MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis VBI22 chromosome II

Total Repeats: 470

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016775	GAAA	2	8	147	154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016775	CGAT	2	8	9010	9017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016775	TGAT	2	8	20633	20640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016775	AAAC	2	8	27865	27872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016775	CCTT	2	8	27889	27896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016775	GACA	2	8	30136	30143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016775	ATCT	2	8	31430	31437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016775	TCAA	2	8	33104	33111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016775	GCCT	2	8	39211	39218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016775	GTCC	2	8	39956	39963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016775	GTTC	2	8	43169	43176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016775	GAAT	2	8	46670	46677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016775	AAAC	2	8	54697	54704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016775	ATGG	2	8	56067	56074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016775	CCAG	2	8	62044	62051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016775	TGCT	2	8	66123	66130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016775	CAAA	2	8	66328	66335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016775	CCGC	2	8	66424	66431	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_016775	GCCG	2	8	69131	69138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016775	ATGA	2	8	69342	69349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016775	AGTA	2	8	73015	73022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016775	GGGC	2	8	83740	83747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016775	GCTC	2	8	86456	86463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016775	CTTC	2	8	87175	87182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016775	TTAA	2	8	92454	92461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016775	ATAA	2	8	96933	96940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016775	GATA	2	8	103460	103467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016775	TCTT	2	8	112587	112594	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016775	TGCC	2	8	112602	112609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016775	CAGT	2	8	115982	115989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016775	TTCA	2	8	117091	117098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016775	CTGG	2	8	120911	120918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016775	GAAG	2	8	127450	127457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016775	TTTA	2	8	129272	129279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016775	TTAA	2	8	134457	134464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016775	ACGA	2	8	134555	134562	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016775	GATG	2	8	141466	141473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016775	ATAC	2	8	141974	141981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016775	CGGA	2	8	142118	142125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016775	GCCG	2	8	145071	145078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016775	CATG	2	8	154022	154029	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016775	CCCA	2	8	154146	154153	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_016775	TAGG	2	8	155445	155452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016775	TTTC	2	8	159643	159650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016775	GTTC	2	8	161079	161086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016775	TGAA	2	8	161279	161286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016775	ACGG	2	8	163310	163317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016775	GGGC	2	8	163505	163512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016775	ATGA	2	8	169874	169881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016775	CACG	2	8	170600	170607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016775	TTCC	2	8	171355	171362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016775	CAGG	2	8	171389	171396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016775	TCAA	2	8	174751	174758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016775	CTGG	2	8	174972	174979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016775	CGAG	2	8	175568	175575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016775	GGCT	2	8	178244	178251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016775	TTGA	2	8	178358	178365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016775	AGGC	2	8	178782	178789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016775	GCCT	2	8	178794	178801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016775	TATT	2	8	179210	179217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016775	ATTC	2	8	184117	184124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016775	GGCT	2	8	187218	187225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016775	TCGC	2	8	189412	189419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016775	CAGC	2	8	192015	192022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016775	GCAG	2	8	192050	192057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016775	CAAT	2	8	192611	192618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016775	CTGG	2	8	193614	193621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016775	CCGA	2	8	194525	194532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016775	GAAA	2	8	199873	199880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016775	ATAG	2	8	211831	211838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016775	CGCC	2	8	213221	213228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_016775	TGCC	2	8	213490	213497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016775	GGCG	2	8	213611	213618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016775	CGGC	2	8	214014	214021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016775	TGCC	2	8	217905	217912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016775	GCCT	2	8	218444	218451	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016775	CGGG	2	8	218473	218480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016775	AAAT	2	8	222239	222246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016775	ATCA	2	8	223663	223670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016775	ATTT	2	8	223686	223693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016775	CTGC	2	8	223703	223710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016775	TCGA	2	8	225591	225598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016775	GCCG	2	8	225615	225622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016775	CTGC	2	8	230870	230877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016775	CGGG	2	8	232872	232879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016775	TTTG	2	8	238447	238454	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016775	ATTG	2	8	241183	241190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016775	AGTA	2	8	246916	246923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016775	CCGG	2	8	247123	247130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016775	CATG	2	8	253442	253449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016775	GGAA	2	8	253763	253770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016775	TGAA	2	8	254151	254158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016775	CTTC	2	8	255079	255086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016775	TCAA	2	8	255199	255206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016775	TTTG	2	8	265637	265644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016775	ATTG	2	8	286426	286433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016775	CTGT	2	8	288544	288551	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016775	AGGC	2	8	294802	294809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016775	CTTG	2	8	301951	301958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016775	GGCG	2	8	301967	301974	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016775	AATG	2	8	302005	302012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016775	AAAT	2	8	302344	302351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016775	CCGG	2	8	302682	302689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016775	GCGG	2	8	307013	307020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016775	GCCG	2	8	310249	310256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016775	AGGA	2	8	311007	311014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016775	TTTG	2	8	311647	311654	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016775	TTGG	2	8	317388	317395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016775	GGAG	2	8	317424	317431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016775	CAAT	2	8	318999	319006	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016775	TCTT	2	8	319723	319730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016775	TGGG	2	8	319797	319804	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016775	CGGG	2	8	320532	320539	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016775	AAGG	2	8	321027	321034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016775	GCGG	2	8	322585	322592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016775	TCCA	2	8	325061	325068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016775	CTTG	2	8	325261	325268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016775	TAGT	2	8	334079	334086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016775	GTGA	2	8	346536	346543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016775	TTGA	2	8	346580	346587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016775	CTTC	2	8	346689	346696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016775	TCCA	2	8	347116	347123	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016775	GGGC	2	8	347233	347240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016775	GCTG	2	8	347564	347571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016775	CTTG	2	8	351369	351376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016775	ACGA	2	8	351503	351510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016775	GGTC	2	8	351558	351565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016775	ATCC	2	8	361000	361007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016775	AATT	2	8	361584	361591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016775	TAAT	2	8	361618	361625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016775	GGGC	2	8	369196	369203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016775	TAAG	2	8	369283	369290	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016775	GGGC	2	8	372714	372721	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016775	GGCG	2	8	374009	374016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016775	GTGG	2	8	375128	375135	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016775	CATT	2	8	375677	375684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016775	TCGC	2	8	375703	375710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016775	TGGC	2	8	375761	375768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016775	ATTA	2	8	394087	394094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016775	CGAT	2	8	396311	396318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016775	AGTG	2	8	396597	396604	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016775	TGGC	2	8	396644	396651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016775	ATTT	2	8	398167	398174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016775	CGGG	2	8	405343	405350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016775	CTGT	2	8	405449	405456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016775	GGCT	2	8	405573	405580	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016775	AAAT	2	8	409776	409783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016775	GAGC	2	8	414588	414595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016775	CTTT	2	8	425811	425818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016775	GTAT	2	8	425950	425957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016775	TTTG	2	8	428866	428873	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_016775	GCGG	2	8	755996	756003	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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469	NC_016775	GGCA	2	8	1198899	1198906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
470	NC_016775	AGAA	2	8	1204922	1204929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.