MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) chromosome

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015662	ATTAA	2	10	4518	4527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015662	GATAA	2	10	5751	5760	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015662	TTTAA	2	10	7228	7237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015662	ATTTA	2	10	7332	7341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015662	TTAAT	2	10	7357	7366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015662	TAAGT	2	10	7437	7446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015662	AAATA	2	10	11949	11958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015662	AAAAT	2	10	16300	16309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015662	ATGTT	2	10	18720	18729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015662	ATTAA	2	10	30762	30771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015662	TAAAA	3	15	33112	33126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015662	ATATA	2	10	33451	33460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015662	ATTTG	2	10	33895	33904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015662	TATAT	2	10	33916	33925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015662	ATTTT	2	10	34067	34076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015662	TATAA	2	10	34326	34335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015662	TAATA	2	10	35315	35324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015662	AAGAT	2	10	36036	36045	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015662	TAAAA	2	10	38874	38883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015662	ATTTT	2	10	38884	38893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015662	TAATT	2	10	38952	38961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015662	ATATT	2	10	43537	43546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015662	TAAAT	2	10	44588	44597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015662	TAAAT	2	10	44618	44627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015662	TAAAA	2	10	49047	49056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015662	ATTTT	2	10	50781	50790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015662	TATAA	2	10	50978	50987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015662	ATTAT	2	10	59149	59158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015662	TTTAT	2	10	61748	61757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015662	ATTTT	2	10	64332	64341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015662	ATAAA	2	10	64475	64484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015662	TAAAT	2	10	65796	65805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015662	AATTA	2	10	70344	70353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015662	TATTT	2	10	73468	73477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015662	ATAAA	2	10	84013	84022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015662	TCATG	2	10	85495	85504	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015662	ATATT	2	10	86336	86345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015662	ATTAA	2	10	88569	88578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015662	TATAA	2	10	88891	88900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015662	AATAT	2	10	103205	103214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015662	AGAGT	2	10	103560	103569	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015662	ATATA	2	10	105395	105404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015662	TTATT	2	10	114513	114522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015662	ATTTA	2	10	117896	117905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015662	ATCCT	2	10	118691	118700	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015662	TAAAA	2	10	119318	119327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015662	TAATA	2	10	119429	119438	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015662	TTTTA	2	10	130233	130242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015662	TTTTA	2	10	136835	136844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015662	TGTTA	2	10	137889	137898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015662	TATCA	2	10	139337	139346	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015662	ATTAA	2	10	140443	140452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015662	TTAAT	2	10	143073	143082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015662	TTTTC	2	10	144828	144837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015662	GTGTA	2	10	145565	145574	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015662	GTTTA	2	10	145763	145772	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015662	TTTTG	2	10	145989	145998	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015662	ATAAA	2	10	146113	146122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015662	TTTGA	2	10	149317	149326	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015662	ATTAA	2	10	149332	149341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015662	AATAT	2	10	149376	149385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015662	TAATA	2	10	154494	154503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015662	ATATT	2	10	156046	156055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015662	ATTTA	2	10	156186	156195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015662	AAATT	2	10	156197	156206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015662	TAATT	2	10	156983	156992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015662	ATTAT	2	10	157824	157833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015662	ATTTT	2	10	166864	166873	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015662	TTTAT	2	10	167089	167098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015662	TATAA	2	10	170292	170301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015662	TAAAA	2	10	171359	171368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015662	TTTTA	2	10	174989	174998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015662	ATGTT	2	10	175021	175030	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015662	TTAAT	2	10	176930	176939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015662	TAATA	2	10	177119	177128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015662	TATAC	3	15	177129	177143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015662	ATTTA	2	10	178113	178122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015662	TTTTA	2	10	179029	179038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015662	ATTAT	3	15	180434	180448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015662	AATTA	2	10	189084	189093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015662	AAATA	2	10	189167	189176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015662	ATATA	2	10	189256	189265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015662	TAAAA	2	10	194505	194514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015662	TTTTA	2	10	198841	198850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015662	TATTT	2	10	199578	199587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015662	TAAAA	2	10	205492	205501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015662	ATATT	2	10	206960	206969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015662	ATTTA	2	10	209944	209953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015662	TAAAA	2	10	211477	211486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015662	AATAT	2	10	212578	212587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015662	TTTTA	2	10	212611	212620	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015662	AATAT	2	10	214987	214996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015662	TATAG	2	10	215419	215428	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015662	ATTTT	2	10	223054	223063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015662	ATTTA	2	10	224031	224040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015662	TTAAT	2	10	228247	228256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015662	TAAAT	2	10	228379	228388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015662	TTTAT	2	10	228389	228398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015662	ATATA	2	10	228456	228465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015662	TAATT	2	10	228467	228476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015662	ATTAT	2	10	231231	231240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015662	TAATT	2	10	233238	233247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015662	TAATT	2	10	233399	233408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015662	ATTTT	2	10	233436	233445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015662	TTTAT	2	10	244060	244069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015662	TATAA	2	10	248465	248474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015662	ATTTT	2	10	248475	248484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015662	ATTTT	2	10	248581	248590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015662	TAAAT	2	10	251739	251748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015662	TAATT	2	10	252644	252653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015662	ACATT	2	10	252729	252738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015662	ATATT	2	10	254499	254508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015662	AAATA	2	10	254615	254624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015662	TTAAT	2	10	254856	254865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015662	TTTAT	2	10	254914	254923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015662	ATTTT	2	10	256429	256438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015662	AATTT	2	10	256443	256452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015662	ATATT	2	10	256965	256974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015662	TAATA	2	10	257020	257029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015662	TTTAA	2	10	259787	259796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015662	ATTAT	2	10	259892	259901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015662	ATTTT	2	10	259922	259931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015662	TATAT	2	10	264323	264332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015662	TTATA	2	10	264440	264449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015662	ATATA	2	10	264470	264479	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015662	AAAAT	2	10	264595	264604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015662	TATAT	2	10	264896	264905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015662	AATAA	2	10	272953	272962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015662	ATAAA	2	10	272971	272980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015662	TATAA	2	10	277574	277583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015662	AATCA	2	10	278984	278993	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015662	AATTT	2	10	285366	285375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015662	ATAAA	2	10	286568	286577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015662	TAAAA	2	10	289122	289131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015662	TAAAA	2	10	291783	291792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015662	AATTA	2	10	291793	291802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015662	ATCTC	2	10	295479	295488	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015662	TAAAA	2	10	300890	300899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015662	TAATA	2	10	300959	300968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015662	ATTAT	2	10	301545	301554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015662	ATTAT	2	10	301798	301807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015662	TAAAA	2	10	302560	302569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015662	TAAAA	2	10	302648	302657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015662	TATTT	2	10	302958	302967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015662	ATTAT	2	10	307227	307236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015662	ATATT	2	10	310332	310341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015662	ATTTT	2	10	313367	313376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015662	TAATT	2	10	313390	313399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015662	TAATA	2	10	318087	318096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015662	TAAAA	2	10	324199	324208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015662	TACTA	2	10	327822	327831	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015662	TAAAA	2	10	331155	331164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_015662	TAAAA	2	10	376906	376915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_015662	TACAA	2	10	381674	381683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_015662	ATTTT	2	10	381704	381713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_015662	ATATA	2	10	437611	437620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_015662	ATATA	2	10	437808	437817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.