MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella canis HSK A52141 chromosome 2

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016796	AAAG	2	8	10870	10877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016796	ACGA	2	8	11049	11056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016796	TTCA	2	8	11109	11116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016796	TTGC	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016796	TAGT	2	8	11412	11419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016796	CTAT	2	8	11634	11641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016796	GAAG	2	8	14204	14211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016796	CAGG	2	8	27664	27671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016796	GAAA	2	8	27673	27680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016796	GCCT	2	8	33627	33634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016796	CTGG	2	8	34508	34515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016796	TCAA	2	8	34664	34671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016796	TTGC	2	8	37709	37716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016796	GGAT	2	8	41890	41897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016796	TACT	2	8	44137	44144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016796	GATG	2	8	52026	52033	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016796	CGGG	2	8	52211	52218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016796	GCCT	2	8	57866	57873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016796	TCAA	2	8	62651	62658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016796	ATGG	2	8	69417	69424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016796	TTCG	2	8	77379	77386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016796	TCCC	2	8	79414	79421	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_016796	CGTG	2	8	79500	79507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016796	GCCA	2	8	80375	80382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016796	TGGT	2	8	80441	80448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016796	ATTG	2	8	84942	84949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016796	GCCC	2	8	89963	89970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_016796	ACAA	2	8	90016	90023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016796	CTAT	2	8	90083	90090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016796	TGGA	2	8	90092	90099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016796	CCGA	2	8	93926	93933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016796	CGGG	2	8	94138	94145	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016796	TGAT	2	8	97233	97240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016796	TCAA	2	8	97316	97323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016796	CAAT	2	8	107152	107159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016796	TGCT	2	8	111844	111851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016796	AAAG	2	8	111929	111936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016796	TGCT	2	8	115238	115245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016796	CTGT	2	8	119151	119158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016796	AACC	2	8	119337	119344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016796	TTGA	2	8	124180	124187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016796	GGGC	2	8	124506	124513	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016796	GAGG	2	8	129251	129258	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016796	AATA	2	8	141019	141026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016796	CAGG	2	8	144352	144359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016796	CTTT	2	8	144960	144967	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016796	GAAA	2	8	147034	147041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016796	TTGA	2	8	149231	149238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016796	AGTA	2	8	150084	150091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016796	GAGC	2	8	152939	152946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016796	TGGC	2	8	152976	152983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016796	TTCA	2	8	158783	158790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016796	GTAA	2	8	158825	158832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016796	GTTT	2	8	159105	159112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016796	TACT	2	8	165615	165622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016796	GCAA	2	8	168025	168032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016796	TTCT	2	8	172128	172135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016796	TTTG	2	8	172186	172193	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016796	TCCC	2	8	173521	173528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_016796	TTTG	2	8	178187	178194	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016796	CAAA	2	8	180685	180692	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016796	ATGC	2	8	180711	180718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016796	GGCA	2	8	182943	182950	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016796	CGCC	2	8	185173	185180	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_016796	CCTG	2	8	185229	185236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016796	TCAA	2	8	187071	187078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016796	ATTT	2	8	187150	187157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016796	AATG	2	8	189687	189694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016796	ATGG	2	8	189768	189775	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016796	GGGA	2	8	190233	190240	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016796	GTTG	2	8	190278	190285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016796	GAAA	2	8	191523	191530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016796	TGCC	2	8	198912	198919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016796	GGCT	2	8	200214	200221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016796	GAAC	2	8	211172	211179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016796	TGCC	2	8	218706	218713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016796	ACTA	2	8	220627	220634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016796	TTAA	2	8	222390	222397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016796	ATCA	2	8	223333	223340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016796	GCAT	2	8	229916	229923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016796	TGGC	2	8	238575	238582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016796	GGCA	2	8	242816	242823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016796	ATGA	2	8	251111	251118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016796	GAAA	2	8	253451	253458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016796	CTGC	2	8	254206	254213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016796	GTTC	2	8	255530	255537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016796	AATC	2	8	256416	256423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016796	ACCA	2	8	256426	256433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016796	AAAT	2	8	256666	256673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016796	AACT	2	8	257113	257120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016796	CTCC	2	8	265914	265921	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_016796	CCTC	2	8	267536	267543	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_016796	GTCA	2	8	273639	273646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016796	AAGA	2	8	274172	274179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016796	GCAG	2	8	274707	274714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016796	TGAA	2	8	274870	274877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016796	TTGC	2	8	274896	274903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016796	AAGG	2	8	278428	278435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016796	ATTG	2	8	284456	284463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016796	AATT	2	8	285684	285691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016796	CCGA	2	8	288613	288620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016796	TTTC	2	8	288794	288801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016796	TCAC	2	8	288920	288927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016796	AAGG	2	8	288973	288980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016796	TCCA	2	8	305994	306001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016796	AAGC	2	8	316497	316504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016796	GCAT	2	8	316815	316822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016796	GTCC	2	8	318318	318325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016796	AATC	2	8	318499	318506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016796	GCCG	2	8	320393	320400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016796	CCAT	2	8	320469	320476	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016796	GATT	2	8	320585	320592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016796	GCCA	2	8	327021	327028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016796	AAAG	2	8	327038	327045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016796	TGGC	2	8	328180	328187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016796	AGCG	2	8	328205	328212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016796	GGGA	2	8	333663	333670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016796	TTGC	2	8	334034	334041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016796	GCTG	2	8	334149	334156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016796	ACCC	2	8	334573	334580	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_016796	CGAC	2	8	336770	336777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016796	GCCC	2	8	342217	342224	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_016796	AATC	2	8	347184	347191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016796	GATT	2	8	347192	347199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016796	TATC	2	8	347280	347287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016796	AAGT	2	8	348970	348977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016796	GTCT	2	8	349953	349960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016796	GAAA	2	8	350204	350211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016796	AACC	2	8	350949	350956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016796	AGGC	2	8	362407	362414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016796	CGTC	2	8	363722	363729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016796	GCTT	2	8	363750	363757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016796	CAAA	2	8	366901	366908	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016796	CATA	2	8	369816	369823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016796	AAAG	2	8	369956	369963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016796	TGCC	2	8	377029	377036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016796	CGCT	2	8	381085	381092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016796	TCGC	2	8	381150	381157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016796	ATTT	2	8	385898	385905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016796	AAAT	2	8	397507	397514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016796	AGGA	2	8	408827	408834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016796	CTGG	2	8	413114	413121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016796	GCCC	2	8	422958	422965	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_016796	GACA	2	8	423959	423966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016796	AATG	2	8	424272	424279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016796	CTTA	2	8	426389	426396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016796	CATC	2	8	433834	433841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016796	TAAA	2	8	434060	434067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016796	AATT	2	8	434088	434095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016796	GACC	2	8	444112	444119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016796	TCGT	2	8	444167	444174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.