MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-7

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015918	ACA	2	6	35	40	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015918	ATA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015918	ATT	2	6	117	122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015918	ACA	3	9	123	131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015918	CTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015918	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015918	ACT	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015918	ATT	2	6	1544	1549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015918	AGG	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015918	ATT	2	6	2097	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015918	AAT	2	6	2109	2114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015918	CTA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015918	CTT	3	9	2232	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015918	CAT	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015918	TTG	2	6	2677	2682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015918	AGA	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015918	ATA	2	6	2970	2975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015918	ACT	3	9	3081	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015918	TAT	2	6	3115	3120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015918	TAT	2	6	3215	3220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015918	AGG	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015918	TTA	2	6	4563	4568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015918	TCT	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015918	TAA	2	6	5001	5006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015918	TAA	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015918	ATC	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015918	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015918	ATA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015918	GAA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015918	TCT	2	6	5503	5508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015918	TAA	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015918	TAA	2	6	5679	5684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015918	ATA	2	6	5687	5692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015918	TAA	2	6	5785	5790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015918	TAA	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015918	TTA	2	6	5809	5814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015918	ATA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015918	TCT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015918	ATT	2	6	5971	5976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015918	ACT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015918	TAA	2	6	6077	6082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015918	AAG	3	9	6120	6128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015918	TAA	2	6	6133	6138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015918	AAG	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015918	GAA	2	6	6609	6614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015918	AAC	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015918	TAA	2	6	6927	6932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015918	ATT	2	6	7031	7036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015918	TAT	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015918	ATA	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015918	TAT	2	6	7208	7213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015918	TCA	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015918	ATA	2	6	7309	7314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015918	GGA	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015918	AAT	2	6	7385	7390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015918	TGA	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015918	TAA	2	6	7541	7546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015918	TCT	2	6	7852	7857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015918	TAA	2	6	7868	7873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015918	GCA	2	6	7948	7953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015918	TAA	2	6	7980	7985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015918	TTA	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015918	TTA	2	6	8145	8150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015918	TCT	2	6	8193	8198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015918	TAT	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015918	ATA	2	6	8339	8344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015918	AGT	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015918	ATT	2	6	8477	8482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015918	TGA	2	6	8761	8766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015918	TTC	2	6	8786	8791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015918	TTA	2	6	8992	8997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015918	TAT	2	6	9033	9038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015918	ATT	2	6	9472	9477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015918	TAA	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015918	TTA	2	6	10643	10648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015918	ATT	2	6	10660	10665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015918	ATA	2	6	10682	10687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015918	ATT	2	6	10705	10710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015918	TTA	2	6	10786	10791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015918	TAA	2	6	10970	10975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015918	TCA	2	6	11052	11057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015918	ATT	2	6	11236	11241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015918	AAT	2	6	11268	11273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015918	ATA	2	6	12208	12213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015918	GTA	2	6	12219	12224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015918	GAA	2	6	12278	12283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015918	AAT	2	6	12388	12393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015918	AAC	2	6	12460	12465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015918	CAG	2	6	12532	12537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015918	AGG	2	6	12714	12719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015918	TAA	2	6	12764	12769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015918	ATT	2	6	12796	12801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015918	GAT	2	6	12946	12951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015918	CTC	2	6	13025	13030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015918	CAG	2	6	13055	13060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015918	CCT	2	6	14266	14271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015918	AAT	2	6	14278	14283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015918	ATA	2	6	14286	14291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015918	CAT	2	6	14459	14464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015918	AAG	2	6	14476	14481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015918	ATT	2	6	14518	14523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015918	TAT	2	6	14598	14603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015918	TAT	2	6	14611	14616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015918	ATT	2	6	14675	14680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015918	TCT	2	6	15523	15528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015918	TAT	2	6	15672	15677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015918	AGA	2	6	15693	15698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015918	ATT	2	6	17361	17366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015918	AGA	2	6	17410	17415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015918	TTA	2	6	17437	17442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015918	ATT	2	6	17453	17458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015918	AAT	2	6	17571	17576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015918	TTA	3	9	17585	17593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015918	TGT	2	6	17673	17678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015918	ATT	2	6	17929	17934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015918	TAA	2	6	17945	17950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015918	TAC	2	6	18649	18654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015918	CTT	2	6	18691	18696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015918	ATA	2	6	18740	18745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015918	TAC	3	9	18771	18779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015918	ACT	2	6	18927	18932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015918	ATA	3	9	19243	19251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015918	TTG	2	6	19260	19265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015918	CAA	2	6	19289	19294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015918	CCT	2	6	19960	19965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015918	TAA	2	6	19967	19972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015918	TTC	2	6	22152	22157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015918	TAG	2	6	22166	22171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015918	TAA	2	6	22233	22238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015918	CCT	2	6	22400	22405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015918	TAC	2	6	22497	22502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015918	AAG	2	6	22580	22585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015918	TGG	2	6	22826	22831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015918	GTT	2	6	23144	23149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015918	GTT	2	6	23213	23218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015918	TTA	2	6	23326	23331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015918	AAT	2	6	23368	23373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015918	GCG	2	6	23456	23461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015918	CAC	2	6	23662	23667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015918	CAC	2	6	23675	23680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_015918	CGC	2	6	23682	23687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015918	TAA	2	6	23698	23703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015918	AAT	2	6	23834	23839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015918	GAT	3	9	23965	23973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015918	TTA	2	6	23991	23996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015918	GTA	2	6	24111	24116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015918	AAT	2	6	24185	24190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015918	CGC	2	6	24213	24218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_015918	GAA	2	6	24261	24266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015918	ATT	2	6	24272	24277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_015918	GTT	2	6	24858	24863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015918	GTA	2	6	25607	25612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_015918	TGC	2	6	30443	30448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.