MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) chromosome

Total Repeats: 4861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015662	A	8	8	56387	56394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015662	TAT	2	6	56397	56402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015662	AT	3	6	56401	56406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015662	AT	4	8	56436	56443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015662	TA	3	6	56444	56449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015662	CT	3	6	56451	56456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015662	A	6	6	56485	56490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015662	TAT	2	6	56491	56496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015662	A	8	8	56518	56525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015662	T	8	8	56526	56533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015662	ATT	2	6	57906	57911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015662	TAAATA	2	12	57912	57923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015662	A	7	7	58276	58282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015662	AATA	2	8	59085	59092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015662	ATTA	2	8	59099	59106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015662	TA	3	6	59128	59133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015662	ATTAT	2	10	59149	59158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015662	T	6	6	60213	60218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015662	ATTT	2	8	60237	60244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015662	T	8	8	60259	60266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015662	TAT	2	6	60271	60276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015662	TAA	2	6	60286	60291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015662	A	9	9	60290	60298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015662	ATCT	2	8	60330	60337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_015662	ATAA	2	8	60764	60771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015662	TAA	2	6	60774	60779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015662	TAT	2	6	60783	60788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015662	AT	3	6	60791	60796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015662	ATTA	2	8	60798	60805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015662	TA	3	6	61400	61405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015662	TTA	2	6	61421	61426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015662	TAAA	3	12	61442	61453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015662	AATT	2	8	61459	61466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015662	T	7	7	61484	61490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015662	ATA	2	6	61491	61496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015662	TAAT	2	8	61503	61510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015662	TAAT	2	8	61513	61520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015662	AT	3	6	61519	61524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015662	AT	3	6	61564	61569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015662	ATAA	2	8	61576	61583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015662	A	6	6	61610	61615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015662	T	8	8	61632	61639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015662	A	6	6	61642	61647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015662	T	7	7	61650	61656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015662	TA	3	6	61661	61666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015662	TAA	2	6	61705	61710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015662	A	9	9	61716	61724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015662	A	7	7	61739	61745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015662	TTTAT	2	10	61748	61757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015662	A	8	8	61760	61767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015662	GTA	2	6	61780	61785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015662	A	7	7	61793	61799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015662	GTT	2	6	61806	61811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015662	CAA	2	6	61818	61823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015662	AAT	2	6	61831	61836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015662	TAT	2	6	61870	61875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015662	AT	3	6	61880	61885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015662	TAA	2	6	61915	61920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015662	A	6	6	62924	62929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015662	TAT	2	6	62950	62955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015662	CGA	2	6	62957	62962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015662	A	7	7	62968	62974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015662	TTG	2	6	63001	63006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015662	T	7	7	63035	63041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015662	ATT	2	6	63046	63051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015662	TAA	2	6	63111	63116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015662	TTA	2	6	63121	63126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015662	T	7	7	63267	63273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015662	AT	3	6	63274	63279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015662	AT	3	6	63298	63303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015662	ATT	2	6	63355	63360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015662	TAT	2	6	63418	63423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015662	T	7	7	63454	63460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015662	T	7	7	63462	63468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015662	TTA	2	6	63472	63477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015662	T	8	8	63492	63499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015662	TA	3	6	63504	63509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015662	TTAAAA	2	12	63555	63566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015662	T	6	6	63579	63584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015662	T	7	7	63596	63602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015662	T	6	6	63604	63609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015662	TAT	2	6	63646	63651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015662	AT	3	6	63650	63655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015662	T	10	10	63655	63664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015662	T	8	8	63683	63690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015662	ATA	2	6	63772	63777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015662	T	8	8	63788	63795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015662	T	6	6	63831	63836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015662	T	6	6	63839	63844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015662	ATG	2	6	63847	63852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015662	T	6	6	63859	63864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015662	T	6	6	63866	63871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015662	TTA	2	6	63907	63912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_015662	TTA	2	6	64025	64030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_015662	AT	3	6	64087	64092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015662	T	6	6	64101	64106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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604	NC_015662	TAA	2	6	64161	64166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_015662	AT	3	6	64273	64278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015662	T	9	9	64294	64302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015662	ATT	2	6	64322	64327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015662	ATTTT	2	10	64332	64341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015662	AAT	2	6	64346	64351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015662	T	8	8	64359	64366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015662	ATT	2	6	64372	64377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015662	TTA	2	6	64438	64443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015662	AT	3	6	64444	64449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015662	TA	3	6	64454	64459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015662	AT	3	6	64466	64471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015662	ATAAA	2	10	64475	64484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015662	T	7	7	64487	64493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015662	ACT	2	6	64514	64519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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624	NC_015662	TAAAT	2	10	65796	65805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015662	ATT	2	6	65826	65831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015662	T	7	7	65830	65836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015662	TAA	2	6	65849	65854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015662	AAT	2	6	66867	66872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015662	TA	3	6	68967	68972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015662	TTA	2	6	68982	68987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015662	AT	3	6	70126	70131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015662	TA	4	8	70138	70145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015662	TTA	2	6	70147	70152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015662	ATTA	3	12	70154	70165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015662	A	7	7	70176	70182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015662	T	6	6	70216	70221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015662	CAT	2	6	70222	70227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_015662	T	7	7	70251	70257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015662	AT	3	6	70265	70270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015662	TTTTTA	2	12	70291	70302	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015662	AATTA	2	10	70344	70353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015662	ATA	2	6	71149	71154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_015662	T	7	7	71155	71161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_015662	ATTTTT	2	12	71164	71175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_015662	TAT	3	9	71180	71188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_015662	T	7	7	71197	71203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_015662	ATTTTT	2	12	71206	71217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_015662	TGAA	2	8	71220	71227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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