MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp54

Total Repeats: 351

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015919	TTA	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015919	TAA	2	6	23	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015919	TAA	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015919	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015919	TAA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015919	A	8	8	126	133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015919	TAA	3	9	134	142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015919	AT	3	6	220	225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015919	A	6	6	244	249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015919	AAAT	2	8	316	323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015919	ATA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015919	AAC	2	6	346	351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015919	CTTT	2	8	383	390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015919	TTA	2	6	396	401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015919	AGA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015919	CTT	2	6	431	436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015919	A	6	6	441	446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015919	TAT	2	6	477	482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015919	TAAT	2	8	500	507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015919	TCT	2	6	560	565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015919	TCT	2	6	581	586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015919	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015919	AAAC	2	8	619	626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015919	TAT	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015919	ATA	2	6	691	696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015919	ACA	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015919	ATTTA	2	10	1214	1223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015919	AAAT	2	8	1231	1238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015919	CAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015919	CT	4	8	1269	1276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015919	ATT	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015919	AAC	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015919	TAA	3	9	1414	1422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015919	ATT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015919	ATT	2	6	1451	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015919	TAAT	2	8	1473	1480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015919	AAT	2	6	1487	1492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015919	TAAT	2	8	2040	2047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015919	TAG	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015919	ACT	2	6	2070	2075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015919	AGA	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015919	A	7	7	3025	3031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015919	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015919	TAAA	2	8	4331	4338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015919	TACA	2	8	4353	4360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015919	ATT	2	6	4378	4383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015919	TTA	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015919	TGT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015919	T	6	6	4429	4434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015919	A	6	6	4440	4445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015919	TAAA	2	8	4462	4469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015919	TAA	2	6	4519	4524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015919	ATT	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015919	TAA	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015919	AAATTT	2	12	4594	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015919	CAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015919	AACA	2	8	4630	4637	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015919	TAAAA	2	10	4686	4695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015919	A	6	6	4692	4697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015919	TAAA	2	8	5218	5225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015919	T	6	6	5227	5232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015919	A	8	8	5233	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015919	AT	3	6	5252	5257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015919	ATA	2	6	5271	5276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015919	AAATA	2	10	5306	5315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015919	A	6	6	7208	7213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015919	ATAA	2	8	8292	8299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015919	CTTTTT	2	12	9286	9297	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015919	T	6	6	9321	9326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015919	A	7	7	9327	9333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015919	AAACT	2	10	9381	9390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015919	TTA	2	6	9400	9405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015919	ATTTT	2	10	9408	9417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015919	T	8	8	9414	9421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015919	TTAT	2	8	9436	9443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015919	AT	3	6	9497	9502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015919	TA	3	6	11232	11237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015919	C	6	6	11244	11249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_015919	TTA	2	6	11277	11282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015919	TA	3	6	11301	11306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015919	ATAACA	2	12	11374	11385	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015919	ACT	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015919	TGAA	2	8	11514	11521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015919	ATAA	3	12	11524	11535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015919	AAT	2	6	11536	11541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015919	TAA	2	6	11551	11556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015919	TAAA	2	8	11589	11596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015919	AAT	2	6	11611	11616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015919	TTA	2	6	11634	11639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015919	ATA	2	6	11643	11648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015919	TAT	2	6	11652	11657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015919	ACTT	2	8	11662	11669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015919	T	8	8	11707	11714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015919	T	6	6	11718	11723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015919	TACTT	2	10	11733	11742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015919	T	6	6	11741	11746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015919	ATTA	2	8	11760	11767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015919	ACT	2	6	11784	11789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015919	AGAA	2	8	13011	13018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015919	AGG	2	6	14390	14395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015919	ATTT	2	8	14951	14958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015919	AAAG	2	8	15068	15075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015919	TTAAA	2	10	15096	15105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015919	T	6	6	15113	15118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015919	T	8	8	15164	15171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015919	TAT	2	6	15178	15183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015919	A	6	6	15188	15193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015919	TAAA	2	8	15369	15376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015919	TATT	2	8	15394	15401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015919	GTT	2	6	15908	15913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015919	TTG	2	6	15964	15969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015919	GGTTG	2	10	16026	16035	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015919	TGG	2	6	16059	16064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015919	TAA	2	6	16686	16691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015919	AGC	2	6	16693	16698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015919	AATATT	2	12	16704	16715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015919	AAAAT	2	10	16744	16753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015919	CCT	2	6	17346	17351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015919	TTTA	2	8	17363	17370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015919	TTA	2	6	17395	17400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015919	ATAAA	3	15	17404	17418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015919	ATTTT	2	10	17522	17531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015919	TAT	2	6	17669	17674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015919	T	6	6	17674	17679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015919	AG	3	6	17794	17799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015919	CCG	2	6	18057	18062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015919	CAA	2	6	18064	18069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015919	AT	3	6	18071	18076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015919	T	6	6	18094	18099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015919	ATTT	2	8	18108	18115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015919	TTA	2	6	18116	18121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015919	AT	3	6	18140	18145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015919	TTAA	2	8	18150	18157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015919	ATT	2	6	18158	18163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015919	ATA	2	6	18165	18170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015919	A	6	6	18170	18175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015919	AAT	2	6	18177	18182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015919	TTAA	2	8	18206	18213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015919	T	6	6	20204	20209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015919	TTA	2	6	20211	20216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015919	ATT	2	6	20220	20225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015919	T	7	7	20241	20247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015919	A	6	6	20260	20265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015919	TAAA	2	8	20301	20308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015919	T	6	6	20327	20332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015919	T	6	6	20347	20352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015919	A	6	6	20355	20360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015919	T	7	7	20416	20422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015919	TTG	2	6	20431	20436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015919	TAATT	2	10	20447	20456	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015919	TAT	2	6	20459	20464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015919	T	7	7	20464	20470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015919	AAG	2	6	20475	20480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015919	TTA	2	6	20966	20971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015919	AT	3	6	21002	21007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015919	ATGT	2	8	21037	21044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015919	TCC	2	6	21092	21097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_015919	AT	3	6	21130	21135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015919	TA	4	8	21141	21148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015919	TAA	2	6	21669	21674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015919	T	6	6	21676	21681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015919	CCT	2	6	23325	23330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_015919	TAA	2	6	23342	23347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015919	T	6	6	23375	23380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015919	TTTG	2	8	23396	23403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015919	T	7	7	23416	23422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015919	T	6	6	23424	23429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015919	AAG	2	6	23581	23586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015919	TTG	2	6	23598	23603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015919	AT	4	8	23623	23630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015919	CT	3	6	23631	23636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_015919	T	8	8	23640	23647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015919	AAT	2	6	23650	23655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_015919	TTA	2	6	23759	23764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_015919	CT	3	6	25158	25163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_015919	TTAAT	2	10	25198	25207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_015919	ATT	2	6	25220	25225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015919	TAAT	2	8	25297	25304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015919	T	7	7	25334	25340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015919	TAAT	2	8	25407	25414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015919	ATA	3	9	25420	25428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015919	A	6	6	25437	25442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015919	ATA	2	6	25454	25459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_015919	TTTG	2	8	27338	27345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015919	A	6	6	27408	27413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015919	ATT	2	6	27418	27423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015919	A	6	6	30670	30675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015919	TAAAAA	4	24	30676	30699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015919	TAAA	2	8	30700	30707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015919	A	7	7	30712	30718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015919	AGG	2	6	30730	30735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015919	TTG	2	6	32258	32263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_015919	TTAA	2	8	32309	32316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_015919	A	6	6	35955	35960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_015919	TAA	2	6	39132	39137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_015919	ATT	2	6	48558	48563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015919	ATTAA	2	10	48580	48589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015919	TAGAT	2	10	48600	48609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015919	A	9	9	48635	48643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015919	GAA	2	6	48646	48651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015919	T	6	6	48690	48695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015919	ACTAAT	2	12	49521	49532	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
297	NC_015919	ATA	2	6	49548	49553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015919	TAA	2	6	49568	49573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015919	ATA	3	9	49581	49589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015919	TAT	2	6	49618	49623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_015919	A	9	9	49682	49690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_015919	GAA	2	6	49693	49698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_015919	AT	3	6	49730	49735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_015919	T	6	6	51808	51813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_015919	AAC	2	6	51841	51846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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332	NC_015919	TAA	2	6	52881	52886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_015919	T	6	6	54165	54170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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346	NC_015919	TAA	2	6	54276	54281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.