MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 chromosome 1

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016589	TGAGCG	2	12	12932	12943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016589	CCGTTT	2	12	30106	30117	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016589	CTTTTT	2	12	35496	35507	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016589	GGCCGC	2	12	44865	44876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016589	CAAGAA	2	12	50941	50952	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016589	TTGGCG	2	12	66124	66135	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016589	TTCGGT	2	12	86833	86844	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016589	CAAAAA	2	12	126921	126932	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016589	CGTTGT	2	12	178288	178299	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016589	GCGATG	2	12	190275	190286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016589	GCTCGT	2	12	210585	210596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016589	GTCGAC	2	12	216258	216269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016589	TGCGAA	2	12	252539	252550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016589	AACGTG	2	12	263950	263961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016589	GCGGCA	2	12	302037	302048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016589	ATCGTT	2	12	393786	393797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016589	CCAACG	2	12	405457	405468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016589	GCGTGA	2	12	407140	407151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016589	CGGCAA	2	12	417281	417292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016589	AAATAA	2	12	418872	418883	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016589	CGGAAG	2	12	455353	455364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016589	CGTTCG	2	12	477484	477495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016589	AAAAAG	2	12	492705	492716	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016589	CCGCAC	2	12	520261	520272	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016589	TGGCAG	2	12	539031	539042	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016589	TGCCGC	2	12	659655	659666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016589	GTTTTT	2	12	733667	733678	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016589	GCCATT	2	12	740389	740400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016589	CTCGCG	2	12	773220	773231	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016589	TCGTTC	2	12	820564	820575	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016589	CGAAGC	2	12	826661	826672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016589	ACGAAG	2	12	849993	850004	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016589	CAAGGC	2	12	888985	888996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016589	CGTGCG	2	12	906844	906855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016589	GGTTCG	2	12	916854	916865	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016589	ATGCGC	2	12	970042	970053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016589	CGGTGC	2	12	989051	989062	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016589	GAAGGG	2	12	1025363	1025374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016589	GCAAAA	2	12	1038085	1038096	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016589	TTCTGG	2	12	1054150	1054161	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016589	AAGAAA	2	12	1067142	1067153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016589	CCCCAC	2	12	1073054	1073065	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
43	NC_016589	ATAGTT	2	12	1073363	1073374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016589	GGCGCA	2	12	1079897	1079908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016589	TCGAAC	2	12	1081848	1081859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016589	GCATGC	2	12	1090905	1090916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016589	CCCGCG	2	12	1090970	1090981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016589	CTTGCA	2	12	1105677	1105688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016589	CGAATT	2	12	1111595	1111606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016589	AACGAA	2	12	1134460	1134471	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016589	GCCGAA	2	12	1212948	1212959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016589	AAGCAC	2	12	1227200	1227211	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016589	GCGCGA	2	12	1272550	1272561	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016589	TGGGCG	2	12	1276006	1276017	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016589	GCAAAC	2	12	1279396	1279407	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016589	GCCGGC	2	12	1324530	1324541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016589	AAACAA	2	12	1341978	1341989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016589	GGGCCG	2	12	1400593	1400604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016589	CGTACG	2	12	1405076	1405087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016589	AGGAAA	2	12	1406961	1406972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016589	CATCCG	2	12	1508921	1508932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016589	GCAACG	2	12	1518256	1518267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016589	TGACGT	3	18	1530909	1530926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016589	CCCGGT	2	12	1545968	1545979	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016589	CGTTCC	2	12	1556514	1556525	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016589	TCACCT	2	12	1566505	1566516	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016589	CAGCGC	2	12	1595926	1595937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016589	AGCGCG	2	12	1597743	1597754	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016589	TTCGAG	2	12	1597792	1597803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016589	GCGGCC	2	12	1611950	1611961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016589	GCTTTC	2	12	1612394	1612405	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016589	CCCGCG	2	12	1617220	1617231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016589	CCCTGC	2	12	1643535	1643546	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016589	CGCATT	2	12	1654423	1654434	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016589	AAAACC	2	12	1658333	1658344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016589	TCATAT	2	12	1674165	1674176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016589	ATCGAC	2	12	1691087	1691098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016589	GCTCCG	2	12	1766882	1766893	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016589	TCGCCG	2	12	1790003	1790014	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016589	TCGCTT	2	12	1794741	1794752	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016589	GCGAAC	2	12	1795070	1795081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016589	CTTTTT	2	12	1807852	1807863	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016589	TATGCC	2	12	1889043	1889054	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016589	ATCGCG	2	12	1923462	1923473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016589	AAAAAG	2	12	1948302	1948313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016589	CGAGAT	2	12	1948481	1948492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016589	TCGGCT	2	12	1998925	1998936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016589	CAAGCT	2	12	2008170	2008181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016589	GTGTTC	2	12	2028630	2028641	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016589	TTTCGC	2	12	2045515	2045526	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016589	CACGAA	2	12	2056582	2056593	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016589	TGCCGC	2	12	2078910	2078921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016589	GGCTCG	2	12	2079333	2079344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016589	CATCGC	2	12	2080784	2080795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016589	GCGGCA	2	12	2089702	2089713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016589	AAAAAG	2	12	2126115	2126126	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016589	TTTTGC	2	12	2173744	2173755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016589	ACGCTT	2	12	2183583	2183594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016589	GCTTGG	2	12	2270288	2270299	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016589	TCCTCA	2	12	2287239	2287250	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016589	GCCCGT	2	12	2304225	2304236	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016589	GCCGTT	2	12	2319946	2319957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016589	AACACC	2	12	2322241	2322252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016589	CGCGAG	2	12	2325762	2325773	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016589	GCCGAT	2	12	2333277	2333288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016589	CCGCAA	2	12	2350467	2350478	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016589	TGCTCC	2	12	2350647	2350658	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016589	GCGCTC	2	12	2350685	2350696	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016589	CCGCGC	2	12	2382810	2382821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016589	CCGCTG	2	12	2387966	2387977	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016589	GCGGTG	2	12	2426127	2426138	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016589	GCAACG	2	12	2430049	2430060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016589	CTTTGT	2	12	2439311	2439322	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016589	CGTTTT	2	12	2547162	2547173	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016589	CAAGCG	2	12	2600990	2601001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016589	CCTGGC	2	12	2609885	2609896	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016589	CTTGTT	2	12	2618180	2618191	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016589	TGCTAG	2	12	2731898	2731909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016589	TACTTC	2	12	2736293	2736304	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016589	CTCGCA	2	12	2799078	2799089	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016589	GGAATA	2	12	2799145	2799156	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016589	CCTTGA	2	12	2812711	2812722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016589	GAGCGC	2	12	2827522	2827533	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016589	ACGGGC	2	12	2829012	2829023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016589	TCGACG	2	12	2842614	2842625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016589	TCGACC	2	12	2852038	2852049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016589	ACACGA	2	12	2860315	2860326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016589	TCAATG	2	12	2868250	2868261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016589	ACCAGC	2	12	2889244	2889255	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016589	TGAAAA	2	12	2897138	2897149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016589	TTCGTG	2	12	2897858	2897869	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_016589	CCCAAG	2	12	2950785	2950796	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016589	CGGGGG	2	12	2954135	2954146	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_016589	GCCGCT	2	12	2978182	2978193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016589	CGATCT	2	12	2979422	2979433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016589	GCTCGC	2	12	2991104	2991115	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016589	TTCAAC	2	12	2993777	2993788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016589	TTGCAA	2	12	3016758	3016769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_016589	AGGCCC	2	12	3045479	3045490	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016589	GCCAAC	2	12	3054334	3054345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.