MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. S23321

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017082	CAATCT	2	12	45619	45630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017082	GTTTTT	2	12	57181	57192	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017082	AGCGGG	2	12	110626	110637	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017082	GCAGTG	2	12	133608	133619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017082	ATGGGC	2	12	153473	153484	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017082	CGGATG	2	12	153520	153531	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017082	GGAGGG	2	12	164087	164098	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017082	CCCTCC	2	12	164216	164227	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
9	NC_017082	ATGGCA	2	12	166529	166540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017082	CTCACC	2	12	173361	173372	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017082	TTGCGC	2	12	189440	189451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017082	CGCGTG	2	12	278221	278232	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017082	GGAGGG	2	12	316295	316306	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017082	TATCAT	2	12	329066	329077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017082	GGTTCT	2	12	355188	355199	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017082	TGTGGC	2	12	375014	375025	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017082	GGAGGG	2	12	429882	429893	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017082	CGGTGC	2	12	435071	435082	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017082	TCCCCT	2	12	445553	445564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017082	GCCAGC	2	12	471234	471245	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017082	GGAGGG	2	12	474381	474392	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017082	CCCTCC	2	12	474507	474518	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_017082	CCCTCC	2	12	475597	475608	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
24	NC_017082	GCGGAC	2	12	476919	476930	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017082	CCCTCC	2	12	507240	507251	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
26	NC_017082	CCTGCC	2	12	521090	521101	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017082	ATACCA	2	12	532113	532124	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017082	ATTGAT	2	12	553728	553739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017082	CGGGCG	2	12	595919	595930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017082	GGCGCA	2	12	612350	612361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017082	ATGGCG	2	12	623099	623110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017082	AGAGCG	2	12	634641	634652	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017082	GGAGGG	2	12	642337	642348	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017082	GGAGGG	2	12	658392	658403	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017082	TCCGCC	2	12	664156	664167	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017082	GGAGGG	2	12	667118	667129	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017082	CCCTCC	2	12	667241	667252	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
38	NC_017082	GAAATG	2	12	697302	697313	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017082	GCAATC	2	12	734104	734115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017082	ACGCGA	2	12	746430	746441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017082	TCCCGC	2	12	755939	755950	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017082	GCCGAA	2	12	766033	766044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017082	GGATGC	2	12	797764	797775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017082	GTCGGA	2	12	815454	815465	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017082	CCCTCC	2	12	857845	857856	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
46	NC_017082	TCAGCG	2	12	864213	864224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017082	GGAGGG	2	12	877657	877668	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017082	CCCTCC	2	12	877786	877797	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
49	NC_017082	GGAGGG	2	12	895940	895951	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017082	CCCTCC	2	12	896067	896078	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
51	NC_017082	GGAGGG	2	12	926947	926958	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017082	GGAGGG	2	12	939474	939485	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017082	AGCGCG	2	12	939498	939509	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017082	CCCTCC	2	12	1010486	1010497	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
55	NC_017082	GGAGGG	2	12	1029413	1029424	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017082	GGAGGG	2	12	1029860	1029871	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017082	GGAGGG	2	12	1036604	1036615	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017082	TCGACG	2	12	1149530	1149541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017082	GCGATG	2	12	1149782	1149793	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017082	GGAGGG	2	12	1170757	1170768	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017082	CCCTCC	2	12	1170880	1170891	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
62	NC_017082	CATTCC	2	12	1180269	1180280	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017082	TTCTGT	2	12	1183056	1183067	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017082	TCAGGT	2	12	1213689	1213700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017082	GATGGA	2	12	1237447	1237458	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017082	GACGCC	2	12	1237950	1237961	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017082	GCGCCG	2	12	1239560	1239571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017082	TTTTCG	2	12	1248907	1248918	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017082	GGGCCA	2	12	1253487	1253498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017082	GGAGGG	2	12	1337681	1337692	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017082	CCCTCC	2	12	1337809	1337820	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
72	NC_017082	GCGCCA	2	12	1363511	1363522	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017082	CGACGC	2	12	1363530	1363541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017082	ATCAGC	2	12	1363646	1363657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017082	GCTACG	2	12	1578702	1578713	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017082	TTTCGC	2	12	1776625	1776636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017082	CGGCCG	2	12	1788458	1788469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017082	TCGATC	2	12	1814615	1814626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017082	TCCGGG	2	12	1830596	1830607	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017082	GCCTCT	2	12	1845234	1845245	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017082	CGCCAA	2	12	1924692	1924703	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017082	TTGAAG	2	12	1924797	1924808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017082	AGCAAA	2	12	1948451	1948462	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017082	AAGCGT	2	12	1954280	1954291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017082	TGGCCT	2	12	1961641	1961652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017082	CGATCT	2	12	1997940	1997951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017082	ATTTTG	2	12	2197858	2197869	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017082	GGACCG	2	12	2230552	2230563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017082	CGTTTA	2	12	2238166	2238177	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017082	GGCTTG	2	12	2273232	2273243	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017082	CACCCA	2	12	2286647	2286658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017082	TCGTAG	2	12	2329673	2329684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017082	GTTTTG	2	12	2345052	2345063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017082	CAGCGC	2	12	2363294	2363305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017082	TCGCTA	2	12	2494528	2494539	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017082	GGGCGA	2	12	2518127	2518138	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017082	GCCTAT	2	12	2591641	2591652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017082	GCGGGG	2	12	2629523	2629534	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017082	CTCAAC	2	12	2642430	2642441	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017082	CTGCAT	2	12	2743766	2743777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017082	GGAGGG	2	12	2771304	2771315	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017082	CCCTCC	2	12	2771431	2771442	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
103	NC_017082	GCCTTG	2	12	2775680	2775691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017082	TGGGAG	2	12	2786123	2786134	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017082	AGGCCA	2	12	2807807	2807818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017082	GTGGTT	2	12	2819166	2819177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017082	CCTTTT	2	12	2828114	2828125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017082	AGTTCC	2	12	2857983	2857994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017082	CTTCGT	2	12	2862856	2862867	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017082	TGCGCG	2	12	2894045	2894056	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017082	CCGTCA	2	12	2957741	2957752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017082	CGTCAC	2	12	3024826	3024837	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017082	GAGCAA	2	12	3046566	3046577	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017082	CCCGGC	2	12	3137542	3137553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017082	CTGAGG	2	12	3139033	3139044	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017082	CCCCGT	2	12	3143630	3143641	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017082	ACACCA	2	12	3173855	3173866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017082	TTCTAC	2	12	3320865	3320876	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017082	TGAAAT	2	12	3420063	3420074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017082	GTTGGG	2	12	3420154	3420165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017082	CTCACG	2	12	3484249	3484260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017082	CCGGGC	2	12	3528534	3528545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017082	GTTTCT	2	12	3547244	3547255	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017082	AACGAA	2	12	3566375	3566386	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017082	GGTGCG	2	12	3568931	3568942	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017082	ATTGGC	2	12	3580685	3580696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017082	TTCATT	2	12	3698867	3698878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017082	GAAGTC	2	12	3699087	3699098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017082	GCCACC	2	12	3702483	3702494	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017082	GCCGCG	2	12	3730855	3730866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017082	GATCGA	2	12	3748295	3748306	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017082	TCGGCT	2	12	3818618	3818629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017082	CGCTTG	2	12	3821570	3821581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017082	TGTTTG	2	12	3868033	3868044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017082	ACGCCC	2	12	3905550	3905561	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017082	GCTTTG	2	12	3916171	3916182	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017082	CTGGCG	2	12	4025639	4025650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017082	CCCTTG	2	12	4048446	4048457	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017082	ATAGCT	2	12	4206739	4206750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017082	CTTCCG	2	12	4275415	4275426	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017082	CCCCCG	2	12	4290982	4290993	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
142	NC_017082	CCTTCA	2	12	4331143	4331154	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017082	TTTATA	2	12	4405561	4405572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017082	AGCCGA	2	12	4408042	4408053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017082	ATTATG	2	12	4428214	4428225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017082	CCGCTT	2	12	4434168	4434179	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017082	CAGAGT	2	12	4438512	4438523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017082	TTTCAT	2	12	4460807	4460818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_017082	CGGTGC	2	12	4462985	4462996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017082	AAGGAC	2	12	4500586	4500597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_017082	GCTCTA	2	12	4531785	4531796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017082	GGGCAA	2	12	4579374	4579385	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_017082	GCGGTC	2	12	4585571	4585582	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017082	TCGGCG	2	12	4691277	4691288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017082	TCATGG	2	12	4693129	4693140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_017082	CTGTCG	2	12	4693522	4693533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017082	CGAGCT	2	12	4707809	4707820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017082	CCGGGA	2	12	4715411	4715422	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017082	GCCCCT	2	12	4765119	4765130	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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164	NC_017082	ACCGCG	2	12	4988798	4988809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
165	NC_017082	GCGATT	2	12	5010983	5010994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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174	NC_017082	CGTTAA	2	12	5593665	5593676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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237	NC_017082	GGAGAG	2	12	7157364	7157375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
238	NC_017082	CCCTCC	2	12	7166636	7166647	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
239	NC_017082	GGGTGA	2	12	7200476	7200487	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.