MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Blastococcus saxobsidens DD2

Total Repeats: 676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016943	GCACC	2	10	2944	2953	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016943	GACCG	2	10	19011	19020	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016943	GTTCC	2	10	19149	19158	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016943	AGCTG	2	10	29857	29866	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016943	TACGA	2	10	33069	33078	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016943	GCCGG	2	10	49917	49926	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016943	GCGAA	2	10	51241	51250	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016943	GGCCG	2	10	52486	52495	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016943	GCCGG	2	10	57996	58005	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016943	GGTGT	2	10	64124	64133	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016943	GTCGG	2	10	68973	68982	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016943	CGGGA	2	10	88116	88125	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016943	GCCGG	2	10	92986	92995	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016943	TCCTG	2	10	112885	112894	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016943	CCTGC	2	10	116622	116631	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_016943	ACGCG	2	10	124666	124675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016943	GCCGG	2	10	136178	136187	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016943	GCCGG	2	10	137658	137667	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016943	GTGAT	2	10	137697	137706	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016943	CCGAG	2	10	143368	143377	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016943	TGCGG	2	10	149830	149839	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016943	TCGTG	2	10	164597	164606	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016943	CGTCA	2	10	164933	164942	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016943	GGGAG	2	10	166138	166147	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016943	GTTCG	2	10	167885	167894	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016943	TGACC	2	10	180934	180943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016943	GAGCC	2	10	182485	182494	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016943	GCGCC	2	10	183874	183883	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_016943	CTGGT	2	10	183974	183983	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016943	CGGCC	2	10	186168	186177	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016943	GCCCC	2	10	187566	187575	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_016943	ACGGC	2	10	188436	188445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016943	GCAGC	2	10	192246	192255	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016943	GCCGG	2	10	220790	220799	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016943	GGCCG	2	10	227562	227571	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016943	CCGGG	2	10	232181	232190	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016943	CGGCC	2	10	236825	236834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_016943	CCTCG	2	10	248359	248368	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_016943	GACCT	2	10	261565	261574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016943	GCGCC	2	10	261684	261693	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_016943	GGCCG	2	10	267249	267258	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016943	TGCCA	2	10	267269	267278	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016943	CCGCC	2	10	269557	269566	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
44	NC_016943	ACCGG	2	10	279229	279238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016943	TGGTC	2	10	279372	279381	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016943	GGCCC	2	10	281173	281182	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_016943	GAACG	2	10	284412	284421	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016943	GCCGG	2	10	302933	302942	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_016943	CGCGC	2	10	307221	307230	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_016943	AGCGT	2	10	324102	324111	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016943	CGCGG	2	10	324348	324357	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016943	GCCGG	2	10	329313	329322	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016943	CGGCC	2	10	329649	329658	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_016943	CGGGC	2	10	332286	332295	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016943	CCGAC	2	10	344437	344446	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_016943	CGGGG	2	10	346643	346652	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016943	CCCGG	2	10	350518	350527	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016943	GTCCC	2	10	358630	358639	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_016943	ACGCT	2	10	358838	358847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016943	ACGGC	2	10	364465	364474	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016943	CGGGA	2	10	372708	372717	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016943	ACGGG	2	10	381712	381721	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016943	GCCGA	2	10	382865	382874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016943	ACCGC	2	10	382901	382910	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_016943	GCGCC	2	10	383220	383229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_016943	GCGGG	2	10	386977	386986	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016943	CCGCC	2	10	390731	390740	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
68	NC_016943	GATCG	2	10	392852	392861	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016943	GAACG	2	10	394885	394894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016943	CGTGA	2	10	397059	397068	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016943	CCGGC	2	10	403010	403019	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_016943	GCCGC	2	10	416582	416591	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_016943	CCCCG	2	10	416655	416664	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
74	NC_016943	GGATG	2	10	444383	444392	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016943	GCCGC	2	10	458216	458225	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_016943	GCGCG	2	10	460074	460083	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016943	ACCGC	2	10	460351	460360	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_016943	TCCGT	2	10	465844	465853	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_016943	GAGCG	2	10	466973	466982	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016943	GAGCG	2	10	467008	467017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016943	GAGCG	2	10	467043	467052	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016943	GGCCG	2	10	470438	470447	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016943	CGCGG	2	10	499323	499332	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016943	CCGCG	2	10	524902	524911	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016943	GGCAG	2	10	525753	525762	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016943	GCCGG	2	10	526878	526887	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016943	CCGGG	2	10	531364	531373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016943	GCCGG	2	10	539901	539910	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016943	CCGCC	2	10	549023	549032	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
90	NC_016943	GCCAC	2	10	569952	569961	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_016943	TCGCT	2	10	575375	575384	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016943	GCGTC	2	10	578205	578214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016943	CGAAC	2	10	585369	585378	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016943	TCCTC	2	10	591672	591681	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_016943	CCGCG	2	10	592093	592102	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_016943	GTCCC	2	10	593144	593153	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_016943	CCCGT	3	15	593264	593278	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_016943	GAGCC	2	10	601160	601169	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016943	ACGTC	2	10	616747	616756	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016943	CGCTG	2	10	616981	616990	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016943	CGGCG	2	10	641002	641011	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016943	GAGCG	2	10	650530	650539	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016943	GCCGC	2	10	654790	654799	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_016943	GACCG	2	10	682995	683004	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016943	CCGTC	2	10	684621	684630	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_016943	CCGGC	2	10	689795	689804	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_016943	TCGGT	2	10	689861	689870	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016943	GGCCG	2	10	693439	693448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016943	CCCGG	3	15	728486	728500	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_016943	CTCTC	2	10	729634	729643	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_016943	CGCGG	2	10	732953	732962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016943	GCCCT	2	10	751363	751372	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_016943	GCGCG	2	10	759153	759162	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016943	CGGTG	2	10	759679	759688	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016943	CCAGC	2	10	760945	760954	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_016943	TGACC	2	10	768769	768778	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016943	GAGTG	2	10	768779	768788	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016943	GGGCC	2	10	769711	769720	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_016943	ACCGC	2	10	782644	782653	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_016943	GACGG	2	10	827136	827145	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016943	TCCGG	2	10	835190	835199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016943	GGGCA	2	10	835353	835362	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016943	CCCGG	2	10	839084	839093	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_016943	CCGCC	2	10	840549	840558	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_016943	TCGGC	2	10	845425	845434	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_016943	ACCCG	2	10	848345	848354	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_016943	CGGTG	2	10	853780	853789	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016943	AGGTC	2	10	869261	869270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016943	CAGGG	2	10	877386	877395	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016943	CCGGT	2	10	897329	897338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016943	CGGCG	2	10	906408	906417	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016943	CGCGG	2	10	909900	909909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016943	CCGGC	2	10	929289	929298	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_016943	CGGGA	2	10	931120	931129	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016943	GCAGG	2	10	934156	934165	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016943	CGACG	2	10	956729	956738	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016943	CACTG	2	10	960763	960772	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016943	CCGGC	2	10	965542	965551	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_016943	CCTGG	2	10	977200	977209	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_016943	CCACC	2	10	997978	997987	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
141	NC_016943	AGGCC	2	10	998245	998254	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_016943	ACCGC	2	10	1003269	1003278	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_016943	GCCGC	2	10	1019743	1019752	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_016943	GACGG	2	10	1028942	1028951	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016943	TTCCT	2	10	1039599	1039608	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_016943	CGGCT	2	10	1041343	1041352	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_016943	GCCAA	2	10	1044818	1044827	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_016943	GCTGC	2	10	1047940	1047949	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_016943	CCGGC	2	10	1051329	1051338	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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151	NC_016943	GGTCG	2	10	1068760	1068769	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
152	NC_016943	CGGCC	2	10	1078512	1078521	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
153	NC_016943	GGCCG	2	10	1078542	1078551	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
154	NC_016943	CCCGG	2	10	1079918	1079927	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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162	NC_016943	GACCC	2	10	1117895	1117904	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
163	NC_016943	GGTGG	2	10	1145046	1145055	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_016943	GCGCG	2	10	1152953	1152962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
166	NC_016943	GCCCC	2	10	1159683	1159692	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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171	NC_016943	CGGAT	2	10	1174472	1174481	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_016943	GTCGA	2	10	1181925	1181934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
176	NC_016943	CGCGG	2	10	1181990	1181999	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
177	NC_016943	GCCCT	2	10	1182228	1182237	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
178	NC_016943	CCGCT	2	10	1206906	1206915	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
179	NC_016943	CGTCC	2	10	1207639	1207648	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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181	NC_016943	CGGCT	2	10	1225583	1225592	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
182	NC_016943	CCCCG	2	10	1244995	1245004	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
183	NC_016943	TGCGC	2	10	1250824	1250833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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186	NC_016943	CCGAT	2	10	1276087	1276096	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_016943	CGCTG	2	10	1318053	1318062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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198	NC_016943	CGTGC	2	10	1354269	1354278	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
199	NC_016943	GGCCG	2	10	1355192	1355201	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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203	NC_016943	GCCAC	2	10	1393537	1393546	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
204	NC_016943	TCGGT	2	10	1406052	1406061	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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221	NC_016943	GGTCC	2	10	1539820	1539829	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
222	NC_016943	GCCGC	2	10	1543803	1543812	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
223	NC_016943	GGGGT	2	10	1554143	1554152	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_016943	TGTCC	2	10	1775371	1775380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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266	NC_016943	ACGAA	2	10	1883290	1883299	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_016943	CGGGC	2	10	1899747	1899756	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_016943	GGTCG	2	10	1913335	1913344	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
274	NC_016943	CGGAA	2	10	1919867	1919876	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_016943	CGGCG	2	10	1962817	1962826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
280	NC_016943	ACGGA	2	10	1962854	1962863	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
281	NC_016943	GTGGC	2	10	1963471	1963480	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
282	NC_016943	CCCCG	2	10	1970619	1970628	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
283	NC_016943	GGACA	2	10	1979109	1979118	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
284	NC_016943	GGTGC	2	10	1999468	1999477	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_016943	TGACG	2	10	2009048	2009057	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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288	NC_016943	GGCGT	2	10	2013665	2013674	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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407	NC_016943	ACCGG	2	10	2901722	2901731	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
408	NC_016943	GGAAG	2	10	2902543	2902552	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_016943	CCTCT	2	10	2934289	2934298	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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412	NC_016943	CCGCC	2	10	2969320	2969329	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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419	NC_016943	GTCCT	2	10	3049875	3049884	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
420	NC_016943	CCGCC	2	10	3066043	3066052	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
421	NC_016943	CGGGC	2	10	3092033	3092042	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
422	NC_016943	GACGC	2	10	3099396	3099405	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
423	NC_016943	GGCTG	2	10	3099442	3099451	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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425	NC_016943	ACGCC	2	10	3100909	3100918	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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462	NC_016943	CGTCG	2	10	3376884	3376893	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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480	NC_016943	GCCGG	2	10	3505596	3505605	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
481	NC_016943	CCGGC	2	10	3505619	3505628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
482	NC_016943	CCGGC	2	10	3507974	3507983	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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486	NC_016943	TTCGA	2	10	3535861	3535870	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
487	NC_016943	GCGAC	2	10	3535908	3535917	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
488	NC_016943	GCGGA	2	10	3567705	3567714	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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498	NC_016943	CGGAC	2	10	3608151	3608160	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
499	NC_016943	GGCCG	2	10	3608708	3608717	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
500	NC_016943	CGGAC	2	10	3609632	3609641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

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