MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brucella abortus A13334 chromosome 2

Total Repeats: 2599

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016777	TCA	2	6	1127635	1127640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_016777	CCT	2	6	1128949	1128954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_016777	ATC	2	6	1129045	1129050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_016777	CGC	2	6	1129056	1129061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_016777	AGC	2	6	1129372	1129377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_016777	ACAA	2	8	1129447	1129454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2507	NC_016777	ATCT	2	8	1129504	1129511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2508	NC_016777	AAT	2	6	1129541	1129546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_016777	GCG	2	6	1129661	1129666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_016777	C	9	9	1129844	1129852	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2511	NC_016777	GAG	2	6	1129862	1129867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_016777	AGCGA	2	10	1129876	1129885	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2513	NC_016777	CCT	2	6	1129942	1129947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_016777	CTC	2	6	1129966	1129971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_016777	CGGAAA	2	12	1133028	1133039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2516	NC_016777	GCG	2	6	1133961	1133966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_016777	GCC	2	6	1134125	1134130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_016777	GATT	2	8	1136970	1136977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_016777	GTCC	2	8	1137967	1137974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_016777	CAG	2	6	1138019	1138024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_016777	CGC	2	6	1138092	1138097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_016777	GGCG	2	8	1138530	1138537	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2523	NC_016777	CG	3	6	1139679	1139684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_016777	CGCTT	2	10	1139717	1139726	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2525	NC_016777	T	6	6	1139725	1139730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_016777	GA	3	6	1139750	1139755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_016777	GCC	2	6	1139774	1139779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_016777	TTC	2	6	1142494	1142499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_016777	CCA	2	6	1142500	1142505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_016777	CGG	2	6	1143183	1143188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_016777	A	6	6	1143202	1143207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_016777	A	7	7	1143218	1143224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_016777	GCTG	2	8	1143225	1143232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_016777	TCG	2	6	1143283	1143288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_016777	TGCGC	2	10	1143428	1143437	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2536	NC_016777	GGT	2	6	1143506	1143511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_016777	AATC	2	8	1143635	1143642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2538	NC_016777	AAC	2	6	1143686	1143691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_016777	GAA	2	6	1143748	1143753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_016777	CTG	2	6	1143784	1143789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_016777	TA	3	6	1145314	1145319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_016777	A	6	6	1145327	1145332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_016777	ATCA	2	8	1145459	1145466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_016777	GT	4	8	1145531	1145538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_016777	AGA	2	6	1145650	1145655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_016777	TTC	3	9	1145668	1145676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_016777	T	6	6	1145757	1145762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_016777	GGGC	2	8	1145773	1145780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2549	NC_016777	GC	3	6	1146473	1146478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2550	NC_016777	ATC	2	6	1146536	1146541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_016777	TA	3	6	1146592	1146597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_016777	TC	3	6	1146711	1146716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_016777	CGG	2	6	1146797	1146802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_016777	TGTCA	2	10	1146983	1146992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2555	NC_016777	CA	3	6	1147056	1147061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_016777	TTCA	2	8	1147090	1147097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2557	NC_016777	CCG	2	6	1147106	1147111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2558	NC_016777	GC	3	6	1147114	1147119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2559	NC_016777	TTTG	2	8	1147173	1147180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016777	ATA	3	9	1147266	1147274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_016777	TGT	2	6	1149425	1149430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_016777	CTAT	2	8	1149458	1149465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2563	NC_016777	A	6	6	1151909	1151914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_016777	GCC	2	6	1152287	1152292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_016777	TTC	2	6	1152295	1152300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_016777	T	6	6	1152781	1152786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_016777	AAG	2	6	1154368	1154373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_016777	TCA	2	6	1157249	1157254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_016777	CTT	2	6	1158085	1158090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_016777	TTA	2	6	1158094	1158099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_016777	CTG	2	6	1158111	1158116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_016777	TCC	2	6	1158221	1158226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_016777	GC	4	8	1158306	1158313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_016777	TCC	2	6	1158327	1158332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_016777	CCG	2	6	1158341	1158346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_016777	T	6	6	1159044	1159049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_016777	CGCCT	2	10	1159074	1159083	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2578	NC_016777	CAT	2	6	1159091	1159096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_016777	CA	3	6	1159100	1159105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2580	NC_016777	GC	4	8	1159328	1159335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_016777	TCC	2	6	1160004	1160009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_016777	GAT	2	6	1160463	1160468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_016777	ATTAA	2	10	1160482	1160491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_016777	ATT	2	6	1160511	1160516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_016777	GC	3	6	1160606	1160611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2586	NC_016777	CAGT	2	8	1160670	1160677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2587	NC_016777	CT	4	8	1160791	1160798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_016777	T	6	6	1160827	1160832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_016777	TTTG	2	8	1160849	1160856	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_016777	TG	3	6	1160881	1160886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_016777	GA	5	10	1160941	1160950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_016777	GA	3	6	1160973	1160978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_016777	GAA	2	6	1161939	1161944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_016777	T	7	7	1161954	1161960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_016777	GCC	2	6	1162070	1162075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_016777	TGA	2	6	1162119	1162124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_016777	TCT	2	6	1162174	1162179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_016777	GCT	2	6	1162190	1162195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_016777	TCT	2	6	1162218	1162223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.