MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 chromosome

Total Repeats: 1013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017138	CACAA	2	10	59	68	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017138	ATTTT	2	10	370	379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017138	TAAAA	2	10	2841	2850	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017138	AAATG	2	10	2859	2868	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017138	TACAT	2	10	15256	15265	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017138	TGAAT	2	10	15297	15306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017138	ATAAA	2	10	15309	15318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017138	TTTTA	2	10	20249	20258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017138	AGGAG	2	10	29628	29637	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017138	TAAAT	2	10	33841	33850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017138	GTATA	2	10	40644	40653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017138	ACTAT	2	10	49876	49885	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017138	ATTTT	2	10	68067	68076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017138	AATAA	2	10	69064	69073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017138	CAACA	2	10	90650	90659	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017138	AAAGT	2	10	111271	111280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017138	ATCTA	2	10	111977	111986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017138	CTATA	2	10	118213	118222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017138	AAAAT	2	10	121204	121213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017138	CTTAG	2	10	123397	123406	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017138	GAAGC	2	10	123940	123949	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017138	ACAAA	2	10	132675	132684	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017138	AATAA	2	10	138637	138646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017138	AAAAT	2	10	142463	142472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017138	AAGGC	2	10	148217	148226	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017138	TCTTT	2	10	148313	148322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017138	TTTTC	2	10	155422	155431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017138	TACTA	2	10	155555	155564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017138	ATAAG	2	10	161069	161078	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017138	AATGA	2	10	164643	164652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017138	ATTTG	2	10	169151	169160	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017138	TAAAA	2	10	171444	171453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017138	AAATT	2	10	179928	179937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017138	TAAAA	2	10	187815	187824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017138	AAAAT	2	10	191082	191091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017138	ATAAA	2	10	201234	201243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017138	AATTA	2	10	202902	202911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017138	ATAAA	2	10	213128	213137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017138	AAGAA	2	10	218446	218455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017138	AAAAG	2	10	219541	219550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017138	TTCTT	2	10	219561	219570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017138	GTAGT	2	10	230476	230485	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017138	AGGGG	2	10	231687	231696	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017138	TAGAA	2	10	233300	233309	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017138	AAATG	2	10	235713	235722	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017138	ATATA	2	10	241326	241335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017138	GAAGG	2	10	244727	244736	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017138	TTTTA	2	10	245342	245351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017138	CTTAC	2	10	245735	245744	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017138	AATTT	2	10	251194	251203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017138	ATAAA	2	10	258921	258930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017138	TTATT	2	10	261622	261631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017138	AATAA	2	10	264374	264383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017138	GGACA	2	10	265057	265066	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017138	CTAAA	2	10	275460	275469	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017138	ATATT	2	10	299585	299594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017138	TATGG	2	10	304854	304863	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017138	AAGAG	2	10	304872	304881	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017138	ATTTC	2	10	309762	309771	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017138	AATAG	2	10	315881	315890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017138	AAACA	2	10	326859	326868	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017138	TAGCT	2	10	334730	334739	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017138	ATTTA	2	10	337264	337273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017138	AAAGA	2	10	339679	339688	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017138	TAATT	2	10	342211	342220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017138	AATTA	2	10	346609	346618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017138	TGGAG	2	10	347359	347368	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017138	TTTTC	2	10	353677	353686	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017138	CATTT	2	10	353931	353940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017138	TCGTG	2	10	357521	357530	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017138	TATAA	2	10	361249	361258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017138	ATTAA	2	10	362193	362202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017138	GAAAA	2	10	366098	366107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017138	TAACA	2	10	381188	381197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017138	TGAAG	2	10	381533	381542	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017138	TCGTA	2	10	390921	390930	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017138	TATTT	2	10	393745	393754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017138	ACTAT	2	10	393834	393843	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017138	TGGAG	2	10	412629	412638	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017138	GAAAG	2	10	421279	421288	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017138	GAAAA	2	10	423922	423931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017138	ATAAA	2	10	429887	429896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017138	GTTAT	2	10	439401	439410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017138	GAAAT	2	10	445850	445859	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017138	ATAAA	2	10	445864	445873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017138	ATAGA	2	10	451010	451019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017138	TAAAG	2	10	464063	464072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017138	TGTTC	2	10	471544	471553	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017138	TGATA	2	10	478740	478749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017138	TGAAA	2	10	487856	487865	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017138	AGTAA	2	10	489930	489939	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017138	AAAGA	2	10	490069	490078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017138	TTTAA	2	10	500958	500967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017138	TTTTA	2	10	503668	503677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017138	TAAGA	2	10	503769	503778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017138	GAAAG	2	10	507323	507332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017138	ATAAG	2	10	509983	509992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017138	AAGAG	2	10	540725	540734	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017138	TGAAG	2	10	542577	542586	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017138	CTCAT	2	10	542805	542814	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017138	GTAAA	2	10	544903	544912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017138	ACAGA	2	10	556491	556500	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017138	TAAAT	2	10	556665	556674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017138	GAGAA	2	10	566300	566309	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017138	TATAA	2	10	576329	576338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017138	TACAT	2	10	576383	576392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017138	ATGAA	2	10	594581	594590	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017138	ATGAA	2	10	603375	603384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017138	ATAGA	2	10	609262	609271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017138	AGGGG	2	10	613992	614001	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017138	ATGAA	2	10	619669	619678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017138	TTCAT	2	10	619849	619858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017138	AAATC	2	10	620630	620639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017138	AGACG	2	10	622208	622217	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017138	TTTAA	2	10	622220	622229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017138	GCGAA	2	10	626989	626998	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017138	TCCAT	2	10	636269	636278	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017138	TCATT	2	10	643292	643301	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017138	CATAG	2	10	669868	669877	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017138	GAAAG	2	10	670669	670678	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017138	TGAAA	2	10	671271	671280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017138	TATAG	2	10	674160	674169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017138	TAGAG	2	10	677873	677882	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017138	AAGAA	2	10	680061	680070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017138	AGATA	2	10	684786	684795	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017138	TGAAA	2	10	685102	685111	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017138	TTTCA	2	10	685470	685479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017138	TAATT	2	10	695734	695743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017138	ATAAA	2	10	700083	700092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017138	ATAAA	2	10	707201	707210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017138	ATTAT	2	10	707260	707269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017138	TCATT	2	10	707295	707304	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017138	ACCTT	2	10	707981	707990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017138	AGTCA	2	10	720918	720927	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017138	AAAGT	2	10	721028	721037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017138	TAAAA	2	10	726113	726122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017138	AGTAA	2	10	742451	742460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017138	CTTTT	2	10	742509	742518	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017138	CTTTT	2	10	743878	743887	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017138	ATATT	2	10	753735	753744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017138	TCTTT	2	10	759070	759079	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017138	CATAT	2	10	766019	766028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017138	CGAAA	2	10	771661	771670	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017138	CGATG	2	10	772793	772802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017138	TAACT	2	10	781124	781133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017138	AGACT	2	10	781134	781143	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017138	CGTTC	2	10	784065	784074	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_017138	CAACA	2	10	784104	784113	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017138	ACGGT	2	10	784304	784313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017138	TATAA	2	10	792098	792107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017138	GCTAT	2	10	795762	795771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017138	TAAAT	2	10	801237	801246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017138	TAAAA	2	10	817397	817406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017138	CATTA	2	10	824880	824889	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_017138	TTTAT	2	10	875829	875838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017138	TATTT	2	10	880231	880240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017138	TTCTA	2	10	907287	907296	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_017138	CGGAG	2	10	1346302	1346311	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_017138	GAATA	2	10	1508553	1508562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_017138	TTTAC	2	10	1526387	1526396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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