MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Cryptocercus punctulatus) str. Cpu chromosome

Total Repeats: 250

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016621	AAAT	2	8	6421	6428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016621	TAAA	2	8	6503	6510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016621	TTTG	2	8	6790	6797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016621	ATTT	2	8	6840	6847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016621	ATTT	2	8	19882	19889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016621	ATTT	2	8	20089	20096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016621	TCCC	2	8	30072	30079	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016621	ATTG	2	8	30205	30212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016621	TAAT	2	8	32735	32742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016621	AAAT	2	8	35562	35569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016621	AATA	2	8	35638	35645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016621	ATAA	2	8	37636	37643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016621	ATTT	2	8	39164	39171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016621	AATT	2	8	49352	49359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016621	TTAA	2	8	49365	49372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016621	TAAT	2	8	49392	49399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016621	AAAT	2	8	50543	50550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016621	TAAA	2	8	61546	61553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016621	ATTT	2	8	61682	61689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016621	AATG	2	8	61880	61887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016621	ATAA	2	8	62129	62136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016621	TATT	2	8	62196	62203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016621	AACG	2	8	62278	62285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016621	ATAA	2	8	64846	64853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016621	TAAT	2	8	68971	68978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016621	AAAT	2	8	71812	71819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016621	AAAT	2	8	79997	80004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016621	TTAA	2	8	80005	80012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016621	TGAT	2	8	81071	81078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016621	AGAA	2	8	81912	81919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016621	GAAT	2	8	84890	84897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016621	CTAC	2	8	84948	84955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016621	TAAA	2	8	93943	93950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016621	TAAT	2	8	99087	99094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016621	TTTA	2	8	100507	100514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016621	TATT	2	8	101321	101328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016621	ATGA	2	8	104540	104547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016621	TTAT	2	8	109897	109904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016621	ATAA	2	8	109941	109948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016621	ATTT	2	8	110231	110238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016621	ATTT	2	8	110351	110358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016621	AAAT	2	8	110417	110424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016621	ATTT	2	8	110503	110510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016621	TATG	2	8	110747	110754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016621	AAAG	2	8	110908	110915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016621	AAAG	2	8	111056	111063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016621	TCTT	2	8	111267	111274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016621	AATA	2	8	125560	125567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016621	ATAA	2	8	125572	125579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016621	AAAT	2	8	129099	129106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016621	AATA	2	8	130661	130668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016621	TTTA	2	8	130700	130707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016621	ATTT	3	12	130726	130737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016621	TATT	2	8	130851	130858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016621	ATTT	2	8	131007	131014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016621	ATTT	2	8	133629	133636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016621	ATGG	2	8	136971	136978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016621	TTAA	2	8	141263	141270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016621	ATAA	2	8	141299	141306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016621	TGAT	2	8	143505	143512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016621	ATTT	2	8	144076	144083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016621	AAAT	2	8	144088	144095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016621	TAAA	2	8	144131	144138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016621	AATA	2	8	144249	144256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016621	ATAA	2	8	145840	145847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016621	TAAA	2	8	148445	148452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016621	AATA	2	8	148494	148501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016621	TAAT	2	8	148540	148547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016621	TGAA	2	8	148549	148556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016621	TAAA	2	8	148623	148630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016621	TAAC	2	8	148658	148665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016621	ATTA	2	8	159124	159131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016621	TAAA	2	8	159639	159646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016621	TTTA	2	8	161386	161393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016621	TTAA	2	8	163981	163988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016621	TACC	2	8	168557	168564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016621	AAAT	2	8	188180	188187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016621	ATTT	2	8	191706	191713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016621	TATT	2	8	191776	191783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016621	ATTT	2	8	191788	191795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016621	ATTT	2	8	193301	193308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016621	TAAT	2	8	194653	194660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016621	AATA	2	8	196480	196487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016621	TTTA	3	12	197532	197543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016621	TTTA	2	8	197961	197968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016621	TTTG	2	8	198335	198342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016621	GATA	2	8	198812	198819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016621	ATTA	2	8	204940	204947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016621	ATTT	2	8	206366	206373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016621	ATTA	2	8	207632	207639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016621	AGCA	2	8	214214	214221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016621	ATTA	2	8	214395	214402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016621	GAAT	2	8	224575	224582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016621	ATTT	2	8	224687	224694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016621	GATT	2	8	225524	225531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016621	TAAA	2	8	225538	225545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016621	TCTA	2	8	229956	229963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016621	TTTA	3	12	238011	238022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016621	TAAA	2	8	240955	240962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016621	ATTT	2	8	249225	249232	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016621	AATT	2	8	251719	251726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016621	ATTT	2	8	255172	255179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016621	TATT	2	8	255193	255200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016621	ATCA	2	8	255557	255564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016621	ATAA	2	8	255816	255823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016621	TATT	2	8	261119	261126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016621	ACTA	2	8	264851	264858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016621	CTAA	2	8	264860	264867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016621	GATT	2	8	264912	264919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016621	ATTA	2	8	265782	265789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016621	AAAT	2	8	274512	274519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016621	ATTT	2	8	277105	277112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016621	TTAA	2	8	279392	279399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016621	ATTT	3	12	279508	279519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016621	ACCT	2	8	279564	279571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016621	TTAG	2	8	279682	279689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016621	TGAG	2	8	280089	280096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016621	CGGA	2	8	280463	280470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016621	TTAA	2	8	280992	280999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016621	GAAA	2	8	281316	281323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016621	TAAG	2	8	281331	281338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016621	GCGA	2	8	281561	281568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016621	ATCA	2	8	281664	281671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016621	ACAG	2	8	282415	282422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016621	TAAT	2	8	282732	282739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016621	ACGG	2	8	282810	282817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016621	CCTT	2	8	283073	283080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016621	TCTA	2	8	283945	283952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016621	TTTC	2	8	284217	284224	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016621	TATG	2	8	284227	284234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016621	CTAA	2	8	287968	287975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016621	ATTG	2	8	288160	288167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016621	TTAA	2	8	292505	292512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016621	ATAG	2	8	297622	297629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016621	TTTA	2	8	303711	303718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016621	ATTA	3	12	306166	306177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016621	AATG	2	8	312590	312597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016621	TGGA	2	8	312716	312723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016621	TTAA	2	8	312764	312771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016621	ATTT	2	8	313014	313021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016621	TCCA	2	8	313871	313878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016621	ATAG	2	8	313953	313960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016621	AAGT	2	8	314255	314262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016621	ATTA	2	8	314290	314297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016621	CTTA	2	8	316798	316805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016621	TCAT	2	8	318996	319003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016621	AAGT	2	8	325587	325594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016621	TTTA	2	8	331794	331801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016621	ATTT	2	8	340472	340479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016621	TATC	2	8	340501	340508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016621	CAAT	2	8	341836	341843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_016621	GATC	2	8	344536	344543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_016621	ATTT	2	8	391575	391582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.