MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis VBI22 chromosome I

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016797	GCTGCC	2	12	18960	18971	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016797	ACGGTT	2	12	34841	34852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016797	CCTGGC	2	12	81310	81321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016797	TTTTGC	2	12	94455	94466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016797	GCTTTT	2	12	103233	103244	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016797	CTGGCG	2	12	146663	146674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016797	GCCGAG	2	12	162491	162502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016797	GGGGAA	2	12	169704	169715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016797	TCTGGC	2	12	186194	186205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016797	CCAGTG	2	12	209092	209103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016797	TTCCGA	2	12	218418	218429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016797	CTGATG	2	12	275393	275404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016797	GGCACA	2	12	285813	285824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016797	CTGAAA	2	12	331551	331562	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016797	CTGTCT	2	12	342325	342336	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016797	TTGCCT	2	12	342630	342641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016797	TCGATA	2	12	424984	424995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016797	TTTAAC	2	12	432973	432984	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016797	CGTTTT	2	12	506657	506668	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016797	CGTCAC	2	12	514486	514497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016797	ACGGTC	2	12	526757	526768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016797	TTACGT	2	12	557047	557058	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016797	CAGTTC	2	12	588872	588883	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016797	GAATAT	2	12	717356	717367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016797	CGGGAT	2	12	729834	729845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016797	ATTGAA	2	12	752151	752162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016797	CTTTTC	2	12	768138	768149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016797	TCGCGC	2	12	807970	807981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016797	GGCGTT	2	12	836520	836531	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016797	GAAATT	2	12	900020	900031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016797	TGCCGG	2	12	980187	980198	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016797	GCTGAT	2	12	998304	998315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016797	TTTCCT	2	12	1009651	1009662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016797	GGATGG	2	12	1009831	1009842	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016797	CGCCAG	2	12	1010224	1010235	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016797	TATTTT	2	12	1017666	1017677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016797	TTTTCC	2	12	1142256	1142267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016797	CAAAAA	2	12	1179978	1179989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016797	TGAATT	2	12	1235551	1235562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016797	CAGCGC	2	12	1272951	1272962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016797	CGGGTT	2	12	1273018	1273029	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016797	GCCTGC	2	12	1280145	1280156	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016797	TCAATT	2	12	1283657	1283668	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016797	CGTTTC	2	12	1292523	1292534	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016797	CACCGC	2	12	1293576	1293587	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016797	AAAACA	2	12	1293765	1293776	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016797	AAAGCG	2	12	1332654	1332665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016797	ATAGCC	2	12	1332904	1332915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016797	CCGCGC	2	12	1384464	1384475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016797	GTAAAA	2	12	1402705	1402716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016797	GCATTT	2	12	1408680	1408691	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016797	GCGCAT	2	12	1426778	1426789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016797	CATCGG	2	12	1434319	1434330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016797	ATGCCA	2	12	1436734	1436745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016797	AAGGAA	2	12	1469001	1469012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016797	GCTCTG	2	12	1471079	1471090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016797	AAAAGC	2	12	1543609	1543620	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016797	TGAAAA	2	12	1573531	1573542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016797	TCGCCG	2	12	1575779	1575790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016797	TGGAGG	2	12	1584501	1584512	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016797	CTGCCG	2	12	1591493	1591504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016797	GCATCC	2	12	1616710	1616721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016797	GGAGCC	2	12	1616742	1616753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016797	AATGCC	2	12	1651167	1651178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016797	CGACCA	2	12	1661270	1661281	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016797	CTGGCG	2	12	1699843	1699854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016797	TTGCGG	2	12	1699868	1699879	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016797	ATGCCG	2	12	1709863	1709874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016797	GCTTCT	2	12	1710191	1710202	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016797	TAAAAA	2	12	1779654	1779665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016797	CTGCCG	2	12	1796518	1796529	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016797	CGGCTG	2	12	1828352	1828363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016797	AGAAAC	2	12	1842833	1842844	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016797	AACTCA	2	12	1858966	1858977	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016797	GAAGCC	2	12	1898223	1898234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016797	CCAACA	2	12	1939834	1939845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016797	TTCTTT	2	12	2063098	2063109	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016797	GGAAAC	2	12	2087108	2087119	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016797	TCTTTG	2	12	2100841	2100852	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.