MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016784	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016784	TCGTG	2	10	10841	10850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016784	GGACG	2	10	11716	11725	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016784	CCTTT	2	10	15768	15777	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016784	GAAAT	2	10	23415	23424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016784	TCGTG	2	10	32577	32586	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016784	GGACG	2	10	33452	33461	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016784	ACAAA	2	10	36551	36560	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016784	TTTTG	2	10	54144	54153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016784	TAAAG	2	10	65109	65118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016784	AAAGG	2	10	71454	71463	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016784	TAAAA	2	10	83797	83806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016784	TCGTG	2	10	92606	92615	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016784	GGACG	2	10	93307	93316	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016784	TCGTG	2	10	98433	98442	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016784	GGACG	2	10	99134	99143	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016784	TTACG	2	10	120883	120892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016784	TAAAA	2	10	121523	121532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016784	TTGTG	2	10	154754	154763	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016784	CGGCC	2	10	159564	159573	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_016784	TCGTG	2	10	163019	163028	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016784	GGACG	2	10	163720	163729	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016784	TTTTA	2	10	166764	166773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016784	TCGTG	2	10	168910	168919	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016784	GGACG	2	10	169611	169620	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016784	TCGTG	2	10	174735	174744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016784	GGACG	2	10	175436	175445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016784	ATGAC	2	10	179830	179839	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016784	TTTTC	2	10	183278	183287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016784	TTCCT	2	10	183346	183355	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016784	ACAAG	2	10	205383	205392	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016784	TCCTT	2	10	226594	226603	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016784	TGTCT	2	10	234143	234152	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016784	AGATT	2	10	235692	235701	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016784	ATAGT	2	10	238040	238049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016784	TGATA	2	10	240597	240606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016784	GAATA	2	10	243312	243321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016784	CAAAA	2	10	251133	251142	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016784	TATCA	2	10	252162	252171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016784	GTTTT	2	10	252396	252405	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016784	CTTTT	2	10	259846	259855	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016784	AAATG	2	10	304929	304938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016784	TCTTG	2	10	329316	329325	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016784	TTATG	2	10	355750	355759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016784	AGGGA	2	10	408040	408049	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016784	TTTTG	2	10	409572	409581	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016784	AAGAA	2	10	426831	426840	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016784	CTATA	2	10	428121	428130	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016784	ACGGG	2	10	438285	438294	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016784	TTTTA	2	10	442801	442810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016784	TTAAA	2	10	443557	443566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016784	GTAAA	2	10	444229	444238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016784	ATGAT	2	10	450963	450972	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016784	ATAAA	2	10	470523	470532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016784	AATTC	2	10	490422	490431	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016784	AAGGG	2	10	491617	491626	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016784	TAGTC	2	10	493288	493297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016784	TAAAT	2	10	496902	496911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016784	AATTG	2	10	496967	496976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016784	ATGTT	2	10	499045	499054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016784	AGATT	2	10	502276	502285	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016784	TTGAA	2	10	503077	503086	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016784	ATTTT	2	10	503724	503733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016784	CATGT	2	10	507151	507160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016784	AATGA	2	10	507454	507463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016784	AGAAA	2	10	507484	507493	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016784	AAATC	2	10	509331	509340	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016784	TGCTC	2	10	521832	521841	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016784	AAGAT	2	10	523472	523481	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016784	AAGCT	2	10	525580	525589	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016784	AGAAA	2	10	525711	525720	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016784	CTTAC	2	10	528658	528667	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016784	AAACA	2	10	535263	535272	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016784	TAAAC	2	10	540801	540810	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016784	TCGTA	2	10	551251	551260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016784	AAAGG	2	10	554466	554475	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016784	GGGAA	2	10	568037	568046	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016784	CAAAA	2	10	569483	569492	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016784	TTTTC	2	10	569551	569560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016784	ATTCA	2	10	579541	579550	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016784	GAAAT	2	10	582661	582670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016784	TCGTG	2	10	584121	584130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016784	GGACG	2	10	584880	584889	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016784	AAACG	2	10	588116	588125	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016784	CTTTT	2	10	596350	596359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016784	TAAAC	2	10	602257	602266	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016784	CAAAA	2	10	605488	605497	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016784	CGAAA	2	10	605551	605560	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016784	TACGA	2	10	625909	625918	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016784	CAGAG	2	10	652556	652565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016784	GATGA	2	10	664100	664109	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016784	ATTGA	2	10	679347	679356	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016784	GCGGG	2	10	682239	682248	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016784	AGGAA	2	10	704567	704576	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016784	CATTT	2	10	707918	707927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016784	TTGAA	2	10	722361	722370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016784	TGTTT	2	10	724636	724645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016784	CAACC	2	10	728346	728355	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_016784	TCAAA	2	10	737399	737408	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016784	TGGAT	2	10	744471	744480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016784	GAAAA	2	10	744743	744752	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016784	CCAAG	2	10	771122	771131	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016784	AATCA	2	10	776207	776216	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016784	GAATA	2	10	781469	781478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016784	TAAGC	2	10	792362	792371	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016784	GACCG	2	10	796841	796850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016784	TCCTC	2	10	803083	803092	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_016784	ATCAG	2	10	826205	826214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016784	AATTA	2	10	835433	835442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016784	AGCAC	2	10	835460	835469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016784	AGGGC	2	10	843590	843599	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016784	AATTT	2	10	850285	850294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016784	AGCCA	2	10	860196	860205	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_016784	ATCCC	2	10	860221	860230	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_016784	TCCCC	2	10	873455	873464	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
117	NC_016784	TGATA	2	10	878901	878910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016784	TTATA	2	10	891805	891814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016784	TTTTC	2	10	895036	895045	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016784	AAGGA	2	10	898052	898061	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016784	CCTTT	2	10	899046	899055	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016784	TCGTG	2	10	917221	917230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016784	GGACG	2	10	917922	917931	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016784	CGAAG	2	10	937363	937372	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016784	GTTTC	2	10	941772	941781	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016784	ATATA	2	10	961524	961533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016784	TAAAG	2	10	964360	964369	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016784	GGGGA	2	10	964393	964402	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016784	GTGAT	2	10	966112	966121	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016784	CCGCT	2	10	973140	973149	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_016784	ATAAA	2	10	984337	984346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016784	CTTTT	2	10	988505	988514	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016784	AAGTC	2	10	991839	991848	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016784	ATATT	2	10	993775	993784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016784	GGAAG	2	10	997704	997713	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016784	GACAA	2	10	1009812	1009821	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016784	ATGAT	2	10	1010971	1010980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016784	AAAAG	2	10	1010982	1010991	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016784	GAAAA	2	10	1021063	1021072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016784	AGTGG	2	10	1025257	1025266	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016784	TTTTG	2	10	1033230	1033239	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016784	AAATT	2	10	1043115	1043124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016784	TTTTC	2	10	1045594	1045603	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016784	AATAA	2	10	1045616	1045625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016784	CAAAA	2	10	1048829	1048838	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016784	AGAAA	2	10	1068247	1068256	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016784	TGAAA	2	10	1085446	1085455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_016784	TTTTA	2	10	2329404	2329413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_016784	CGTAA	2	10	3577268	3577277	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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464	NC_016784	CTCTC	2	10	3978824	3978833	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
465	NC_016784	CTTCA	2	10	3978836	3978845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.