MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 chromosome

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015921	ACAAG	2	10	698	707	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015921	CTTAA	3	15	20013	20027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015921	AATTA	2	10	22753	22762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015921	TAAAT	2	10	35863	35872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015921	AAATA	2	10	46721	46730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015921	AAATT	2	10	49267	49276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015921	AATTA	2	10	56791	56800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015921	TTTTA	2	10	56801	56810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015921	ATAAA	2	10	70326	70335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015921	AAATA	2	10	72602	72611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015921	AAAAT	2	10	80852	80861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015921	TACAA	2	10	107986	107995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015921	ACAAT	2	10	120467	120476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015921	TAAAA	2	10	131033	131042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015921	TTATA	2	10	131045	131054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015921	AAAAT	2	10	141443	141452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015921	TATAA	2	10	143812	143821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015921	AATTA	2	10	147229	147238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015921	ATTTA	2	10	158151	158160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015921	TTTAA	2	10	188949	188958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015921	TAAAA	2	10	193312	193321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015921	GTCAA	2	10	202381	202390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015921	AAATT	2	10	208192	208201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015921	TAAAA	2	10	243454	243463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015921	ATAAA	2	10	244196	244205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015921	AGAAA	2	10	244225	244234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015921	AGAAA	2	10	247058	247067	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015921	TTAAT	2	10	248663	248672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015921	TTTAA	2	10	248710	248719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015921	TAAAA	2	10	251653	251662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015921	AACAA	2	10	262318	262327	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015921	CTTTG	2	10	272227	272236	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015921	TATAA	3	15	272294	272308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015921	TTTTA	2	10	272337	272346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015921	AAACA	2	10	316688	316697	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015921	ATCAA	2	10	316795	316804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015921	AAATA	2	10	324878	324887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015921	TAATT	2	10	326357	326366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015921	ATTAA	2	10	335036	335045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015921	TTAAT	2	10	336684	336693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015921	ATTTT	2	10	336782	336791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015921	AAAGC	2	10	338481	338490	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015921	AGTAA	2	10	343493	343502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015921	ATAAA	2	10	353896	353905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015921	AAAGT	2	10	355389	355398	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015921	TAAAA	2	10	359634	359643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015921	TTTAT	2	10	374421	374430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015921	TAAAA	2	10	393746	393755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015921	AATCC	2	10	394722	394731	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015921	TTAAT	2	10	409203	409212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015921	CTCCC	2	10	436179	436188	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
52	NC_015921	ATAAA	2	10	436896	436905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015921	CTCCC	2	10	439428	439437	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
54	NC_015921	AAAAG	2	10	443348	443357	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015921	AAAAC	2	10	448208	448217	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015921	TTTAT	2	10	458307	458316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015921	TCAAC	2	10	462794	462803	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015921	TTGTG	2	10	471296	471305	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015921	TGCTT	2	10	481321	481330	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015921	TTTTA	2	10	488437	488446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015921	TTATT	2	10	490988	490997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015921	TAATT	2	10	530719	530728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015921	TTTTA	2	10	536845	536854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015921	TTTTA	2	10	536869	536878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015921	ATTTT	2	10	563384	563393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015921	TAATT	2	10	563431	563440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015921	TTTAA	2	10	571257	571266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015921	TATTT	2	10	573348	573357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015921	ATTTA	2	10	574722	574731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015921	AAATT	2	10	574801	574810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015921	TAGTT	5	25	585404	585428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015921	TTTTA	2	10	587691	587700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015921	ATTTA	2	10	588410	588419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015921	ATTTG	2	10	588563	588572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015921	TAGAT	2	10	596931	596940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015921	GGATA	2	10	604516	604525	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015921	TAAAT	2	10	608623	608632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015921	ATTGA	2	10	608648	608657	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015921	ATGTT	2	10	616304	616313	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015921	ATTGT	2	10	628217	628226	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015921	TATAT	2	10	632005	632014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015921	TAATT	2	10	640786	640795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015921	TTTAT	2	10	643146	643155	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015921	ATTTT	2	10	660452	660461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015921	TTAAA	2	10	660485	660494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015921	ATTTT	2	10	672460	672469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015921	TTGAT	2	10	672509	672518	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015921	TTAAA	2	10	684097	684106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015921	TATAA	2	10	685880	685889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015921	TAATT	2	10	700541	700550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015921	TAGAA	2	10	712523	712532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015921	TATAA	2	10	721739	721748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015921	TTTTG	2	10	736411	736420	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015921	ATTAT	2	10	740185	740194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015921	ATTTT	2	10	742446	742455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015921	ATTTT	2	10	751746	751755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015921	ATTTT	2	10	751851	751860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015921	AATAA	2	10	751864	751873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015921	AAATT	2	10	764279	764288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015921	TTTGT	2	10	773063	773072	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015921	ATTGT	2	10	775201	775210	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015921	ATTTT	2	10	780300	780309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015921	TTAAT	2	10	780968	780977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015921	TTTTG	2	10	786942	786951	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015921	CTTAA	2	10	796609	796618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015921	ATTAT	2	10	796621	796630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015921	TTTTA	2	10	800287	800296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015921	ATTTT	2	10	807109	807118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015921	TTCAA	2	10	807129	807138	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015921	TAAAT	2	10	810832	810841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015921	ATAAA	2	10	813000	813009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015921	TTTGT	2	10	814843	814852	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015921	CTTTT	2	10	816104	816113	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015921	GATTT	2	10	818132	818141	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015921	TAAAT	2	10	826799	826808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015921	CTTTT	2	10	836647	836656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015921	GTTTA	2	10	840060	840069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015921	AACTA	2	10	857528	857537	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015921	ATATA	2	10	857610	857619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015921	GTTTT	2	10	857711	857720	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015921	TTTAT	2	10	863942	863951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015921	AGTTT	2	10	867612	867621	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015921	TTTTG	2	10	878519	878528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015921	TTTTA	2	10	885703	885712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015921	AAATT	2	10	899304	899313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.