCTA	2	8	111707	111714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017190	AATG	2	8	112448	112455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017190	GGGA	2	8	112977	112984	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017190	AGCT	2	8	113612	113619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017190	TCAT	2	8	113630	113637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017190	TTAA	2	8	117326	117333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017190	TGAT	2	8	120621	120628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017190	TCGT	2	8	125138	125145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017190	AAAT	2	8	125229	125236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017190	GCTT	2	8	127923	127930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017190	TAAA	2	8	130320	130327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017190	TATC	2	8	133722	133729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017190	CCGC	2	8	133879	133886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017190	TACT	2	8	135635	135642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017190	TCGT	2	8	135764	135771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017190	AAAT	2	8	135951	135958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017190	AAGG	2	8	136303	136310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017190	CAAA	2	8	138211	138218	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017190	GTGA	2	8	139688	139695	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017190	ATCA	2	8	142576	142583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017190	TTTG	2	8	143896	143903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017190	TTAT	2	8	143945	143952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017190	GTAT	2	8	148884	148891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017190	TTGT	2	8	149931	149938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017190	GGGA	2	8	151462	151469	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017190	TCCT	2	8	153919	153926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017190	TAAA	2	8	155678	155685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017190	AGTC	2	8	155704	155711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017190	CCTG	2	8	155847	155854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017190	GTGA	2	8	156129	156136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017190	AGCC	2	8	157183	157190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017190	AAGC	2	8	157533	157540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017190	CACG	2	8	158229	158236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017190	GCGA	2	8	159017	159024	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017190	TAGG	2	8	159592	159599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017190	CGGG	2	8	159688	159695	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017190	ATCG	2	8	160353	160360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017190	AATG	2	8	167047	167054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017190	CATT	2	8	173508	173515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017190	AAAT	2	8	173548	173555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017190	AAGA	2	8	181680	181687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017190	CCTG	2	8	182347	182354	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017190	TTGA	2	8	189727	189734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017190	GTTT	2	8	190901	190908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017190	AATT	2	8	191161	191168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017190	AAGA	2	8	191480	191487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017190	ATAA	2	8	191735	191742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017190	GTTT	2	8	191984	191991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017190	GATT	2	8	191992	191999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017190	ATGG	2	8	192069	192076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017190	AAGA	2	8	192602	192609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017190	GTTA	2	8	193060	193067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017190	ATAA	2	8	193211	193218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017190	TATC	2	8	193257	193264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017190	AAAT	2	8	193402	193409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017190	TCTA	2	8	193657	193664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017190	AGCG	2	8	193687	193694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017190	GCAT	2	8	193910	193917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017190	AGAA	2	8	194057	194064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017190	AATT	2	8	194565	194572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017190	TTAT	2	8	195439	195446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017190	CATT	2	8	195485	195492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017190	ATTT	2	8	195507	195514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017190	GATT	2	8	195616	195623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017190	AGTT	2	8	195811	195818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017190	AAAT	2	8	195885	195892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017190	ATGA	2	8	213312	213319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017190	AAGA	2	8	213974	213981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017190	AAAT	2	8	213995	214002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017190	ATCT	2	8	220768	220775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017190	AGGG	2	8	220823	220830	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017190	CGGA	2	8	224628	224635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017190	ATAG	2	8	233677	233684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017190	TGCG	2	8	237231	237238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017190	GATG	2	8	237449	237456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017190	TGAA	2	8	239455	239462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017190	GCAA	2	8	239472	239479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017190	GTGG	2	8	240259	240266	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017190	TGAT	2	8	240654	240661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017190	GATT	2	8	240957	240964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017190	ACAT	2	8	241000	241007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017190	AGAA	2	8	242121	242128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017190	TGAT	2	8	250677	250684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017190	TTAT	2	8	250999	251006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017190	AGGA	2	8	253023	253030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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