MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 2

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015137	GCAC	2	8	2722675	2722682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_015137	CTG	2	6	2722685	2722690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_015137	CCA	2	6	2722711	2722716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_015137	GCG	2	6	2722747	2722752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_015137	CAA	2	6	2722761	2722766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_015137	CG	3	6	2722827	2722832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_015137	GGCGC	2	10	2725219	2725228	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8008	NC_015137	GC	3	6	2725247	2725252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8009	NC_015137	CG	3	6	2725732	2725737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_015137	GCAT	2	8	2725751	2725758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_015137	CGG	2	6	2725839	2725844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_015137	CG	4	8	2725868	2725875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_015137	TG	4	8	2725926	2725933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_015137	TCA	2	6	2725959	2725964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_015137	GCC	2	6	2726620	2726625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_015137	GAC	2	6	2728676	2728681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_015137	CGC	2	6	2728700	2728705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_015137	CG	3	6	2728717	2728722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_015137	ATC	2	6	2728723	2728728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_015137	GCG	3	9	2728734	2728742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_015137	TGCA	2	8	2728780	2728787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_015137	AAGCG	2	10	2728808	2728817	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8023	NC_015137	CCG	2	6	2728829	2728834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_015137	CGG	2	6	2728842	2728847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_015137	GTC	2	6	2728901	2728906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_015137	CGT	2	6	2728914	2728919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_015137	TCCG	2	8	2728941	2728948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_015137	GC	3	6	2728967	2728972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_015137	TTGCG	2	10	2729001	2729010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8030	NC_015137	CCG	2	6	2729017	2729022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_015137	GCC	2	6	2729040	2729045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_015137	GCCCG	2	10	2729716	2729725	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8033	NC_015137	GC	3	6	2729752	2729757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_015137	CTGC	2	8	2729769	2729776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_015137	CG	3	6	2729777	2729782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8036	NC_015137	CGC	2	6	2729786	2729791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_015137	CTGC	2	8	2733419	2733426	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8038	NC_015137	GCC	2	6	2733447	2733452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_015137	GAT	2	6	2734579	2734584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_015137	CGG	2	6	2734589	2734594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_015137	ATTCA	2	10	2734614	2734623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8042	NC_015137	CAA	2	6	2734631	2734636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_015137	TG	3	6	2734801	2734806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_015137	CCA	2	6	2734814	2734819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_015137	A	6	6	2734905	2734910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_015137	CGG	2	6	2734915	2734920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_015137	CTG	2	6	2734963	2734968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_015137	CGCC	2	8	2735124	2735131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8049	NC_015137	GGA	2	6	2735158	2735163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_015137	CGGCG	2	10	2736192	2736201	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8051	NC_015137	CGA	2	6	2736203	2736208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_015137	CGC	2	6	2736215	2736220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_015137	ACGCG	2	10	2738149	2738158	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8054	NC_015137	CAA	2	6	2738197	2738202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_015137	CG	3	6	2738214	2738219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8056	NC_015137	GAG	2	6	2738225	2738230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_015137	ATGG	2	8	2739105	2739112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_015137	CGA	2	6	2744175	2744180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_015137	CGC	2	6	2744181	2744186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_015137	GCC	2	6	2744190	2744195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_015137	CTG	2	6	2744791	2744796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_015137	CGA	2	6	2744807	2744812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_015137	GCG	2	6	2744849	2744854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_015137	AGCG	2	8	2744909	2744916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8065	NC_015137	GC	3	6	2744930	2744935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8066	NC_015137	GGC	3	9	2744960	2744968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_015137	CG	3	6	2744989	2744994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_015137	GTCGC	2	10	2745023	2745032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8069	NC_015137	CG	3	6	2745138	2745143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_015137	CGA	2	6	2745158	2745163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_015137	GAC	2	6	2745174	2745179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_015137	GC	3	6	2749129	2749134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_015137	CGC	2	6	2749180	2749185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_015137	CTG	2	6	2751192	2751197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_015137	GA	3	6	2751210	2751215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_015137	GC	3	6	2752394	2752399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_015137	TG	3	6	2752430	2752435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_015137	CGG	3	9	2752448	2752456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_015137	GCC	2	6	2752480	2752485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_015137	GC	3	6	2752486	2752491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_015137	CAT	2	6	2752494	2752499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_015137	GC	3	6	2754103	2754108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8083	NC_015137	GCG	3	9	2754145	2754153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_015137	GCTG	2	8	2754154	2754161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_015137	CA	3	6	2754163	2754168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8086	NC_015137	GCA	2	6	2754171	2754176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_015137	TCT	2	6	2754179	2754184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_015137	GAG	2	6	2754197	2754202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_015137	CG	3	6	2754382	2754387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_015137	GCC	2	6	2754449	2754454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_015137	CGGC	2	8	2754480	2754487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_015137	CGC	2	6	2754496	2754501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8094	NC_015137	GC	3	6	2755034	2755039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8095	NC_015137	GCC	2	6	2755049	2755054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_015137	CGT	2	6	2755619	2755624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_015137	GTGC	2	8	2755662	2755669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8098	NC_015137	GC	3	6	2755721	2755726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_015137	CG	4	8	2755752	2755759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_015137	CGC	2	6	2756568	2756573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8101	NC_015137	GCGCG	2	10	2756584	2756593	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8102	NC_015137	CGT	2	6	2760142	2760147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_015137	GAC	2	6	2760171	2760176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_015137	CGG	2	6	2760180	2760185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_015137	AGG	2	6	2760216	2760221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8108	NC_015137	GCC	2	6	2761452	2761457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_015137	GGA	2	6	2761526	2761531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_015137	CG	3	6	2763059	2763064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_015137	GC	3	6	2763116	2763121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_015137	G	6	6	2763160	2763165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_015137	GCT	2	6	2763207	2763212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_015137	CCT	2	6	2763232	2763237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_015137	GTTC	2	8	2763281	2763288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8116	NC_015137	GC	3	6	2763290	2763295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8117	NC_015137	ACCGC	2	10	2764356	2764365	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8118	NC_015137	CCGCG	2	10	2764368	2764377	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8119	NC_015137	GC	3	6	2764473	2764478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_015137	GTGC	2	8	2764491	2764498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8121	NC_015137	GTT	2	6	2764504	2764509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_015137	CG	3	6	2764513	2764518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_015137	GCC	2	6	2764521	2764526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8124	NC_015137	CCGC	2	8	2764527	2764534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8125	NC_015137	CAGA	2	8	2764544	2764551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8126	NC_015137	TCG	2	6	2766734	2766739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_015137	GCC	2	6	2767076	2767081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8128	NC_015137	CGC	2	6	2767082	2767087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_015137	CGT	2	6	2767114	2767119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_015137	GGC	2	6	2767232	2767237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_015137	CG	5	10	2767245	2767254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8132	NC_015137	CCG	2	6	2767290	2767295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.