MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_3p

Total Repeats: 492

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015378	ATC	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015378	TCA	2	6	38	43	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015378	TGA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015378	ACG	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015378	GAA	2	6	6278	6283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015378	CAG	2	6	7381	7386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015378	CGC	2	6	7439	7444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015378	TCC	2	6	7700	7705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015378	CGG	2	6	7759	7764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015378	TCG	2	6	7766	7771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015378	TCA	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015378	CGG	2	6	9678	9683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015378	GCA	2	6	9885	9890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015378	CGC	2	6	10080	10085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015378	CGA	2	6	10161	10166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015378	AGA	2	6	10203	10208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015378	TGT	2	6	10227	10232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015378	CGT	2	6	10394	10399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015378	TGA	2	6	10518	10523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015378	GCC	2	6	10570	10575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015378	TTC	2	6	10611	10616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015378	CAA	2	6	10657	10662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015378	CAA	2	6	10664	10669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015378	CCA	2	6	10714	10719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015378	CGA	2	6	10814	10819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015378	GCG	2	6	10822	10827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015378	GCC	2	6	10918	10923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015378	CAC	2	6	10943	10948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015378	ACG	2	6	11701	11706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015378	TCT	2	6	11904	11909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015378	GCG	2	6	11967	11972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015378	CAT	2	6	12066	12071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015378	GAC	2	6	12130	12135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015378	GTA	3	9	12929	12937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015378	GAT	2	6	15139	15144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015378	GGC	2	6	15217	15222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015378	CCG	2	6	22940	22945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015378	GCC	2	6	22955	22960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015378	ACC	2	6	24823	24828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015378	GCG	2	6	24905	24910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015378	TCT	2	6	24914	24919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015378	CGG	2	6	26386	26391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015378	GGT	2	6	26436	26441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015378	GGC	2	6	26552	26557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015378	CGA	2	6	26585	26590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015378	CGC	2	6	26597	26602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015378	GCG	2	6	26684	26689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015378	ATG	2	6	26694	26699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015378	TGC	2	6	26707	26712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015378	TAT	2	6	26798	26803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015378	ATG	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015378	TGC	2	6	26908	26913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015378	CGA	2	6	27083	27088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015378	GTC	2	6	27186	27191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015378	GAC	2	6	27194	27199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015378	GGC	2	6	27259	27264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015378	AAC	2	6	27304	27309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015378	ATG	2	6	27704	27709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015378	GAC	2	6	27976	27981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015378	CCG	2	6	28132	28137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015378	GGC	2	6	28433	28438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015378	CGT	2	6	28444	28449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015378	AGC	2	6	28542	28547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015378	ATA	2	6	28570	28575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015378	TCG	2	6	28578	28583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015378	TCG	2	6	29463	29468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015378	GCA	2	6	29514	29519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015378	CAG	2	6	29595	29600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015378	TTG	2	6	29613	29618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015378	CCG	2	6	30733	30738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015378	ATT	2	6	30768	30773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015378	GTG	2	6	31436	31441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015378	GCA	2	6	31465	31470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015378	ATT	2	6	31547	31552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015378	GGA	2	6	32571	32576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015378	AGG	2	6	32580	32585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015378	AAG	2	6	33143	33148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015378	CGA	2	6	33150	33155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015378	CAG	2	6	33295	33300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015378	AGG	2	6	33320	33325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015378	TCT	2	6	33365	33370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015378	AGC	2	6	33453	33458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015378	CTG	2	6	33565	33570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015378	TCA	2	6	33590	33595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015378	GCC	2	6	33715	33720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015378	ACT	2	6	33763	33768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015378	ACA	2	6	33834	33839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015378	CCA	2	6	34695	34700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015378	GAG	2	6	34754	34759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015378	GAA	2	6	34777	34782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015378	AGC	2	6	34869	34874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015378	GAG	2	6	35143	35148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015378	GTT	2	6	35196	35201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015378	GCG	2	6	35226	35231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015378	GAG	2	6	35261	35266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015378	GTA	2	6	35332	35337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015378	CGG	3	9	35389	35397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015378	CGC	2	6	35861	35866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015378	TCC	2	6	38437	38442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015378	GCG	2	6	38580	38585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015378	CGG	2	6	38650	38655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015378	CGT	2	6	38666	38671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015378	GAT	2	6	38702	38707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015378	CGA	2	6	38731	38736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015378	GCT	2	6	38955	38960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015378	ACA	2	6	39028	39033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015378	TGG	2	6	40494	40499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015378	TCA	2	6	40555	40560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015378	GTC	2	6	40659	40664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015378	CAG	2	6	41684	41689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015378	CGA	2	6	41743	41748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015378	TGC	2	6	41839	41844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015378	GCA	2	6	41850	41855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015378	CCA	2	6	41934	41939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015378	TCA	2	6	41941	41946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015378	GCA	2	6	42029	42034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015378	GCG	2	6	42051	42056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015378	GTC	2	6	42114	42119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015378	GAA	2	6	42291	42296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015378	GGC	2	6	42345	42350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015378	CGA	2	6	42374	42379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015378	GCC	2	6	42466	42471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015378	GAA	2	6	42478	42483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015378	GTG	2	6	42508	42513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015378	CGT	2	6	42760	42765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015378	GAG	2	6	42787	42792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015378	TGA	3	9	42819	42827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015378	CTG	2	6	42854	42859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015378	CGA	2	6	42904	42909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015378	GTG	2	6	42977	42982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015378	TCT	2	6	43068	43073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015378	CCT	2	6	43696	43701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015378	GAT	2	6	46521	46526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015378	AAG	2	6	46585	46590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015378	CCG	2	6	46604	46609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015378	GAT	2	6	46633	46638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015378	TGG	2	6	46738	46743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015378	GCC	2	6	46748	46753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015378	ACA	2	6	46760	46765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NC_015378	CGA	2	6	118756	118761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_015378	GCT	2	6	118803	118808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_015378	ACT	2	6	119022	119027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_015378	CAG	2	6	119047	119052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_015378	GCA	2	6	119177	119182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_015378	TAC	2	6	119266	119271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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416	NC_015378	AGG	2	6	119368	119373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
417	NC_015378	TGC	2	6	119405	119410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_015378	GAT	2	6	120765	120770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_015378	CCA	2	6	121012	121017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
421	NC_015378	CTG	2	6	121026	121031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_015378	GAC	2	6	121143	121148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_015378	CGT	2	6	121220	121225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_015378	GGC	2	6	121841	121846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_015378	AAT	2	6	121952	121957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_015378	CCG	2	6	122095	122100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_015378	GCG	2	6	122104	122109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_015378	GTC	2	6	122364	122369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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438	NC_015378	TCC	2	6	122474	122479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
439	NC_015378	AGC	2	6	122489	122494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_015378	TCG	2	6	122507	122512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_015378	ACC	2	6	122635	122640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_015378	TCG	2	6	122831	122836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_015378	CCT	2	6	122913	122918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_015378	GCC	2	6	123217	123222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_015378	CTC	2	6	123396	123401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
446	NC_015378	CCG	2	6	123407	123412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
447	NC_015378	GAT	2	6	123430	123435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_015378	CTG	2	6	124740	124745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_015378	CGA	2	6	125110	125115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.