MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella canis HSK A52141 chromosome 1

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016778	GCGTC	2	10	3731	3740	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016778	TTTCT	2	10	4448	4457	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016778	ATGAG	2	10	4640	4649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016778	TTCGT	2	10	7971	7980	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016778	ATTTT	2	10	27706	27715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016778	CTTTT	2	10	27889	27898	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016778	GCCCT	2	10	32243	32252	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016778	TAAAA	2	10	37169	37178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016778	ATCAT	2	10	39199	39208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016778	CAGCC	2	10	48042	48051	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_016778	TTTGT	2	10	52476	52485	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016778	TTTGT	2	10	57379	57388	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016778	TTCAT	2	10	59243	59252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016778	TATTT	2	10	69069	69078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016778	CTGCA	2	10	74442	74451	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016778	CGCAA	2	10	74462	74471	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016778	TGCGG	2	10	102051	102060	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016778	CAGCG	2	10	111066	111075	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016778	GCTTG	2	10	114133	114142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016778	CCCTG	2	10	117879	117888	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_016778	GGCAA	2	10	125736	125745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016778	AGATG	2	10	127161	127170	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016778	GCACC	2	10	136418	136427	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_016778	CCTGT	2	10	143119	143128	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016778	CATCA	2	10	143285	143294	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016778	TCGTT	2	10	168619	168628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016778	CTGTC	2	10	207015	207024	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016778	TGCCC	2	10	209856	209865	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_016778	CCTGT	2	10	211729	211738	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016778	AATCG	2	10	216168	216177	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016778	GCTTC	2	10	232398	232407	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016778	CTTCA	2	10	235041	235050	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016778	TTTAC	2	10	245942	245951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016778	GCGCC	2	10	247472	247481	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_016778	TCCAA	2	10	266842	266851	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016778	GGCAT	2	10	275829	275838	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016778	TGGAA	2	10	276121	276130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016778	TCAAG	2	10	282188	282197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016778	CTTTG	2	10	285312	285321	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016778	TTTGT	2	10	291782	291791	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016778	ACAAA	2	10	293669	293678	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016778	GGCAT	2	10	304502	304511	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016778	TTTGT	2	10	311297	311306	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016778	GGCAT	2	10	322690	322699	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016778	ATTTT	2	10	328997	329006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016778	GATTT	2	10	331981	331990	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016778	TAATG	2	10	337779	337788	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016778	AAAAG	2	10	348846	348855	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016778	CTTTG	2	10	351589	351598	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016778	ATCTT	2	10	352159	352168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016778	TTTGT	2	10	359452	359461	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016778	ATCGG	2	10	365012	365021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016778	GTCGT	2	10	391072	391081	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016778	CCTTG	2	10	392827	392836	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016778	GCAAA	2	10	425254	425263	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016778	CCGGT	2	10	427813	427822	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016778	CGTTC	2	10	429538	429547	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016778	TTTTA	2	10	436296	436305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016778	CAGCC	2	10	484780	484789	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_016778	TCAGT	2	10	489274	489283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016778	ACTAT	2	10	507820	507829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016778	AAACT	2	10	507947	507956	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016778	TCGCA	2	10	529877	529886	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016778	GTCGA	2	10	531900	531909	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016778	TGGCA	2	10	532675	532684	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016778	ATTCA	2	10	537504	537513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016778	TGCGG	2	10	538309	538318	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016778	GCTCC	2	10	545897	545906	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_016778	AATTT	2	10	567156	567165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016778	TAAAA	2	10	569123	569132	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016778	GTTCC	2	10	569835	569844	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016778	CGGCA	2	10	578392	578401	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016778	GCCCT	2	10	578453	578462	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_016778	TGCCG	2	10	585783	585792	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_016778	ACATC	2	10	594333	594342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016778	CTGCC	2	10	598224	598233	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_016778	AAAAC	2	10	620706	620715	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016778	GCGGT	2	10	620727	620736	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016778	CTTTT	2	10	621857	621866	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016778	TACAT	2	10	626429	626438	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016778	AGCCT	2	10	632314	632323	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016778	CTTTT	2	10	641053	641062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016778	TTTGT	2	10	649078	649087	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016778	GCCCG	2	10	649288	649297	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016778	GGTGG	2	10	654296	654305	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016778	AGCGC	2	10	664158	664167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016778	TTTGT	2	10	664258	664267	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016778	GCCGG	2	10	668061	668070	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016778	TCGCG	2	10	668080	668089	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016778	CAGGC	2	10	668095	668104	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016778	AATTA	2	10	670631	670640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016778	CGCCT	2	10	690617	690626	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_016778	GCCAC	2	10	707045	707054	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_016778	TCTAT	2	10	717774	717783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016778	AAAGA	2	10	723475	723484	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016778	AGCTG	2	10	727296	727305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016778	GAAAC	2	10	732906	732915	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016778	CTTTT	2	10	742827	742836	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016778	AGCCA	2	10	748800	748809	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016778	AGAAT	2	10	765446	765455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016778	GCGAC	2	10	782676	782685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016778	GCCGC	2	10	816155	816164	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_016778	CCCTG	2	10	820914	820923	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_016778	CCTGA	2	10	834339	834348	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016778	GCTTT	2	10	857963	857972	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016778	GATTT	2	10	874518	874527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016778	TAAAA	2	10	879863	879872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016778	TTTCA	2	10	882567	882576	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016778	TTTGT	2	10	888503	888512	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016778	CTCCG	2	10	888570	888579	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_016778	ACGAA	2	10	928405	928414	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016778	TCCAT	2	10	931506	931515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_016778	ACAAA	2	10	947054	947063	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016778	GGTGC	2	10	947547	947556	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016778	GGTTC	2	10	958431	958440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016778	GAACC	2	10	958482	958491	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016778	TGGAA	2	10	958855	958864	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016778	ATCGA	2	10	965131	965140	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016778	TTATT	2	10	975552	975561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016778	TAAAA	2	10	975756	975765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016778	CTCCG	2	10	981685	981694	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_016778	ATTTC	2	10	1002543	1002552	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016778	CTTTA	2	10	1003577	1003586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016778	CACGG	2	10	1013724	1013733	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016778	GCTTT	2	10	1018175	1018184	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016778	TCGTT	2	10	1025853	1025862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016778	GCATG	2	10	1026054	1026063	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016778	GCATG	2	10	1027469	1027478	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016778	CGGAG	2	10	1036892	1036901	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016778	ACTGG	2	10	1038728	1038737	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016778	CATCC	2	10	1055168	1055177	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_016778	AAGCC	2	10	1060251	1060260	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016778	ATCCG	2	10	1070811	1070820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_016778	ACAGG	2	10	1075983	1075992	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016778	TTTGT	2	10	1076817	1076826	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016778	ACAAA	2	10	1106294	1106303	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016778	AATTC	2	10	1106424	1106433	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016778	GCCCG	2	10	1107506	1107515	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_016778	ACAAA	2	10	1108582	1108591	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016778	TTCCC	2	10	1113863	1113872	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_016778	TTTGT	2	10	1131256	1131265	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016778	ACAAA	2	10	1153163	1153172	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016778	CCAAC	2	10	1168327	1168336	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_016778	TTTGT	2	10	1216423	1216432	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016778	TCGGG	2	10	1220939	1220948	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016778	ATTTG	2	10	1252858	1252867	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_016778	TGCGT	2	10	2093566	2093575	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
265	NC_016778	AAAAC	2	10	2105398	2105407	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_016778	TGTGC	2	10	2106501	2106510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.