MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus F837/76 chromosome

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016779	CTATTA	2	12	1855	1866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016779	TTTCGT	2	12	10906	10917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016779	TTTCGT	2	12	30705	30716	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016779	TTTAAA	2	12	41444	41455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016779	CTTTTT	2	12	74476	74487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016779	TTATAT	2	12	82139	82150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016779	TATATT	2	12	82234	82245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016779	AGTCAA	2	12	93112	93123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016779	AAATAC	2	12	169248	169259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016779	GTATGT	2	12	181269	181280	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016779	GTATGT	2	12	187108	187119	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016779	AAATTG	2	12	195753	195764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016779	AAAATA	2	12	216193	216204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016779	AAGGGG	2	12	216277	216288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016779	AGAGGT	2	12	221247	221258	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016779	TTTCAT	2	12	235534	235545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016779	ATTTTT	2	12	239335	239346	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016779	ATAAAA	2	12	250105	250116	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016779	AAGATG	2	12	292115	292126	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016779	AGTAAT	2	12	297112	297123	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016779	TATATT	2	12	321545	321556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016779	TATAAA	2	12	328338	328349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016779	CTTTTA	2	12	339122	339133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016779	AAAAAT	2	12	344401	344412	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016779	AATAGA	2	12	344648	344659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016779	ATTTGA	2	12	346174	346185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016779	AATGAT	2	12	368095	368106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016779	TTTATA	2	12	409445	409456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016779	AAAAAT	2	12	417398	417409	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016779	ATTTTT	2	12	441916	441927	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016779	TTTTCT	2	12	463854	463865	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016779	GAAAAT	2	12	478967	478978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016779	ATCATT	2	12	529999	530010	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016779	TGTATA	2	12	576975	576986	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016779	ACTATA	2	12	627164	627175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016779	ATATTA	2	12	627212	627223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016779	ACTTAA	2	12	695291	695302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016779	TTTTTA	2	12	705385	705396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016779	TTAAAA	2	12	715155	715166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016779	TTAATT	2	12	721953	721964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016779	TTTTAT	2	12	762774	762785	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016779	ATCAAT	2	12	770736	770747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016779	GTATAT	2	12	778531	778542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016779	ATAAAA	2	12	781272	781283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016779	ACATTT	2	12	784650	784661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016779	ATAAGT	2	12	784724	784735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016779	ATGTAA	2	12	801185	801196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016779	TTAAAG	2	12	818305	818316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016779	AATATT	2	12	829343	829354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016779	AAATGT	2	12	845929	845940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016779	ACGAGA	2	12	845978	845989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016779	GTTTTT	2	12	851532	851543	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016779	TCATAT	2	12	858947	858958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016779	GTATAT	2	12	862361	862372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016779	AAGTAG	2	12	875561	875572	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016779	TAAAAG	2	12	898177	898188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016779	CAAAAA	2	12	932595	932606	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016779	TGATGG	2	12	939802	939813	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016779	AAACAA	2	12	960954	960965	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016779	TACTTT	2	12	971697	971708	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016779	AATTAA	2	12	991790	991801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016779	CTTTTT	2	12	993070	993081	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016779	TCTTTT	2	12	995651	995662	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016779	AAATTT	2	12	1016031	1016042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016779	AAAATA	2	12	1028198	1028209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016779	CCTTTT	2	12	1046709	1046720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016779	TAATAT	2	12	1051708	1051719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016779	TCCATT	2	12	1053002	1053013	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016779	GAGGTA	2	12	1058838	1058849	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016779	AGAAAA	2	12	1072049	1072060	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016779	TTTATT	2	12	1085537	1085548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016779	ATTTTT	2	12	1086906	1086917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016779	TTTTCT	2	12	1119031	1119042	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016779	TGTTTC	2	12	1124235	1124246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016779	AATATA	2	12	1138187	1138198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016779	CTTTTC	2	12	1149651	1149662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016779	TTGAAA	2	12	1159701	1159712	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016779	AAGTAT	2	12	1167429	1167440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016779	GGAGAG	2	12	1222648	1222659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016779	AAATAA	2	12	1225057	1225068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016779	ATTTAA	2	12	1230929	1230940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016779	GGACAA	2	12	1254575	1254586	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016779	AATGAT	2	12	1273615	1273626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016779	GGATAA	2	12	1279086	1279097	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016779	AATGAA	2	12	1290031	1290042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016779	AAAAGT	2	12	1291014	1291025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016779	TGCTCA	2	12	1294739	1294750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016779	TTTACT	2	12	1299696	1299707	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016779	GAAAGG	2	12	1335250	1335261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016779	CCGGAA	2	12	1344136	1344147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016779	ATACAA	2	12	1349449	1349460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016779	GTTTTT	2	12	1370983	1370994	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016779	ATTTCT	2	12	1375999	1376010	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016779	TTTATT	2	12	1384436	1384447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016779	TTATCA	2	12	1387079	1387090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016779	GAAGGA	2	12	1396560	1396571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016779	TTTTTA	2	12	1496006	1496017	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016779	ATTTTT	2	12	1528428	1528439	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016779	TTTCTA	2	12	1569968	1569979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016779	TTTTAT	2	12	1572014	1572025	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016779	TATAAC	2	12	1586161	1586172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016779	TTTATT	2	12	1610927	1610938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016779	AATCAT	2	12	1623360	1623371	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016779	TGAACT	2	12	1716308	1716319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016779	GGTGTT	2	12	1726288	1726299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016779	AAAAAG	2	12	1734902	1734913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016779	AAATAA	2	12	1767429	1767440	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016779	ATATTT	2	12	1781410	1781421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016779	TTTTTA	2	12	1813336	1813347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016779	GAAAGA	2	12	1834299	1834310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016779	TATGAA	2	12	1858802	1858813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016779	TAAAAA	2	12	1865112	1865123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016779	TTTGTA	2	12	1867914	1867925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016779	TATAAT	2	12	1870231	1870242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016779	ATTCTT	2	12	1906978	1906989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016779	CATATA	2	12	1917497	1917508	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016779	GTTATA	2	12	1947404	1947415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016779	GAAAAA	2	12	1947431	1947442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016779	TTATGG	2	12	1947745	1947756	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016779	CTTTTT	2	12	1948645	1948656	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016779	CTTATG	2	12	1951180	1951191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016779	ATGAGT	2	12	1951870	1951881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016779	AAACCA	2	12	1983610	1983621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016779	AATGAG	2	12	1997709	1997720	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016779	TACCAT	2	12	1999162	1999173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016779	TATGTG	2	12	1999250	1999261	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016779	ATTTTT	2	12	2022069	2022080	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016779	ATTAAA	2	12	2040606	2040617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016779	TGGAAA	2	12	2108290	2108301	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016779	AGGAGA	2	12	2138542	2138553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.