MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 14741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016023	TGA	2	6	297960	297965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016023	TCC	2	6	299981	299986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_016023	CTT	2	6	300101	300106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_016023	CTT	2	6	300111	300116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_016023	AGC	2	6	300138	300143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_016023	T	6	6	300158	300163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016023	CAT	2	6	300199	300204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_016023	GGC	2	6	300212	300217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_016023	GAG	2	6	300258	300263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016023	CCTC	2	8	300792	300799	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1011	NC_016023	A	6	6	300826	300831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016023	T	6	6	300836	300841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016023	T	6	6	300868	300873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016023	GTG	2	6	300875	300880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016023	GCG	2	6	300964	300969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016023	GCA	2	6	300970	300975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_016023	TTC	2	6	300990	300995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016023	TCA	2	6	301045	301050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_016023	T	6	6	301094	301099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016023	CTTT	2	8	302934	302941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_016023	GCC	2	6	302959	302964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_016023	AT	3	6	302975	302980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016023	A	6	6	302994	302999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016023	ACT	2	6	303281	303286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_016023	TCCCC	2	10	303292	303301	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1026	NC_016023	T	6	6	303317	303322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016023	TGCG	2	8	303358	303365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_016023	TCCGT	2	10	303390	303399	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1029	NC_016023	T	6	6	303401	303406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016023	TTCA	2	8	304702	304709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_016023	T	6	6	304721	304726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016023	CCTG	2	8	304822	304829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_016023	GGGCC	2	10	304837	304846	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1034	NC_016023	GCTT	2	8	304875	304882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_016023	TTCTC	2	10	304968	304977	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1036	NC_016023	CCTT	2	8	305134	305141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_016023	AAGC	2	8	305166	305173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_016023	CCTT	2	8	305185	305192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_016023	A	6	6	305225	305230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016023	CCTT	2	8	305237	305244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_016023	CTTC	2	8	305290	305297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_016023	AAGC	2	8	305322	305329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_016023	CCTT	2	8	305341	305348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_016023	CCTT	2	8	305392	305399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_016023	CCTT	2	8	305444	305451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_016023	A	6	6	305484	305489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016023	CCTT	2	8	305496	305503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_016023	CCTT	2	8	305548	305555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_016023	CTTC	2	8	305601	305608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_016023	A	6	6	305640	305645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016023	TTC	2	6	305655	305660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_016023	A	6	6	305692	305697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016023	TTC	2	6	305707	305712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_016023	CCTT	2	8	305808	305815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_016023	A	6	6	305837	305842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016023	A	6	6	305848	305853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016023	CCTT	2	8	305860	305867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_016023	A	6	6	305952	305957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016023	TTC	2	6	305967	305972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_016023	A	6	6	306004	306009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016023	CTTC	2	8	306017	306024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_016023	CCTT	2	8	306068	306075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_016023	CCTT	2	8	306120	306127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_016023	CCTT	2	8	306172	306179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_016023	T	6	6	307625	307630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016023	AAGG	2	8	307742	307749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016023	T	7	7	307775	307781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016023	GAA	2	6	307838	307843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016023	TTC	2	6	308056	308061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_016023	GCA	2	6	308157	308162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_016023	GTTC	2	8	308277	308284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_016023	GCC	2	6	308319	308324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_016023	A	6	6	308332	308337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016023	CAC	2	6	308416	308421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_016023	GAC	2	6	308452	308457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_016023	A	8	8	308471	308478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016023	CCT	2	6	310699	310704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_016023	TGA	2	6	310764	310769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016023	A	6	6	310782	310787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016023	TAC	2	6	310809	310814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_016023	GATG	2	8	310821	310828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016023	TCA	3	9	310870	310878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016023	TA	4	8	310921	310928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016023	TAC	2	6	310943	310948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016023	TA	3	6	311013	311018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016023	A	7	7	311052	311058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016023	CGC	2	6	311083	311088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_016023	T	6	6	311089	311094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016023	CTTGC	2	10	312047	312056	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1090	NC_016023	C	6	6	312424	312429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1091	NC_016023	TAT	2	6	312459	312464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016023	ATTC	2	8	312470	312477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_016023	ATTT	2	8	312534	312541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016023	T	6	6	312539	312544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016023	GAACA	2	10	312558	312567	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_016023	GAA	2	6	312634	312639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016023	A	7	7	312649	312655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016023	GCCA	2	8	312657	312664	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_016023	AGC	2	6	312705	312710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1101	NC_016023	TTC	2	6	313694	313699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_016023	TA	3	6	313716	313721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016023	T	7	7	313759	313765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016023	T	6	6	313770	313775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016023	CAA	2	6	313830	313835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_016023	C	6	6	313855	313860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1107	NC_016023	A	6	6	313872	313877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016023	T	9	9	313906	313914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016023	CTT	2	6	314095	314100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_016023	A	6	6	314161	314166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016023	TGA	2	6	314224	314229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016023	T	6	6	314247	314252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016023	GCC	2	6	314264	314269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_016023	A	6	6	314304	314309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016023	AAG	2	6	314326	314331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016023	CAA	2	6	314500	314505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_016023	TCA	2	6	314519	314524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_016023	TTTC	2	8	314535	314542	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_016023	A	6	6	314556	314561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016023	TAT	2	6	314569	314574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016023	C	7	7	314620	314626	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1122	NC_016023	TGT	2	6	314631	314636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016023	T	7	7	314672	314678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016023	T	6	6	314680	314685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016023	TGT	2	6	314693	314698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016023	TA	3	6	314743	314748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016023	TTATT	2	10	314777	314786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016023	CTA	2	6	314813	314818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016023	T	6	6	314863	314868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016023	A	7	7	314924	314930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016023	T	6	6	315138	315143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016023	CCG	2	6	315172	315177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_016023	TTC	2	6	315186	315191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_016023	TCA	2	6	315208	315213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_016023	GCAA	2	8	315222	315229	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_016023	CCT	2	6	315289	315294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_016023	A	7	7	315320	315326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_016023	GC	3	6	315328	315333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_016023	T	6	6	315350	315355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_016023	GGA	2	6	315382	315387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_016023	G	6	6	315542	315547	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1274	NC_016023	TGGT	2	8	334990	334997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1279	NC_016023	CGC	2	6	335903	335908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1399	NC_016023	GCCG	2	8	364973	364980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1400	NC_016023	CG	3	6	365003	365008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1406	NC_016023	CGCGG	2	10	368112	368121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1407	NC_016023	GCA	2	6	368157	368162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1409	NC_016023	T	7	7	368385	368391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_016023	A	6	6	368451	368456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_016023	ACG	2	6	368461	368466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_016023	CAG	2	6	368854	368859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_016023	TTG	2	6	370252	370257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_016023	TTG	2	6	370278	370283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_016023	TGCT	2	8	370300	370307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1424	NC_016023	TTG	2	6	370329	370334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_016023	AGG	2	6	378284	378289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1468	NC_016023	A	8	8	387474	387481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1469	NC_016023	CCCGT	2	10	387756	387765	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1470	NC_016023	CTTTT	2	10	387774	387783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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