MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 chromosome

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015921	AAAACC	2	12	3264	3275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015921	AATTAA	2	12	45406	45417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015921	AATACT	2	12	85714	85725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015921	AAAACT	2	12	101289	101300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015921	TTAATA	2	12	189556	189567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015921	TTAAAA	2	12	333301	333312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015921	TAAGCT	2	12	353782	353793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015921	TAATAG	2	12	353876	353887	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015921	ATAATT	2	12	364083	364094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015921	ATTAAA	2	12	372648	372659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015921	AAATTT	2	12	388830	388841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015921	AAAATA	2	12	393696	393707	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015921	TTATAT	2	12	394810	394821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015921	TTTCCA	2	12	406502	406513	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015921	TTCAAA	2	12	415106	415117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015921	AATTAA	2	12	416844	416855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015921	TAAAAA	2	12	433673	433684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015921	ATTAGT	2	12	433838	433849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015921	TCGCTT	2	12	436034	436045	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015921	ATAAAA	2	12	436921	436932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015921	ATTAGT	2	12	437087	437098	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015921	TCGCTT	2	12	439283	439294	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015921	ATAAAA	2	12	442359	442370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015921	TTCGCC	2	12	444210	444221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015921	TAAAAA	2	12	449908	449919	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015921	TAAAAA	2	12	457038	457049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015921	ATTTTA	2	12	492874	492885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015921	TTTTGT	2	12	530613	530624	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015921	AATAAG	2	12	545400	545411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015921	TAATTA	2	12	587711	587722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015921	TTAAAA	2	12	646663	646674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015921	AATTTA	2	12	697541	697552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015921	ATTATA	2	12	728687	728698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015921	TTATTT	2	12	751690	751701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015921	AATTTT	2	12	755342	755353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015921	TCTTTT	2	12	797850	797861	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015921	AATTAA	2	12	820251	820262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015921	TTTTTC	2	12	850063	850074	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015921	TAACTT	2	12	857503	857514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015921	TTTATT	2	12	857597	857608	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.