MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 chromosome

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015921	TAAT	2	8	51	58	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015921	AAGT	2	8	7440	7447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015921	TTAT	2	8	8355	8362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015921	ATTT	2	8	25708	25715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015921	ATTT	2	8	40771	40778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015921	AATT	2	8	46467	46474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015921	AAGC	2	8	46893	46900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015921	AATT	2	8	47882	47889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015921	ATTT	2	8	59005	59012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015921	CAAA	2	8	60534	60541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015921	GAAA	2	8	70122	70129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015921	AAAT	2	8	70130	70137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015921	TACA	2	8	83827	83834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015921	AGCA	2	8	93959	93966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015921	ATAA	2	8	98679	98686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015921	ATTT	2	8	101205	101212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015921	TTTA	2	8	108016	108023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015921	CTTT	2	8	110832	110839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015921	TTAG	2	8	112604	112611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015921	TATT	2	8	114419	114426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015921	ATAA	2	8	114557	114564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015921	TTCT	2	8	130894	130901	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015921	TTAA	2	8	143778	143785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015921	ATTA	2	8	143803	143810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015921	TTTA	2	8	143852	143859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015921	ACAG	2	8	148349	148356	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015921	AAAT	2	8	150531	150538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015921	GGTA	2	8	155983	155990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015921	ACAA	2	8	159010	159017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015921	AAAT	2	8	162710	162717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015921	ATTA	2	8	169073	169080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015921	ATCT	2	8	178500	178507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015921	TAAT	2	8	182532	182539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015921	AAAT	2	8	188172	188179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015921	TTTA	2	8	188211	188218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015921	AATC	2	8	189678	189685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015921	CATT	2	8	193217	193224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015921	TATT	2	8	193277	193284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015921	AGCT	2	8	205753	205760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015921	ATTT	2	8	205937	205944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015921	ATTT	2	8	206028	206035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015921	TACA	2	8	208140	208147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015921	TAAA	2	8	208148	208155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015921	AAAT	3	12	220691	220702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015921	TAAT	2	8	220703	220710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015921	TAAT	2	8	220727	220734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015921	AATA	2	8	230305	230312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015921	TCAA	2	8	236999	237006	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015921	ACAA	2	8	237797	237804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015921	TAAT	2	8	237807	237814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015921	AAAT	2	8	237829	237836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015921	AAAT	2	8	237851	237858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015921	CAAA	2	8	243371	243378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015921	TAAA	2	8	244112	244119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015921	TTAA	2	8	244279	244286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015921	TGCA	2	8	246850	246857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015921	CAAA	2	8	250841	250848	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015921	ATTT	2	8	250859	250866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015921	AAAT	2	8	262540	262547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015921	TAAA	2	8	268079	268086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015921	GCTT	2	8	275174	275181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015921	TTTA	2	8	275645	275652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015921	TAAA	3	12	288510	288521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015921	TAAT	2	8	316730	316737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015921	AATA	2	8	333092	333099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015921	AAAT	2	8	333315	333322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015921	TAAA	2	8	338617	338624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015921	CTTT	2	8	343398	343405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015921	TAAA	2	8	344856	344863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015921	TCAT	2	8	345799	345806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015921	TATT	2	8	353816	353823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015921	ATTC	2	8	366853	366860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015921	AATA	2	8	372671	372678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015921	ATTT	2	8	372679	372686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015921	TATT	2	8	390328	390335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015921	AATA	2	8	390343	390350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015921	TCTA	2	8	390393	390400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015921	AATC	2	8	393645	393652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015921	ATTT	2	8	393666	393673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015921	TTTA	2	8	393738	393745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015921	AAAC	2	8	393988	393995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015921	CATT	2	8	394036	394043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015921	CTTT	2	8	394219	394226	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015921	TGAT	2	8	394262	394269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015921	CATA	2	8	394489	394496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015921	TAAC	2	8	394668	394675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015921	TCCT	2	8	407899	407906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015921	AAAT	2	8	409939	409946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015921	TATT	2	8	411557	411564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015921	TTAT	2	8	415058	415065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015921	AATT	2	8	415066	415073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015921	CTTA	2	8	415078	415085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015921	TTAT	2	8	415278	415285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015921	ACAA	3	12	415359	415370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015921	TAAT	2	8	416832	416839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015921	AAGC	2	8	416862	416869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015921	AAAT	2	8	423018	423025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015921	TTAT	2	8	423147	423154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015921	AAAT	2	8	433637	433644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015921	TACG	2	8	434980	434987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015921	ACCT	2	8	435044	435051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015921	CTAC	2	8	435114	435121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015921	GTTT	2	8	435875	435882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015921	CTAA	2	8	436010	436017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015921	AATT	2	8	436127	436134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015921	TCGC	2	8	436500	436507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015921	AACA	2	8	436878	436885	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015921	TACG	2	8	438229	438236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015921	ACCT	2	8	438293	438300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015921	CTAC	2	8	438363	438370	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015921	GTTT	2	8	439124	439131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015921	CTAA	2	8	439259	439266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015921	AATT	2	8	439376	439383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015921	TCGC	2	8	439749	439756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015921	TAAA	2	8	440123	440130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015921	AATA	2	8	441845	441852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015921	TAAA	2	8	442054	442061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015921	TAGT	2	8	442204	442211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015921	TACT	2	8	442240	442247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015921	TTAA	2	8	442260	442267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015921	ATTT	2	8	442303	442310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015921	GCTA	2	8	442853	442860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015921	TTCT	2	8	444229	444236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015921	AATT	2	8	444760	444767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015921	CTTA	2	8	444998	445005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015921	TAAA	2	8	445758	445765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015921	ATAA	2	8	446495	446502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015921	TTCA	2	8	446546	446553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015921	TAAA	2	8	446555	446562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015921	AAAG	2	8	446658	446665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015921	CAAT	2	8	447439	447446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015921	AAAC	2	8	447452	447459	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015921	AATA	2	8	447482	447489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015921	ATGC	2	8	448132	448139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015921	TCCA	2	8	450746	450753	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015921	CATT	2	8	455228	455235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015921	TAGA	2	8	455334	455341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015921	TGTT	2	8	462755	462762	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015921	TTAT	2	8	462776	462783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015921	TATT	2	8	464066	464073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015921	ATTT	2	8	464127	464134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015921	TTGT	2	8	471355	471362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015921	AATT	2	8	471380	471387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015921	GGAA	2	8	471400	471407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015921	TTTA	2	8	480098	480105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015921	TTGT	2	8	481018	481025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015921	TAAT	2	8	483599	483606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015921	TATT	2	8	483639	483646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015921	TAAA	2	8	483657	483664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015921	TTTG	2	8	484277	484284	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015921	TTTG	2	8	484390	484397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.