MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacteroides salanitronis DSM 18170 chromosome

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015164	TAAAAA	2	12	73	84	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015164	TGTAAG	2	12	13617	13628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015164	TCTCCT	2	12	28196	28207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015164	AAAGAT	2	12	54520	54531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015164	TATAGG	2	12	83688	83699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015164	GCCTAT	2	12	84661	84672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015164	TTTTTA	2	12	107423	107434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015164	AATATA	2	12	107850	107861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015164	GTTTTG	2	12	109086	109097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015164	CATTAA	2	12	186613	186624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015164	GAAAAA	2	12	240969	240980	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015164	TTCATC	2	12	266715	266726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015164	ACTGCA	2	12	324340	324351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015164	TAGATA	2	12	324399	324410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015164	TGTATA	2	12	418308	418319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015164	TGAATA	2	12	431267	431278	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015164	GTTGAA	2	12	445409	445420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015164	TCATAT	2	12	458797	458808	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015164	CCGGTT	2	12	471762	471773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015164	TTATTT	2	12	506178	506189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015164	TCCTTT	2	12	528671	528682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015164	GCCCGC	2	12	537498	537509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015164	TTCTGT	2	12	544436	544447	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015164	AATATA	2	12	579758	579769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015164	ATGATT	2	12	591263	591274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015164	TACAAT	2	12	612639	612650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015164	TTAATT	2	12	654227	654238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015164	TTGCAT	2	12	686507	686518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015164	TCTTTC	2	12	687893	687904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015164	ATATGG	2	12	698487	698498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015164	ATTGTA	2	12	726184	726195	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015164	AGTTTT	2	12	743810	743821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015164	AAAGAA	2	12	758340	758351	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015164	TTACAA	2	12	773011	773022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015164	AATTAC	2	12	773024	773035	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015164	TGTAAT	2	12	773184	773195	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015164	ATTGTA	2	12	773197	773208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015164	TCATTT	2	12	793517	793528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015164	TGACAA	2	12	827997	828008	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015164	TGACAA	2	12	828028	828039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015164	TAATTA	2	12	834121	834132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015164	CGTTTT	2	12	933714	933725	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015164	TTGTCA	2	12	937635	937646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015164	CGCTCA	2	12	944593	944604	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015164	ATAAAA	2	12	963566	963577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015164	TAAAAT	2	12	991601	991612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015164	TCTGCC	2	12	1000587	1000598	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015164	TGCAAT	2	12	1063331	1063342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015164	TGTTCC	2	12	1063478	1063489	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015164	CAAAAA	2	12	1076214	1076225	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015164	TAGCCT	2	12	1160470	1160481	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015164	TCCTTG	2	12	1185334	1185345	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015164	AGATAG	2	12	1194292	1194303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015164	ACGGAA	2	12	1203970	1203981	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015164	TCATTT	2	12	1246420	1246431	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015164	CTACAA	2	12	1279535	1279546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015164	TACAAA	2	12	1298006	1298017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015164	ACGAGG	2	12	1323870	1323881	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015164	CCTATA	2	12	1326158	1326169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015164	CAAATC	2	12	1335626	1335637	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015164	ATATCT	2	12	1342576	1342587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015164	TATGCT	2	12	1351546	1351557	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015164	TTCATT	2	12	1358249	1358260	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015164	CTTATC	2	12	1360540	1360551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015164	GACAAC	2	12	1414876	1414887	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015164	GATAAT	2	12	1450410	1450421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015164	TTATGT	2	12	1460288	1460299	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015164	TGAAAG	2	12	1470987	1470998	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015164	AAATAT	2	12	1474632	1474643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015164	ATATTT	2	12	1482330	1482341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015164	ACGAGC	2	12	1483801	1483812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015164	TTTTTG	2	12	1486160	1486171	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015164	GTATCA	2	12	1486274	1486285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015164	AAGAAA	2	12	1496560	1496571	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015164	TTCAAA	2	12	1579951	1579962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015164	ACAAAA	2	12	1595105	1595116	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015164	AATAAA	2	12	1618717	1618728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015164	AAAGTA	2	12	1666875	1666886	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015164	TTCCGG	2	12	1727286	1727297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015164	TTTTCT	2	12	1800239	1800250	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015164	ATTTAA	2	12	1834394	1834405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015164	AATACA	2	12	1863906	1863917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015164	CTTTGC	2	12	1869427	1869438	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015164	TTATTT	2	12	1903738	1903749	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015164	AAACAA	2	12	1906781	1906792	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015164	ACTATC	2	12	1958566	1958577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015164	TATGTA	2	12	1966327	1966338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015164	AAAATA	2	12	2018658	2018669	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015164	TGCATC	2	12	2025656	2025667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015164	TTTTAT	2	12	2044240	2044251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015164	GGTTAT	2	12	2061409	2061420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015164	AAATAG	2	12	2070169	2070180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015164	TGGTCT	2	12	2083407	2083418	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015164	CTAAAA	2	12	2093302	2093313	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015164	TCTTTA	2	12	2114992	2115003	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015164	CGAAAG	2	12	2148258	2148269	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015164	CTATAA	2	12	2186555	2186566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015164	ATAACA	2	12	2196194	2196205	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015164	CAAAAA	2	12	2205384	2205395	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015164	AAATAC	2	12	2302948	2302959	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015164	AAATTC	2	12	2317739	2317750	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015164	TTACAA	2	12	2332474	2332485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015164	AATTGT	3	18	2332718	2332735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015164	ACTTTA	2	12	2367559	2367570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015164	GTTGAA	2	12	2373779	2373790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015164	AAAGGC	2	12	2375713	2375724	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015164	ATTTTT	2	12	2384081	2384092	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015164	TAAAAT	2	12	2418643	2418654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015164	GATTTT	2	12	2497690	2497701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015164	CCGCTG	2	12	2519851	2519862	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015164	TTTTTA	2	12	2535694	2535705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015164	ATAAAA	2	12	2557786	2557797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015164	TTCCCG	2	12	2595606	2595617	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015164	ATAAGA	2	12	2615619	2615630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015164	GCTCCG	2	12	2618787	2618798	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015164	TCTTTT	2	12	2621358	2621369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015164	AAGCAG	2	12	2621728	2621739	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015164	AAAATC	2	12	2648474	2648485	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015164	TAAAAA	2	12	2651374	2651385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015164	TTTTTG	2	12	2661539	2661550	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015164	TTACAA	2	12	2671258	2671269	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015164	TTGTAA	2	12	2671419	2671430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015164	TTTTAT	2	12	2732520	2732531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015164	TTTCGA	2	12	2733711	2733722	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015164	ATTTTT	2	12	2737890	2737901	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015164	AGGGGC	2	12	2752198	2752209	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015164	TCTTTG	2	12	2762457	2762468	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.