MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella canis HSK A52141 chromosome 1

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016778	ATCAGC	2	12	56533	56544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016778	CCGGCA	2	12	74650	74661	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016778	CTGGCG	2	12	112154	112165	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016778	CCAGCG	2	12	112800	112811	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016778	TCAATT	2	12	154875	154886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016778	GCGCGA	2	12	246945	246956	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016778	GAAAAG	2	12	286779	286790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016778	TTTCAA	2	12	302765	302776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016778	ATATTC	2	12	337568	337579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016778	CGACCC	2	12	347124	347135	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016778	TTTGGA	2	12	429690	429701	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016778	ACGTAA	2	12	497572	497583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016778	GACCGT	2	12	527862	527873	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016778	ACAGCA	2	12	528244	528255	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016778	GGTCAT	2	12	539033	539044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016778	GTGACG	2	12	540135	540146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016778	GAAAAC	2	12	547605	547616	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016778	AAGTTA	2	12	621354	621365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016778	GTGCAG	2	12	664206	664217	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016778	TTGCAA	2	12	677563	677574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016778	AGGCAA	2	12	711710	711721	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016778	AAAATC	2	12	716240	716251	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016778	GAAAAA	2	12	716259	716270	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016778	AGATCG	2	12	744390	744401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016778	GGAAGC	2	12	782016	782027	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016778	TTCCCC	2	12	884638	884649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016778	AAAAGC	2	12	951108	951119	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016778	GCAAAA	2	12	959886	959897	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016778	GCCAGG	2	12	973120	973131	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016778	CCTCCC	2	12	1008292	1008303	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_016778	CAAAGA	2	12	1062202	1062213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016778	GTTTCC	2	12	1075935	1075946	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016778	GCCAGG	2	12	1144860	1144871	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016778	TCGATA	2	12	1238071	1238082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016778	TTACGT	2	12	1300583	1300594	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016778	TGAGTT	2	12	1304075	1304086	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016778	CGGCAG	2	12	1366524	1366535	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016778	CAAATG	2	12	1377246	1377257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016778	ATTTTT	2	12	1383387	1383398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016778	TGTTTT	2	12	1383666	1383677	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016778	TTCGAC	2	12	1401827	1401838	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016778	CAAGGG	2	12	1464402	1464413	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016778	GGCATT	2	12	1512106	1512117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016778	CGGCAG	2	12	1570936	1570947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016778	GCTTTT	2	12	1617852	1617863	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016778	CAGAGC	2	12	1690379	1690390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016778	TTCCTT	2	12	1692460	1692471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016778	TTTCAG	2	12	1713806	1713817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016778	TGGCAT	2	12	1724727	1724738	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016778	CCGATG	2	12	1727142	1727153	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016778	ATGCGC	2	12	1734683	1734694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016778	CTTTTA	2	12	1758757	1758768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016778	AGTTCC	2	12	1847044	1847055	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016778	GCGGTG	2	12	1867887	1867898	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016778	GAAACG	2	12	1868940	1868951	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016778	AATTGA	2	12	1877806	1877817	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016778	AAAGAA	2	12	1910219	1910230	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016778	TTTTTG	2	12	1981440	1981451	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016778	GGAAAA	2	12	2019161	2019172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.