MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella pinnipedialis B2/94 chromosome 2

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015858	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015858	GCCGA	2	10	15121	15130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015858	AGCGG	2	10	22143	22152	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015858	GCGCA	2	10	28358	28367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015858	TCGGT	2	10	28575	28584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015858	GGCCT	2	10	37536	37545	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015858	ATGAA	2	10	40107	40116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015858	TTTGT	2	10	41268	41277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015858	CGCTC	2	10	43477	43486	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015858	TGCGG	2	10	60844	60853	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015858	TATCT	2	10	73100	73109	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015858	TCGGT	2	10	81777	81786	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015858	TTCTC	2	10	81806	81815	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015858	ACTTG	2	10	87335	87344	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015858	CGGTA	2	10	97198	97207	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015858	CCAAG	2	10	97373	97382	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015858	CTTGC	2	10	108032	108041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015858	CCTGC	2	10	112706	112715	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_015858	GCCCG	2	10	115966	115975	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_015858	GTTCG	2	10	117278	117287	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015858	GAAAA	2	10	119209	119218	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015858	AGATA	2	10	134643	134652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015858	GGGCA	3	15	140814	140828	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015858	CCGGG	2	10	152363	152372	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015858	CGGAT	2	10	160853	160862	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015858	TGGGC	2	10	160984	160993	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015858	TGTTT	2	10	161437	161446	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015858	CCCGT	2	10	162162	162171	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_015858	GCCGA	2	10	176351	176360	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015858	GCCCC	2	10	176378	176387	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_015858	GGATA	2	10	189420	189429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015858	TGACG	2	10	193166	193175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015858	AGCAG	2	10	204964	204973	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015858	TTTTG	2	10	210547	210556	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015858	ATCAA	2	10	210715	210724	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015858	TGAAA	2	10	210725	210734	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015858	GGCCG	2	10	213359	213368	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015858	TAAGT	2	10	215852	215861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015858	CGCGG	2	10	228669	228678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015858	TCTGG	2	10	231566	231575	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015858	CGCTG	2	10	255504	255513	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015858	GCGCC	2	10	259321	259330	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_015858	AGGCA	2	10	262405	262414	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015858	AGCCG	2	10	262460	262469	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015858	TGATC	2	10	263527	263536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015858	GCTTT	2	10	307204	307213	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015858	TTTGT	2	10	325193	325202	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015858	GGTGG	2	10	342674	342683	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015858	TTTGT	2	10	349343	349352	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015858	GCGCC	2	10	367139	367148	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_015858	TGGAG	2	10	393695	393704	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015858	TCATA	2	10	394786	394795	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015858	AGCAA	2	10	401142	401151	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015858	CGGAA	2	10	427834	427843	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015858	GCGCC	2	10	432886	432895	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_015858	CTGAT	2	10	432965	432974	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015858	ATCCC	2	10	440392	440401	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_015858	AAGAA	2	10	441621	441630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015858	GCTGT	2	10	442724	442733	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015858	TTCCA	2	10	454849	454858	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015858	GCGAG	2	10	455139	455148	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015858	AAAGC	2	10	461097	461106	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015858	ACTGG	2	10	487995	488004	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015858	CGGCC	2	10	497007	497016	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_015858	GAACA	2	10	525270	525279	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015858	CGATC	2	10	525373	525382	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015858	GCCAT	2	10	525654	525663	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015858	GCCAC	2	10	525841	525850	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_015858	CCGGC	2	10	528880	528889	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_015858	CTTAA	2	10	544965	544974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015858	CCAGC	2	10	544982	544991	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_015858	CTGAT	2	10	557478	557487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015858	ATTCC	2	10	560485	560494	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015858	CTTTT	2	10	560851	560860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015858	CGAAA	2	10	570229	570238	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015858	CCCCT	2	10	571399	571408	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
77	NC_015858	CTCCC	3	15	571895	571909	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_015858	CCGTC	2	10	571982	571991	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_015858	AAAGG	2	10	578973	578982	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015858	GTCGA	2	10	593230	593239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015858	ACAAA	2	10	629964	629973	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015858	TTTGC	2	10	653915	653924	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015858	ATTTC	2	10	656747	656756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015858	GCAGA	2	10	660643	660652	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015858	GCCTT	2	10	662091	662100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015858	GTTTT	2	10	672487	672496	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015858	ACAAA	2	10	684723	684732	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015858	ACCCG	2	10	686171	686180	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_015858	TCGCT	2	10	691239	691248	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015858	GCCTT	2	10	728363	728372	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015858	GAGCA	2	10	729098	729107	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015858	ACGGC	2	10	748375	748384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015858	TAATC	2	10	759131	759140	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015858	TTACG	2	10	764441	764450	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015858	TCAGG	2	10	775701	775710	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015858	ATTAT	2	10	810360	810369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015858	TCAAA	2	10	834871	834880	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015858	ACAAA	2	10	838366	838375	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015858	TCCCC	2	10	847157	847166	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
100	NC_015858	CATTC	2	10	861206	861215	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015858	GCAGT	2	10	877272	877281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015858	TGCGA	2	10	889928	889937	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015858	AGAGG	2	10	900148	900157	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015858	GGAAA	2	10	901439	901448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015858	AGCGC	2	10	901503	901512	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015858	CAATT	2	10	925281	925290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015858	CGTAT	2	10	925292	925301	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015858	GAAAA	2	10	930466	930475	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015858	GGTTT	2	10	938401	938410	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015858	TGATA	2	10	945376	945385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015858	CGGAA	2	10	965356	965365	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015858	GTTCC	2	10	965971	965980	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015858	CCCTC	2	10	968115	968124	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
114	NC_015858	GTTTC	2	10	970922	970931	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015858	GCCGC	2	10	971544	971553	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_015858	GCCAT	2	10	971566	971575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_015858	CCGGC	2	10	971639	971648	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_015858	ACAAA	2	10	978845	978854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015858	ATGTC	2	10	987101	987110	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015858	GGTGG	2	10	1007200	1007209	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015858	CATGG	2	10	1010967	1010976	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015858	CCGGG	4	20	1010977	1010996	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_015858	GCCTC	2	10	1011036	1011045	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_015858	GCCTG	2	10	1011528	1011537	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_015858	TTCAG	2	10	1019137	1019146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015858	ATGCC	2	10	1019149	1019158	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015858	AGGCC	2	10	1025736	1025745	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015858	CGCGC	3	15	1028927	1028941	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_015858	CCCTT	2	10	1030368	1030377	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_015858	GGCCG	2	10	1039787	1039796	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_015858	CCCCG	2	10	1046075	1046084	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
132	NC_015858	TAAAA	2	10	1050151	1050160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015858	AGCGA	2	10	1080866	1080875	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015858	CGCTT	2	10	1090707	1090716	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_015858	TGCGC	2	10	1094418	1094427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_015858	TTTCA	2	10	1103662	1103671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015858	CGCCT	2	10	1110045	1110054	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_015858	ATTAA	2	10	1111453	1111462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015858	AACCG	2	10	1113281	1113290	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015858	TTTTC	2	10	1123407	1123416	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015858	GTTGA	2	10	1126774	1126783	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015858	GAAAG	2	10	1155499	1155508	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015858	TTCAA	2	10	1159014	1159023	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015858	CCTCT	2	10	1159032	1159041	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
145	NC_015858	GCTGT	2	10	1160643	1160652	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015858	CGAAG	2	10	1161456	1161465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015858	AGCCC	2	10	1162010	1162019	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_015858	CACGA	2	10	1162155	1162164	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_015858	TTATT	2	10	1167953	1167962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015858	TGCGG	2	10	1189499	1189508	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
151	NC_015858	TTCTG	2	10	1204178	1204187	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015858	GGAAG	2	10	1236319	1236328	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015858	ACGGC	2	10	1248192	1248201	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_015858	GTTAC	2	10	1250840	1250849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_015858	GATCG	2	10	1254015	1254024	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_015858	GCGCC	2	10	1254183	1254192	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.